Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X3L9

Protein Details
Accession A0A4T0X3L9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-53QTSKTNNAKKPRNEFNKQAGQIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.833, cyto 7.5, cyto_mito 5.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR045242  Syntaxin  
IPR021538  Syntaxin-5_N  
IPR006012  Syntaxin/epimorphin_CS  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PF11416  Syntaxin-5_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00914  SYNTAXIN  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15844  SNARE_syntaxin5  
Amino Acid Sequences MEIHAIKSVQDRSFEFQQAVNTFAKQNHTIGQTSKTNNAKKPRNEFNKQAGQIAKEIVKVTGSLNRLAQLAKKKQLFGDKPTDIVELTYIIKQDIFRIEKELKALKSIQMGNSGKDDTQVETYSKNVVQLLNTRTKNISENFKEVLQERQKSEMLQRTRQEQLLAAVKSTIGDNHDANNIPYAVRSSNNEPSLGTDNPFLASMQLQESNQKEQQNSPYGDTMLSLPDQNQQLLLLEEQNNQYLLERSSAVDAIESTINEVGGLFQQLATMVQEQGEVIQRIDENVEDVSLNITGAQRELMKFYNSVSSNRWLMLKIFGILIVFFLLWVLVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.34
4 0.38
5 0.35
6 0.36
7 0.3
8 0.26
9 0.27
10 0.28
11 0.31
12 0.27
13 0.28
14 0.3
15 0.31
16 0.32
17 0.32
18 0.36
19 0.37
20 0.38
21 0.44
22 0.48
23 0.52
24 0.56
25 0.64
26 0.67
27 0.7
28 0.75
29 0.78
30 0.79
31 0.8
32 0.8
33 0.79
34 0.8
35 0.72
36 0.69
37 0.62
38 0.53
39 0.48
40 0.43
41 0.35
42 0.27
43 0.26
44 0.2
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.2
55 0.23
56 0.28
57 0.33
58 0.39
59 0.41
60 0.42
61 0.45
62 0.55
63 0.54
64 0.51
65 0.53
66 0.46
67 0.44
68 0.44
69 0.41
70 0.3
71 0.26
72 0.2
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.13
81 0.18
82 0.19
83 0.18
84 0.24
85 0.26
86 0.26
87 0.3
88 0.33
89 0.26
90 0.27
91 0.28
92 0.24
93 0.28
94 0.29
95 0.26
96 0.3
97 0.3
98 0.28
99 0.29
100 0.28
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.13
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.18
117 0.22
118 0.28
119 0.28
120 0.28
121 0.28
122 0.29
123 0.31
124 0.28
125 0.33
126 0.27
127 0.3
128 0.3
129 0.3
130 0.3
131 0.27
132 0.33
133 0.3
134 0.31
135 0.28
136 0.31
137 0.31
138 0.3
139 0.35
140 0.34
141 0.32
142 0.35
143 0.36
144 0.36
145 0.37
146 0.37
147 0.32
148 0.25
149 0.23
150 0.23
151 0.21
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.11
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.15
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.23
179 0.26
180 0.24
181 0.2
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.11
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.13
194 0.15
195 0.2
196 0.24
197 0.25
198 0.25
199 0.27
200 0.33
201 0.36
202 0.35
203 0.33
204 0.3
205 0.28
206 0.27
207 0.24
208 0.18
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.12
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.12
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.16
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.2
290 0.27
291 0.26
292 0.28
293 0.29
294 0.32
295 0.32
296 0.33
297 0.33
298 0.26
299 0.26
300 0.27
301 0.25
302 0.21
303 0.19
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.14
308 0.1
309 0.08
310 0.06
311 0.06