Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X3I0

Protein Details
Accession A0A4T0X3I0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-147ITLICRKKIKNGKTKIRRGYAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-140KIKNGKTK
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 11.833, nucl 7.5, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MYVFQPLNRIQIFKETVPAQVRSDSWTLNYEGFSPNILEELKRHAKEINPSEQSRQNSNKEREQAVATRQAKQEQLLLYEQKKIQLLENKDLGDAYCTVFVAHIPVSATEEDLRKVFEKIGPVVNITLICRKKIKNGKTKIRRGYAFVVFGNRNDAKKAVSYASTIGGSLKCYLSCALIAWFVYYIKTECPLNKPLPFDTEGVNEICLHSHKAYGYVRPYSEPIVHQVVEYYNASPIKPYVEEYYPVVEGQALNVYNFVSEKVDKLVERLNDNSLSNEKKIVIPTKYDAFTKKVGESATTPDDDLIEATPEPTGVVSNYVPETEDEPEIIDPTAIPKATDSTKSDDDDAPVEDSKLEKLVHEAAEVVKQVAAEEIIEAAEAIGERL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.32
3 0.37
4 0.4
5 0.42
6 0.35
7 0.34
8 0.34
9 0.32
10 0.34
11 0.28
12 0.25
13 0.26
14 0.25
15 0.24
16 0.24
17 0.21
18 0.2
19 0.2
20 0.18
21 0.16
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.13
26 0.13
27 0.22
28 0.3
29 0.3
30 0.31
31 0.32
32 0.36
33 0.45
34 0.52
35 0.52
36 0.5
37 0.52
38 0.57
39 0.6
40 0.59
41 0.58
42 0.58
43 0.58
44 0.6
45 0.65
46 0.67
47 0.66
48 0.65
49 0.59
50 0.56
51 0.51
52 0.46
53 0.5
54 0.44
55 0.44
56 0.45
57 0.46
58 0.42
59 0.39
60 0.38
61 0.29
62 0.3
63 0.29
64 0.32
65 0.3
66 0.34
67 0.34
68 0.33
69 0.33
70 0.31
71 0.32
72 0.34
73 0.38
74 0.39
75 0.42
76 0.39
77 0.37
78 0.36
79 0.3
80 0.23
81 0.19
82 0.13
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.15
101 0.13
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.19
107 0.23
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.16
114 0.21
115 0.18
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.33
120 0.42
121 0.5
122 0.53
123 0.62
124 0.71
125 0.77
126 0.86
127 0.84
128 0.82
129 0.74
130 0.69
131 0.64
132 0.57
133 0.49
134 0.4
135 0.37
136 0.3
137 0.28
138 0.3
139 0.26
140 0.23
141 0.21
142 0.21
143 0.17
144 0.17
145 0.19
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.14
178 0.19
179 0.21
180 0.24
181 0.25
182 0.25
183 0.27
184 0.27
185 0.24
186 0.2
187 0.18
188 0.17
189 0.15
190 0.15
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.14
200 0.15
201 0.19
202 0.22
203 0.22
204 0.23
205 0.23
206 0.24
207 0.21
208 0.21
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.15
217 0.15
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.17
233 0.16
234 0.14
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.15
253 0.19
254 0.19
255 0.22
256 0.23
257 0.24
258 0.24
259 0.24
260 0.25
261 0.25
262 0.25
263 0.23
264 0.23
265 0.21
266 0.21
267 0.25
268 0.29
269 0.27
270 0.27
271 0.3
272 0.33
273 0.34
274 0.35
275 0.33
276 0.3
277 0.32
278 0.32
279 0.29
280 0.27
281 0.25
282 0.25
283 0.23
284 0.25
285 0.25
286 0.23
287 0.22
288 0.19
289 0.19
290 0.17
291 0.16
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.05
302 0.08
303 0.08
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.15
310 0.14
311 0.15
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.11
318 0.08
319 0.1
320 0.14
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.16
325 0.19
326 0.25
327 0.25
328 0.29
329 0.33
330 0.35
331 0.38
332 0.36
333 0.34
334 0.31
335 0.29
336 0.26
337 0.22
338 0.2
339 0.18
340 0.17
341 0.16
342 0.18
343 0.16
344 0.13
345 0.17
346 0.21
347 0.21
348 0.21
349 0.21
350 0.19
351 0.22
352 0.22
353 0.19
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.05