Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X3D9

Protein Details
Accession A0A4T0X3D9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
571-596SSNYNHQNFNQKPKKQPFKLVNGQREHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MQGKPYNNKYHSSNHNHLEGSNQQNLRLSPPEYEAATKHMKDRFLYTLASSIGCKTIVTTDSDVIEGILYSVSEFIDTIPSLIIKFPTNKNKIYDNELLTIPHSAIQMVSCENVDLSPKINQSSKQEKPSLASTLAASIPASQPQTETLASSIKSVTAKVTKTSTPTPTSTPTPTSTPTPTPTPPTQQQQELTSTSINNTTATTSTPSIASTVKKSFKIDTDISANSGTEKRELKRWTPDEKKPLSNLDGGLELDTSTLGNWDQFEVNKAKFGVDAQFDENEYTVKLDTSNPEFEERLKFGKAVEMEILSKSSNGNLHIAEERGEIVDLENIDEEDKYSGVLRDNKESERKIMLMLKTDSKTDLKLSNDENLAIADDSKLKFKAKQKSKQQLDVSTDKSSINDTSISSKLSSITPASASLPEKPKISDSNKVPVKSEKDSNINSASSSLSSSSTTTTTTTTTTTKSNTTPATSPEIKKVNVSKVNSTSSNVASASTNNNQKSQTKSKFSVAQKMAPEFSPQNLNHTQIHQQHQPRQNMVHYQMQDPNYRPQTRNNQPQHQFNHQYQPRNNSSNYNHQNFNQKPKKQPFKLVNGQRESPITESILNGKFNILHTARKEFLAKNNSDSSKSNKIIPMVPSFVAAPAWPETSSLSYTEKFTEENPIQPVNMGMPPQMYMPQNNFQPQVYPMQMPTVMVSGYMMVPGGFMNNMMQPGFPNNGYNNGYGYNNGYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.63
3 0.59
4 0.54
5 0.51
6 0.5
7 0.46
8 0.46
9 0.42
10 0.38
11 0.42
12 0.42
13 0.41
14 0.37
15 0.33
16 0.27
17 0.3
18 0.32
19 0.29
20 0.31
21 0.27
22 0.28
23 0.34
24 0.33
25 0.36
26 0.37
27 0.39
28 0.38
29 0.42
30 0.42
31 0.37
32 0.37
33 0.32
34 0.32
35 0.29
36 0.28
37 0.23
38 0.19
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.12
43 0.15
44 0.16
45 0.2
46 0.21
47 0.21
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.17
52 0.15
53 0.1
54 0.08
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.2
73 0.28
74 0.38
75 0.43
76 0.47
77 0.5
78 0.55
79 0.55
80 0.57
81 0.55
82 0.48
83 0.46
84 0.42
85 0.39
86 0.32
87 0.3
88 0.23
89 0.18
90 0.14
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.11
103 0.12
104 0.16
105 0.18
106 0.21
107 0.25
108 0.28
109 0.34
110 0.43
111 0.48
112 0.52
113 0.54
114 0.52
115 0.53
116 0.53
117 0.48
118 0.4
119 0.33
120 0.26
121 0.23
122 0.22
123 0.19
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.18
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.27
148 0.26
149 0.31
150 0.36
151 0.37
152 0.36
153 0.37
154 0.38
155 0.39
156 0.41
157 0.39
158 0.37
159 0.34
160 0.33
161 0.33
162 0.34
163 0.34
164 0.33
165 0.33
166 0.35
167 0.34
168 0.38
169 0.39
170 0.42
171 0.44
172 0.48
173 0.49
174 0.48
175 0.48
176 0.45
177 0.44
178 0.39
179 0.34
180 0.28
181 0.24
182 0.2
183 0.2
184 0.17
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.15
198 0.17
199 0.24
200 0.27
201 0.29
202 0.31
203 0.32
204 0.33
205 0.38
206 0.34
207 0.31
208 0.31
209 0.29
210 0.29
211 0.26
212 0.23
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.16
217 0.2
218 0.2
219 0.27
220 0.32
221 0.35
222 0.43
223 0.49
224 0.54
225 0.59
226 0.65
227 0.67
228 0.69
229 0.68
230 0.6
231 0.58
232 0.51
233 0.44
234 0.37
235 0.28
236 0.24
237 0.2
238 0.17
239 0.12
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.11
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.14
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.08
275 0.11
276 0.14
277 0.16
278 0.16
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.22
283 0.2
284 0.19
285 0.18
286 0.17
287 0.15
288 0.19
289 0.17
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.1
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.1
328 0.15
329 0.16
330 0.21
331 0.23
332 0.26
333 0.31
334 0.31
335 0.29
336 0.26
337 0.25
338 0.22
339 0.24
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.23
347 0.19
348 0.19
349 0.17
350 0.19
351 0.16
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.2
356 0.19
357 0.17
358 0.13
359 0.12
360 0.09
361 0.08
362 0.05
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.17
369 0.24
370 0.34
371 0.42
372 0.51
373 0.6
374 0.69
375 0.73
376 0.76
377 0.73
378 0.69
379 0.64
380 0.6
381 0.53
382 0.43
383 0.39
384 0.31
385 0.27
386 0.22
387 0.17
388 0.13
389 0.11
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.14
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.13
406 0.16
407 0.2
408 0.21
409 0.21
410 0.21
411 0.23
412 0.28
413 0.31
414 0.34
415 0.32
416 0.4
417 0.44
418 0.44
419 0.44
420 0.42
421 0.43
422 0.39
423 0.4
424 0.35
425 0.36
426 0.37
427 0.39
428 0.36
429 0.31
430 0.27
431 0.23
432 0.19
433 0.13
434 0.13
435 0.1
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.16
451 0.18
452 0.18
453 0.22
454 0.21
455 0.23
456 0.23
457 0.23
458 0.29
459 0.31
460 0.31
461 0.33
462 0.36
463 0.33
464 0.36
465 0.38
466 0.4
467 0.41
468 0.43
469 0.41
470 0.41
471 0.45
472 0.42
473 0.39
474 0.33
475 0.27
476 0.26
477 0.2
478 0.17
479 0.14
480 0.14
481 0.17
482 0.2
483 0.26
484 0.25
485 0.28
486 0.3
487 0.33
488 0.39
489 0.45
490 0.47
491 0.47
492 0.49
493 0.52
494 0.58
495 0.58
496 0.6
497 0.53
498 0.51
499 0.47
500 0.47
501 0.43
502 0.35
503 0.36
504 0.27
505 0.25
506 0.28
507 0.24
508 0.28
509 0.29
510 0.32
511 0.29
512 0.31
513 0.37
514 0.35
515 0.41
516 0.42
517 0.46
518 0.52
519 0.59
520 0.61
521 0.57
522 0.54
523 0.52
524 0.51
525 0.48
526 0.46
527 0.4
528 0.39
529 0.41
530 0.41
531 0.42
532 0.38
533 0.43
534 0.44
535 0.48
536 0.46
537 0.49
538 0.56
539 0.61
540 0.69
541 0.69
542 0.71
543 0.71
544 0.78
545 0.76
546 0.75
547 0.71
548 0.64
549 0.66
550 0.61
551 0.65
552 0.61
553 0.63
554 0.61
555 0.6
556 0.57
557 0.55
558 0.54
559 0.56
560 0.6
561 0.56
562 0.52
563 0.5
564 0.59
565 0.55
566 0.61
567 0.6
568 0.58
569 0.64
570 0.72
571 0.8
572 0.75
573 0.8
574 0.78
575 0.78
576 0.82
577 0.81
578 0.8
579 0.74
580 0.7
581 0.63
582 0.56
583 0.48
584 0.4
585 0.32
586 0.25
587 0.2
588 0.19
589 0.23
590 0.25
591 0.24
592 0.21
593 0.2
594 0.2
595 0.2
596 0.27
597 0.22
598 0.24
599 0.27
600 0.33
601 0.33
602 0.34
603 0.38
604 0.34
605 0.41
606 0.44
607 0.42
608 0.42
609 0.49
610 0.49
611 0.48
612 0.47
613 0.45
614 0.46
615 0.46
616 0.46
617 0.41
618 0.42
619 0.43
620 0.45
621 0.43
622 0.37
623 0.35
624 0.31
625 0.28
626 0.25
627 0.2
628 0.16
629 0.13
630 0.12
631 0.14
632 0.13
633 0.13
634 0.14
635 0.17
636 0.18
637 0.18
638 0.2
639 0.19
640 0.21
641 0.23
642 0.22
643 0.2
644 0.2
645 0.27
646 0.25
647 0.29
648 0.31
649 0.3
650 0.29
651 0.29
652 0.28
653 0.22
654 0.22
655 0.18
656 0.15
657 0.14
658 0.14
659 0.15
660 0.19
661 0.19
662 0.21
663 0.26
664 0.31
665 0.36
666 0.4
667 0.4
668 0.36
669 0.37
670 0.34
671 0.36
672 0.33
673 0.29
674 0.25
675 0.28
676 0.28
677 0.25
678 0.24
679 0.19
680 0.15
681 0.13
682 0.12
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.08
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.08
694 0.1
695 0.12
696 0.12
697 0.12
698 0.12
699 0.16
700 0.2
701 0.19
702 0.21
703 0.21
704 0.28
705 0.31
706 0.31
707 0.28
708 0.27
709 0.27
710 0.24