Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4T0X3D9

Protein Details
Accession A0A4T0X3D9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
571-596SSNYNHQNFNQKPKKQPFKLVNGQREHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MQGKPYNNKYHSSNHNHLEGSNQQNLRLSPPEYEAATKHMKDRFLYTLASSIGCKTIVTTDSDVIEGILYSVSEFIDTIPSLIIKFPTNKNKIYDNELLTIPHSAIQMVSCENVDLSPKINQSSKQEKPSLASTLAASIPASQPQTETLASSIKSVTAKVTKTSTPTPTSTPTPTSTPTPTPTPPTQQQQELTSTSINNTTATTSTPSIASTVKKSFKIDTDISANSGTEKRELKRWTPDEKKPLSNLDGGLELDTSTLGNWDQFEVNKAKFGVDAQFDENEYTVKLDTSNPEFEERLKFGKAVEMEILSKSSNGNLHIAEERGEIVDLENIDEEDKYSGVLRDNKESERKIMLMLKTDSKTDLKLSNDENLAIADDSKLKFKAKQKSKQQLDVSTDKSSINDTSISSKLSSITPASASLPEKPKISDSNKVPVKSEKDSNINSASSSLSSSSTTTTTTTTTTTKSNTTPATSPEIKKVNVSKVNSTSSNVASASTNNNQKSQTKSKFSVAQKMAPEFSPQNLNHTQIHQQHQPRQNMVHYQMQDPNYRPQTRNNQPQHQFNHQYQPRNNSSNYNHQNFNQKPKKQPFKLVNGQRESPITESILNGKFNILHTARKEFLAKNNSDSSKSNKIIPMVPSFVAAPAWPETSSLSYTEKFTEENPIQPVNMGMPPQMYMPQNNFQPQVYPMQMPTVMVSGYMMVPGGFMNNMMQPGFPNNGYNNGYGYNNGYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.63
3 0.59
4 0.54
5 0.51
6 0.5
7 0.46
8 0.46
9 0.42
10 0.38
11 0.42
12 0.42
13 0.41
14 0.37
15 0.33
16 0.27
17 0.3
18 0.32
19 0.29
20 0.31
21 0.27
22 0.28
23 0.34
24 0.33
25 0.36
26 0.37
27 0.39
28 0.38
29 0.42
30 0.42
31 0.37
32 0.37
33 0.32
34 0.32
35 0.29
36 0.28
37 0.23
38 0.19
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.12
43 0.15
44 0.16
45 0.2
46 0.21
47 0.21
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.17
52 0.15
53 0.1
54 0.08
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.2
73 0.28
74 0.38
75 0.43
76 0.47
77 0.5
78 0.55
79 0.55
80 0.57
81 0.55
82 0.48
83 0.46
84 0.42
85 0.39
86 0.32
87 0.3
88 0.23
89 0.18
90 0.14
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.11
103 0.12
104 0.16
105 0.18
106 0.21
107 0.25
108 0.28
109 0.34
110 0.43
111 0.48
112 0.52
113 0.54
114 0.52
115 0.53
116 0.53
117 0.48
118 0.4
119 0.33
120 0.26
121 0.23
122 0.22
123 0.19
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.18
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.27
148 0.26
149 0.31
150 0.36
151 0.37
152 0.36
153 0.37
154 0.38
155 0.39
156 0.41
157 0.39
158 0.37
159 0.34
160 0.33
161 0.33
162 0.34
163 0.34
164 0.33
165 0.33
166 0.35
167 0.34
168 0.38
169 0.39
170 0.42
171 0.44
172 0.48
173 0.49
174 0.48
175 0.48
176 0.45
177 0.44
178 0.39
179 0.34
180 0.28
181 0.24
182 0.2
183 0.2
184 0.17
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.15
198 0.17
199 0.24
200 0.27
201 0.29
202 0.31
203 0.32
204 0.33
205 0.38
206 0.34
207 0.31
208 0.31
209 0.29
210 0.29
211 0.26
212 0.23
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.16
217 0.2
218 0.2
219 0.27
220 0.32
221 0.35
222 0.43
223 0.49
224 0.54
225 0.59
226 0.65
227 0.67
228 0.69
229 0.68
230 0.6
231 0.58
232 0.51
233 0.44
234 0.37
235 0.28
236 0.24
237 0.2
238 0.17
239 0.12
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.11
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.14
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.08
275 0.11
276 0.14
277 0.16
278 0.16
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.22
283 0.2
284 0.19
285 0.18
286 0.17
287 0.15
288 0.19
289 0.17
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.1
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.1
328 0.15
329 0.16
330 0.21
331 0.23
332 0.26
333 0.31
334 0.31
335 0.29
336 0.26
337 0.25
338 0.22
339 0.24
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.23
347 0.19
348 0.19
349 0.17
350 0.19
351 0.16
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.2
356 0.19
357 0.17
358 0.13
359 0.12
360 0.09
361 0.08
362 0.05
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.17
369 0.24
370 0.34
371 0.42
372 0.51
373 0.6
374 0.69
375 0.73
376 0.76
377 0.73
378 0.69
379 0.64
380 0.6
381 0.53
382 0.43
383 0.39
384 0.31
385 0.27
386 0.22
387 0.17
388 0.13
389 0.11
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.14
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.13
406 0.16
407 0.2
408 0.21
409 0.21
410 0.21
411 0.23
412 0.28
413 0.31
414 0.34
415 0.32
416 0.4
417 0.44
418 0.44
419 0.44
420 0.42
421 0.43
422 0.39
423 0.4
424 0.35
425 0.36
426 0.37
427 0.39
428 0.36
429 0.31
430 0.27
431 0.23
432 0.19
433 0.13
434 0.13
435 0.1
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.16
451 0.18
452 0.18
453 0.22
454 0.21
455 0.23
456 0.23
457 0.23
458 0.29
459 0.31
460 0.31
461 0.33
462 0.36
463 0.33
464 0.36
465 0.38
466 0.4
467 0.41
468 0.43
469 0.41
470 0.41
471 0.45
472 0.42
473 0.39
474 0.33
475 0.27
476 0.26
477 0.2
478 0.17
479 0.14
480 0.14
481 0.17
482 0.2
483 0.26
484 0.25
485 0.28
486 0.3
487 0.33
488 0.39
489 0.45
490 0.47
491 0.47
492 0.49
493 0.52
494 0.58
495 0.58
496 0.6
497 0.53
498 0.51
499 0.47
500 0.47
501 0.43
502 0.35
503 0.36
504 0.27
505 0.25
506 0.28
507 0.24
508 0.28
509 0.29
510 0.32
511 0.29
512 0.31
513 0.37
514 0.35
515 0.41
516 0.42
517 0.46
518 0.52
519 0.59
520 0.61
521 0.57
522 0.54
523 0.52
524 0.51
525 0.48
526 0.46
527 0.4
528 0.39
529 0.41
530 0.41
531 0.42
532 0.38
533 0.43
534 0.44
535 0.48
536 0.46
537 0.49
538 0.56
539 0.61
540 0.69
541 0.69
542 0.71
543 0.71
544 0.78
545 0.76
546 0.75
547 0.71
548 0.64
549 0.66
550 0.61
551 0.65
552 0.61
553 0.63
554 0.61
555 0.6
556 0.57
557 0.55
558 0.54
559 0.56
560 0.6
561 0.56
562 0.52
563 0.5
564 0.59
565 0.55
566 0.61
567 0.6
568 0.58
569 0.64
570 0.72
571 0.8
572 0.75
573 0.8
574 0.78
575 0.78
576 0.82
577 0.81
578 0.8
579 0.74
580 0.7
581 0.63
582 0.56
583 0.48
584 0.4
585 0.32
586 0.25
587 0.2
588 0.19
589 0.23
590 0.25
591 0.24
592 0.21
593 0.2
594 0.2
595 0.2
596 0.27
597 0.22
598 0.24
599 0.27
600 0.33
601 0.33
602 0.34
603 0.38
604 0.34
605 0.41
606 0.44
607 0.42
608 0.42
609 0.49
610 0.49
611 0.48
612 0.47
613 0.45
614 0.46
615 0.46
616 0.46
617 0.41
618 0.42
619 0.43
620 0.45
621 0.43
622 0.37
623 0.35
624 0.31
625 0.28
626 0.25
627 0.2
628 0.16
629 0.13
630 0.12
631 0.14
632 0.13
633 0.13
634 0.14
635 0.17
636 0.18
637 0.18
638 0.2
639 0.19
640 0.21
641 0.23
642 0.22
643 0.2
644 0.2
645 0.27
646 0.25
647 0.29
648 0.31
649 0.3
650 0.29
651 0.29
652 0.28
653 0.22
654 0.22
655 0.18
656 0.15
657 0.14
658 0.14
659 0.15
660 0.19
661 0.19
662 0.21
663 0.26
664 0.31
665 0.36
666 0.4
667 0.4
668 0.36
669 0.37
670 0.34
671 0.36
672 0.33
673 0.29
674 0.25
675 0.28
676 0.28
677 0.25
678 0.24
679 0.19
680 0.15
681 0.13
682 0.12
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.08
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.08
694 0.1
695 0.12
696 0.12
697 0.12
698 0.12
699 0.16
700 0.2
701 0.19
702 0.21
703 0.21
704 0.28
705 0.31
706 0.31
707 0.28
708 0.27
709 0.27
710 0.24