Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X399

Protein Details
Accession A0A4T0X399    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MARRRQKKRTHVKKSEEELKNIPBasic
344-396MNKLEQKHAIRRKEKELRKKQQAENVAKKNEKKLAKKQRREERKKAGENVSESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-14RRRQKKRTHVKK
347-389LEQKHAIRRKEKELRKKQQAENVAKKNEKKLAKKQRREERKKA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 13.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARRRQKKRTHVKKSEEELKNIPKSMVIHLGTALENHTLTQLVKDTRNMMQPHTAIRLRERKSNKLKDFVVMAGPLGITFLMVFTQNEKTGSTHLRLSSMPRGPTISFKILEYSLCKDVVRIQRNPKSMSTSSPEFLNPPLLVMNGFTNPKDASPEEKLVVTMFQNMFPPISPINTNVGTIKRVLLLNRDKETGVIELRHYVIETKLVDVSKNIKKLITIKSHLNKKLPNLAKTKDVADIILDPYAQAGFTSDSEVEEESIVEVKEDDALLTRSATKKHDRGDEGGEQGEDEAEVEERTIKRKKAVKLTEIGPRMKLGLVKIEEGVCDGKVLYHTQFKKTKAEMNKLEQKHAIRRKEKELRKKQQAENVAKKNEKKLAKKQRREERKKAGENVSESEESSDDNDIDMGDLSDSSSSEGENDGKLFDEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.86
4 0.81
5 0.78
6 0.77
7 0.73
8 0.64
9 0.55
10 0.47
11 0.43
12 0.41
13 0.41
14 0.32
15 0.28
16 0.27
17 0.28
18 0.25
19 0.24
20 0.21
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.13
28 0.17
29 0.2
30 0.23
31 0.25
32 0.28
33 0.31
34 0.39
35 0.38
36 0.36
37 0.38
38 0.37
39 0.39
40 0.42
41 0.41
42 0.36
43 0.43
44 0.5
45 0.46
46 0.53
47 0.56
48 0.59
49 0.67
50 0.76
51 0.73
52 0.72
53 0.7
54 0.65
55 0.61
56 0.52
57 0.44
58 0.33
59 0.26
60 0.18
61 0.16
62 0.12
63 0.1
64 0.08
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.06
71 0.08
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.2
78 0.23
79 0.23
80 0.25
81 0.24
82 0.26
83 0.26
84 0.3
85 0.34
86 0.35
87 0.34
88 0.3
89 0.33
90 0.31
91 0.36
92 0.36
93 0.32
94 0.27
95 0.26
96 0.27
97 0.25
98 0.26
99 0.24
100 0.22
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.18
105 0.25
106 0.33
107 0.37
108 0.4
109 0.48
110 0.54
111 0.59
112 0.62
113 0.56
114 0.54
115 0.48
116 0.46
117 0.42
118 0.38
119 0.34
120 0.32
121 0.3
122 0.24
123 0.23
124 0.22
125 0.16
126 0.13
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.15
139 0.14
140 0.17
141 0.2
142 0.23
143 0.22
144 0.22
145 0.22
146 0.19
147 0.19
148 0.14
149 0.15
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.19
173 0.24
174 0.29
175 0.3
176 0.31
177 0.29
178 0.28
179 0.28
180 0.23
181 0.17
182 0.13
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.18
198 0.19
199 0.22
200 0.21
201 0.19
202 0.21
203 0.26
204 0.32
205 0.32
206 0.31
207 0.36
208 0.42
209 0.51
210 0.53
211 0.52
212 0.47
213 0.44
214 0.51
215 0.48
216 0.47
217 0.44
218 0.42
219 0.42
220 0.4
221 0.39
222 0.31
223 0.26
224 0.2
225 0.16
226 0.15
227 0.12
228 0.11
229 0.09
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.05
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.1
260 0.12
261 0.14
262 0.19
263 0.25
264 0.29
265 0.34
266 0.41
267 0.41
268 0.43
269 0.46
270 0.45
271 0.4
272 0.35
273 0.3
274 0.22
275 0.19
276 0.16
277 0.1
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.09
284 0.09
285 0.16
286 0.21
287 0.23
288 0.3
289 0.37
290 0.44
291 0.51
292 0.58
293 0.58
294 0.58
295 0.61
296 0.62
297 0.6
298 0.55
299 0.45
300 0.37
301 0.33
302 0.28
303 0.26
304 0.18
305 0.2
306 0.2
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.12
319 0.13
320 0.21
321 0.24
322 0.32
323 0.38
324 0.41
325 0.47
326 0.48
327 0.53
328 0.54
329 0.61
330 0.6
331 0.64
332 0.7
333 0.65
334 0.66
335 0.63
336 0.6
337 0.6
338 0.61
339 0.62
340 0.61
341 0.65
342 0.72
343 0.76
344 0.81
345 0.82
346 0.84
347 0.85
348 0.87
349 0.91
350 0.87
351 0.85
352 0.86
353 0.85
354 0.84
355 0.82
356 0.8
357 0.77
358 0.75
359 0.74
360 0.72
361 0.7
362 0.69
363 0.71
364 0.74
365 0.78
366 0.84
367 0.87
368 0.9
369 0.92
370 0.93
371 0.93
372 0.93
373 0.92
374 0.91
375 0.89
376 0.87
377 0.83
378 0.77
379 0.7
380 0.64
381 0.54
382 0.46
383 0.39
384 0.3
385 0.23
386 0.21
387 0.19
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.11
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.14