Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4T0X1Y2

Protein Details
Accession A0A4T0X1Y2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-314NTETYARRGVKRFKRSKPSKKLCKPVDNSKNTSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-301RRGVKRFKRSKPSKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 15, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
Amino Acid Sequences MNLDNPTENSNENITASASLSNDVYMVAPGATTRGDGNASERDNTETSNCSEAQKDDDMSVVVSKPKGLDKITLFNKMGITIPIFRNSTKDQNGKVKEFSVVQHEAKNWLHKAESFCKFLDIAEEQRVWLVSNRLEDAAYDWFVELESKPSFDPTDWNSFKQKFSEAFCPISNETQYIDDFRILGLKLKPGQPVAEYVAEFNNLRKLLTYKEGSRMCVSRFLFGLTEDLREYVMAFKPTTIESAIKLAQEGEESKKFSSSGVGRNSDNHIYRFNSRPRPVNTETYARRGVKRFKRSKPSKKLCKPVDNSKNTSTYLSSPPSPVTDPVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.1
23 0.1
24 0.14
25 0.19
26 0.21
27 0.22
28 0.23
29 0.25
30 0.25
31 0.26
32 0.24
33 0.21
34 0.21
35 0.23
36 0.23
37 0.2
38 0.22
39 0.22
40 0.24
41 0.24
42 0.22
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.17
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.13
52 0.14
53 0.17
54 0.2
55 0.2
56 0.25
57 0.26
58 0.35
59 0.38
60 0.44
61 0.41
62 0.39
63 0.37
64 0.32
65 0.3
66 0.22
67 0.2
68 0.18
69 0.19
70 0.22
71 0.23
72 0.22
73 0.26
74 0.29
75 0.35
76 0.37
77 0.41
78 0.42
79 0.51
80 0.56
81 0.55
82 0.52
83 0.45
84 0.39
85 0.35
86 0.31
87 0.28
88 0.27
89 0.25
90 0.26
91 0.26
92 0.29
93 0.29
94 0.34
95 0.28
96 0.24
97 0.24
98 0.24
99 0.29
100 0.33
101 0.35
102 0.32
103 0.31
104 0.31
105 0.3
106 0.27
107 0.25
108 0.19
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.16
113 0.16
114 0.17
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.13
141 0.13
142 0.23
143 0.24
144 0.26
145 0.31
146 0.32
147 0.33
148 0.31
149 0.31
150 0.23
151 0.25
152 0.3
153 0.27
154 0.27
155 0.26
156 0.28
157 0.26
158 0.25
159 0.22
160 0.16
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.12
172 0.11
173 0.14
174 0.16
175 0.19
176 0.21
177 0.2
178 0.21
179 0.17
180 0.19
181 0.18
182 0.17
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.12
189 0.14
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.15
195 0.2
196 0.23
197 0.21
198 0.29
199 0.31
200 0.32
201 0.34
202 0.34
203 0.29
204 0.33
205 0.32
206 0.25
207 0.24
208 0.23
209 0.2
210 0.18
211 0.2
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.14
228 0.12
229 0.11
230 0.15
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.19
240 0.21
241 0.21
242 0.22
243 0.22
244 0.2
245 0.25
246 0.24
247 0.28
248 0.33
249 0.36
250 0.36
251 0.38
252 0.43
253 0.43
254 0.41
255 0.36
256 0.33
257 0.33
258 0.38
259 0.43
260 0.47
261 0.51
262 0.53
263 0.59
264 0.61
265 0.66
266 0.66
267 0.65
268 0.61
269 0.61
270 0.59
271 0.57
272 0.6
273 0.55
274 0.56
275 0.56
276 0.62
277 0.62
278 0.69
279 0.73
280 0.75
281 0.83
282 0.88
283 0.92
284 0.93
285 0.94
286 0.94
287 0.94
288 0.94
289 0.93
290 0.93
291 0.9
292 0.89
293 0.89
294 0.87
295 0.83
296 0.78
297 0.72
298 0.63
299 0.58
300 0.49
301 0.43
302 0.41
303 0.4
304 0.36
305 0.34
306 0.34
307 0.35
308 0.35