Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X2N3

Protein Details
Accession A0A4T0X2N3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
430-455IFYGKDRCANPPKKKRSNHERSDWFGHydrophilic
557-576ESEPKGKEKKQQNGHIEQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
442-445KKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12261  RRM1_3_MRN1  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MHPRLNLNKSHRFLPQNLVLGSPFYNSTGTFNSPLTPTIVNEFNTPNILKFINLNNDSSSQLLQLINGSIETTYFENNDFFILFTYPIDGLNNYNYFSNQLPSLRKSLNSPNLSIEKIESPDNTDATDSLLITDLPSNIKESVLFNNLSKFGTINTFKFNHNNVIVTFNSVKDAINCKNNLIKEENLSNINVQFFSQNYQIYLPIPNFENRSIYIGNLDKNTSIEDICNVIRGGPLEEIKLLRNKRIAFITFLYHSSATDLLARSMIEPLFINSKPVKLSWANNCNPLDPMISFACSNLNASRNLYIGLNEELETIDDYDLIPLTDLEIQKLQKKLILKPEDKFNRLKSSFDSTKFKKVYKCLPDEIELRKDFSIFGEIEQINYFNNNICAFINFTSIKNCINTVEQFNNPKLSKFTHNAFDGKYEKFKIFYGKDRCANPPKKKRSNHERSDWFGRSGRGERSNNNRSNHERSDWFGRREGGERSIHEHINEQREGGERSIHEHINEQREGGERSIHEHINEQIQRNEQRHKSQQQESEPKGKKGGEHNGHIEHQHESEPKGKEKKQQNGHIEQQQESEQLKDQPNHYTPNGSPKPPQLPPSPPSSPSPVIGIGITSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.54
4 0.51
5 0.48
6 0.41
7 0.37
8 0.33
9 0.26
10 0.2
11 0.14
12 0.15
13 0.13
14 0.17
15 0.19
16 0.22
17 0.22
18 0.22
19 0.23
20 0.23
21 0.24
22 0.24
23 0.21
24 0.19
25 0.21
26 0.24
27 0.23
28 0.25
29 0.26
30 0.24
31 0.27
32 0.26
33 0.23
34 0.21
35 0.21
36 0.18
37 0.2
38 0.25
39 0.31
40 0.32
41 0.33
42 0.32
43 0.34
44 0.34
45 0.32
46 0.26
47 0.17
48 0.18
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.12
78 0.17
79 0.18
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.18
85 0.19
86 0.16
87 0.2
88 0.25
89 0.27
90 0.32
91 0.32
92 0.32
93 0.35
94 0.43
95 0.47
96 0.45
97 0.44
98 0.44
99 0.45
100 0.45
101 0.4
102 0.33
103 0.26
104 0.25
105 0.25
106 0.2
107 0.22
108 0.24
109 0.23
110 0.22
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.17
130 0.19
131 0.2
132 0.19
133 0.22
134 0.23
135 0.22
136 0.2
137 0.16
138 0.13
139 0.19
140 0.22
141 0.2
142 0.24
143 0.26
144 0.28
145 0.33
146 0.35
147 0.34
148 0.31
149 0.32
150 0.27
151 0.28
152 0.26
153 0.26
154 0.24
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.22
161 0.22
162 0.27
163 0.27
164 0.28
165 0.33
166 0.33
167 0.34
168 0.32
169 0.29
170 0.26
171 0.28
172 0.28
173 0.25
174 0.24
175 0.22
176 0.19
177 0.19
178 0.15
179 0.13
180 0.11
181 0.1
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.16
194 0.18
195 0.18
196 0.19
197 0.17
198 0.2
199 0.19
200 0.17
201 0.19
202 0.18
203 0.2
204 0.19
205 0.19
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.13
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.25
231 0.25
232 0.26
233 0.3
234 0.29
235 0.25
236 0.26
237 0.25
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.12
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.11
258 0.11
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.18
265 0.17
266 0.22
267 0.27
268 0.36
269 0.36
270 0.42
271 0.42
272 0.38
273 0.36
274 0.32
275 0.24
276 0.15
277 0.17
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.04
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.18
319 0.17
320 0.16
321 0.2
322 0.23
323 0.3
324 0.38
325 0.37
326 0.38
327 0.48
328 0.52
329 0.52
330 0.51
331 0.46
332 0.47
333 0.44
334 0.43
335 0.37
336 0.39
337 0.41
338 0.42
339 0.46
340 0.39
341 0.48
342 0.49
343 0.5
344 0.46
345 0.46
346 0.51
347 0.51
348 0.53
349 0.48
350 0.47
351 0.48
352 0.47
353 0.47
354 0.44
355 0.36
356 0.33
357 0.29
358 0.27
359 0.23
360 0.19
361 0.18
362 0.11
363 0.11
364 0.16
365 0.15
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.12
370 0.13
371 0.12
372 0.06
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.11
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.16
384 0.17
385 0.17
386 0.16
387 0.16
388 0.13
389 0.15
390 0.17
391 0.2
392 0.22
393 0.25
394 0.28
395 0.29
396 0.35
397 0.32
398 0.31
399 0.28
400 0.28
401 0.31
402 0.31
403 0.33
404 0.32
405 0.35
406 0.36
407 0.34
408 0.36
409 0.33
410 0.31
411 0.32
412 0.28
413 0.26
414 0.25
415 0.26
416 0.29
417 0.29
418 0.37
419 0.4
420 0.45
421 0.5
422 0.51
423 0.58
424 0.6
425 0.66
426 0.68
427 0.71
428 0.75
429 0.79
430 0.84
431 0.87
432 0.88
433 0.89
434 0.87
435 0.86
436 0.82
437 0.79
438 0.8
439 0.72
440 0.64
441 0.56
442 0.49
443 0.44
444 0.41
445 0.41
446 0.41
447 0.42
448 0.45
449 0.52
450 0.6
451 0.62
452 0.62
453 0.62
454 0.6
455 0.65
456 0.62
457 0.57
458 0.49
459 0.46
460 0.53
461 0.53
462 0.49
463 0.44
464 0.42
465 0.4
466 0.41
467 0.41
468 0.36
469 0.33
470 0.32
471 0.34
472 0.36
473 0.35
474 0.31
475 0.34
476 0.34
477 0.37
478 0.35
479 0.3
480 0.27
481 0.3
482 0.31
483 0.26
484 0.24
485 0.18
486 0.22
487 0.26
488 0.26
489 0.23
490 0.27
491 0.31
492 0.34
493 0.34
494 0.3
495 0.27
496 0.3
497 0.31
498 0.26
499 0.24
500 0.18
501 0.22
502 0.26
503 0.26
504 0.23
505 0.23
506 0.24
507 0.3
508 0.34
509 0.33
510 0.33
511 0.39
512 0.45
513 0.47
514 0.55
515 0.51
516 0.56
517 0.63
518 0.68
519 0.69
520 0.71
521 0.75
522 0.76
523 0.8
524 0.76
525 0.77
526 0.74
527 0.68
528 0.65
529 0.58
530 0.53
531 0.52
532 0.57
533 0.54
534 0.54
535 0.57
536 0.57
537 0.57
538 0.53
539 0.45
540 0.37
541 0.31
542 0.3
543 0.27
544 0.25
545 0.3
546 0.34
547 0.41
548 0.48
549 0.52
550 0.56
551 0.63
552 0.71
553 0.74
554 0.79
555 0.79
556 0.79
557 0.82
558 0.79
559 0.73
560 0.65
561 0.57
562 0.49
563 0.45
564 0.37
565 0.31
566 0.28
567 0.31
568 0.37
569 0.38
570 0.38
571 0.43
572 0.46
573 0.49
574 0.47
575 0.46
576 0.41
577 0.48
578 0.52
579 0.47
580 0.48
581 0.5
582 0.57
583 0.56
584 0.6
585 0.57
586 0.58
587 0.57
588 0.61
589 0.58
590 0.52
591 0.51
592 0.53
593 0.48
594 0.41
595 0.42
596 0.35
597 0.31
598 0.28