Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X2H2

Protein Details
Accession A0A4T0X2H2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-57AGVPKASTSKKKSTRNVQTDNHEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-205SKHKEREEKRMRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MPEQQKSTPSGSTPVPGNTNSSQGTTPVGNINTSAGVPKASTSKKKSTRNVQTDNHEVLSDAVAASGLNIRAEEEAMVQGLSISKKQIEQNTFLKPHQLNWFAQKTLEEQGIKSVQIDGEVGNLISASCEDYMTSIVTDLVIMMRHRRHLSDKATKEIMSKGSNKSKISKMLTSSGVNSKSELSRALRELASKHKEREEKRMRRRTMLGLDEEKPEETLLQDHKQTNLTASMMMSGSKKQKYSWMQSGSTTSAINSRGDNGIRYREAREEPQIVMRDLIAALENRRIGVSNTLLKAYARLKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.28
4 0.32
5 0.29
6 0.33
7 0.3
8 0.29
9 0.26
10 0.23
11 0.25
12 0.2
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.18
27 0.24
28 0.33
29 0.39
30 0.49
31 0.58
32 0.67
33 0.75
34 0.78
35 0.82
36 0.84
37 0.86
38 0.82
39 0.79
40 0.77
41 0.7
42 0.6
43 0.49
44 0.39
45 0.31
46 0.24
47 0.18
48 0.1
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.18
74 0.25
75 0.27
76 0.31
77 0.36
78 0.42
79 0.45
80 0.41
81 0.45
82 0.38
83 0.39
84 0.41
85 0.4
86 0.34
87 0.38
88 0.41
89 0.34
90 0.34
91 0.3
92 0.25
93 0.23
94 0.25
95 0.19
96 0.15
97 0.19
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.15
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.08
131 0.1
132 0.13
133 0.14
134 0.16
135 0.2
136 0.26
137 0.34
138 0.4
139 0.41
140 0.42
141 0.43
142 0.41
143 0.38
144 0.34
145 0.29
146 0.23
147 0.25
148 0.26
149 0.32
150 0.37
151 0.37
152 0.39
153 0.39
154 0.42
155 0.43
156 0.4
157 0.35
158 0.34
159 0.35
160 0.32
161 0.31
162 0.29
163 0.27
164 0.24
165 0.22
166 0.2
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.2
174 0.19
175 0.19
176 0.21
177 0.27
178 0.31
179 0.32
180 0.33
181 0.38
182 0.45
183 0.47
184 0.56
185 0.58
186 0.62
187 0.7
188 0.77
189 0.74
190 0.72
191 0.73
192 0.69
193 0.66
194 0.59
195 0.54
196 0.48
197 0.47
198 0.43
199 0.4
200 0.33
201 0.25
202 0.2
203 0.15
204 0.11
205 0.13
206 0.15
207 0.17
208 0.22
209 0.23
210 0.25
211 0.27
212 0.26
213 0.24
214 0.22
215 0.19
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.14
223 0.21
224 0.24
225 0.25
226 0.24
227 0.33
228 0.4
229 0.48
230 0.52
231 0.51
232 0.5
233 0.51
234 0.54
235 0.47
236 0.4
237 0.32
238 0.23
239 0.21
240 0.21
241 0.2
242 0.16
243 0.16
244 0.19
245 0.2
246 0.23
247 0.22
248 0.27
249 0.29
250 0.31
251 0.32
252 0.34
253 0.37
254 0.39
255 0.43
256 0.4
257 0.38
258 0.43
259 0.43
260 0.38
261 0.34
262 0.28
263 0.23
264 0.19
265 0.18
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.18
273 0.18
274 0.18
275 0.22
276 0.26
277 0.28
278 0.3
279 0.3
280 0.31
281 0.29
282 0.33