Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X139

Protein Details
Accession A0A4T0X139    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-52KIDKPITDAQKERKRQKNKARREKRRQAKSFDKKDDVNBasic
88-116ASNPTNRKKGASKKRKRALKNKTPQVPERHydrophilic
274-304DYIIELKQKKKSERRKQKKANAKVANLKNDKHydrophilic
311-345KNPKVNDTALKKTRKKKPKKKVKSDDKQAKPNSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-44KERKRQKNKARREKRRQAKS
92-109TNRKKGASKKRKRALKNK
280-359KQKKKSERRKQKKANAKVANLKNDKTDKPNEKNPKVNDTALKKTRKKKPKKKVKSDDKQAKPNSSSSDERKPIKFTLKKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSQERPERSDTSVEKIDKPITDAQKERKRQKNKARREKRRQAKSFDKKDDVNNNDTSDAKPTTPDTRSYTKTTNILENGKKGDSKSTASNPTNRKKGASKKRKRALKNKTPQVPERVTFKLTVRRLPPNLKEDSFWNVVYTNFPDFKELVHSYYYVNGYLPQTQFENPVFSRCYIDCIDEQSMMIVGRGIKTLTFTNDVEGQTKKDETGNSEVFEEEMEVYVPSIEKSFYQKMPQGDIEPFPENGSITKNPHYKLFVELLKEEGRREMPRNIFDYIIELKQKKKSERRKQKKANAKVANLKNDKTDKPNEKNPKVNDTALKKTRKKKPKKKVKSDDKQAKPNSSSSDERKPIKFTLKKKSVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.48
4 0.4
5 0.41
6 0.43
7 0.42
8 0.47
9 0.51
10 0.57
11 0.63
12 0.72
13 0.78
14 0.79
15 0.82
16 0.86
17 0.9
18 0.9
19 0.91
20 0.93
21 0.94
22 0.95
23 0.96
24 0.96
25 0.96
26 0.96
27 0.93
28 0.91
29 0.91
30 0.91
31 0.9
32 0.89
33 0.84
34 0.77
35 0.78
36 0.78
37 0.72
38 0.66
39 0.59
40 0.52
41 0.47
42 0.44
43 0.36
44 0.31
45 0.27
46 0.22
47 0.2
48 0.22
49 0.27
50 0.28
51 0.32
52 0.33
53 0.38
54 0.42
55 0.46
56 0.46
57 0.44
58 0.47
59 0.45
60 0.45
61 0.43
62 0.47
63 0.44
64 0.44
65 0.43
66 0.39
67 0.38
68 0.33
69 0.34
70 0.3
71 0.29
72 0.32
73 0.35
74 0.42
75 0.44
76 0.51
77 0.54
78 0.6
79 0.64
80 0.59
81 0.57
82 0.56
83 0.63
84 0.67
85 0.69
86 0.71
87 0.75
88 0.82
89 0.87
90 0.89
91 0.89
92 0.89
93 0.89
94 0.89
95 0.87
96 0.87
97 0.84
98 0.79
99 0.76
100 0.7
101 0.62
102 0.56
103 0.49
104 0.42
105 0.38
106 0.36
107 0.37
108 0.34
109 0.38
110 0.37
111 0.42
112 0.46
113 0.51
114 0.53
115 0.5
116 0.53
117 0.47
118 0.43
119 0.38
120 0.38
121 0.33
122 0.27
123 0.22
124 0.18
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.2
135 0.19
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.15
140 0.18
141 0.18
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.16
147 0.16
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.17
152 0.16
153 0.19
154 0.14
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.18
159 0.16
160 0.19
161 0.15
162 0.17
163 0.15
164 0.17
165 0.18
166 0.15
167 0.15
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.17
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.15
195 0.21
196 0.22
197 0.21
198 0.21
199 0.2
200 0.18
201 0.17
202 0.13
203 0.07
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.12
215 0.16
216 0.18
217 0.21
218 0.26
219 0.27
220 0.31
221 0.31
222 0.28
223 0.26
224 0.26
225 0.26
226 0.23
227 0.22
228 0.19
229 0.17
230 0.15
231 0.14
232 0.17
233 0.16
234 0.17
235 0.24
236 0.28
237 0.29
238 0.32
239 0.34
240 0.3
241 0.31
242 0.33
243 0.29
244 0.27
245 0.27
246 0.27
247 0.29
248 0.29
249 0.25
250 0.23
251 0.24
252 0.26
253 0.3
254 0.34
255 0.35
256 0.39
257 0.41
258 0.4
259 0.36
260 0.32
261 0.32
262 0.27
263 0.25
264 0.26
265 0.25
266 0.29
267 0.35
268 0.42
269 0.48
270 0.55
271 0.63
272 0.69
273 0.79
274 0.85
275 0.89
276 0.94
277 0.94
278 0.95
279 0.94
280 0.93
281 0.91
282 0.88
283 0.86
284 0.83
285 0.83
286 0.77
287 0.68
288 0.64
289 0.62
290 0.57
291 0.54
292 0.57
293 0.57
294 0.6
295 0.69
296 0.72
297 0.74
298 0.79
299 0.77
300 0.76
301 0.7
302 0.68
303 0.66
304 0.62
305 0.64
306 0.64
307 0.69
308 0.69
309 0.74
310 0.79
311 0.82
312 0.87
313 0.87
314 0.9
315 0.91
316 0.94
317 0.96
318 0.96
319 0.97
320 0.97
321 0.97
322 0.96
323 0.94
324 0.93
325 0.89
326 0.87
327 0.78
328 0.72
329 0.68
330 0.63
331 0.61
332 0.58
333 0.61
334 0.6
335 0.63
336 0.62
337 0.61
338 0.61
339 0.64
340 0.66
341 0.64
342 0.68