Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DDB6

Protein Details
Accession A5DDB6    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-200KSRPKGKTLKSLPQPSRRRSSATPKYGRRKSNAHydrophilic
393-418KIRDNSAKSSPRKRKHHKVGLSARSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-15KRPRKGAKAAKGS
164-197RKAMKSRPKGKTLKSLPQPSRRRSSATPKYGRRK
398-410SAKSSPRKRKHHK
654-676RKAAAGASKRARRRSSTGNRAGL
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
KEGG pgu:PGUG_01267  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MAKRPRKGAKAAKGSQNTTGGKSFKALKNLRARRFSINDSSSSSEDEEESSVGDFGQKLPGKTYKRGSGSESESSLTALSDDDSVSKTGSVFFESDDEVLVPRGKGKTMPSKFSSKKKYPMSTSGKKSIPSVSVDESDDDSDSDSSDDSNSDSEVDFVQLQAQRKAMKSRPKGKTLKSLPQPSRRRSSATPKYGRRKSNAALPDDIEFALEFDDDEEDENAVKALVGAPGEEDLGEEINDTKVNYTLNSDDDYEIDDNELLATLQADNDMEEFNDGGGLAARNDSVVSWGDDEDKFLREEERFLVNEFENNGFDDEQPSVLQNYESYDADSNQTHLNDSLEFMNKNKVEHHGSDSYEEEDDEDDEDDEDDDDDDFIVFDSLFENGITTNDKHKIRDNSAKSSPRKRKHHKVGLSARSSDDEDDSYLWNYFFSSDESSGEEKKAKSNDGDEQESESGELIVDDFFEQSRKRPVEAAVSDHEYDSGESTDEDVSLATKPHRKHAGSKSAKEVLSSKTADYRPPILGTWVAIDSKPFGIIDGLSTRNLVQPSRQAQPRKPRIDTSGSSDDSALELDELLNISELDDVDETDIQIWRDFNNEKRAVPLGAFRNKSLVYTNLAAVTAGHSDGGLNHTSRSNNDYNKRRYSLTNHSHGDRKAAAGASKRARRRSSTGNRAGLNIPSRAMRRRASNAQAESEGLRPTKSGLFSETALANVEELLGDDTEILALVHGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.72
3 0.7
4 0.62
5 0.55
6 0.53
7 0.45
8 0.38
9 0.39
10 0.42
11 0.38
12 0.46
13 0.47
14 0.5
15 0.6
16 0.69
17 0.74
18 0.73
19 0.72
20 0.71
21 0.72
22 0.7
23 0.68
24 0.62
25 0.56
26 0.53
27 0.53
28 0.45
29 0.41
30 0.36
31 0.27
32 0.24
33 0.22
34 0.19
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.11
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.18
44 0.21
45 0.21
46 0.26
47 0.35
48 0.39
49 0.46
50 0.53
51 0.52
52 0.55
53 0.57
54 0.56
55 0.56
56 0.56
57 0.53
58 0.47
59 0.4
60 0.34
61 0.32
62 0.27
63 0.19
64 0.13
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.1
86 0.12
87 0.13
88 0.11
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.19
93 0.26
94 0.35
95 0.39
96 0.46
97 0.46
98 0.55
99 0.62
100 0.69
101 0.72
102 0.69
103 0.72
104 0.75
105 0.79
106 0.75
107 0.78
108 0.78
109 0.78
110 0.77
111 0.76
112 0.7
113 0.62
114 0.58
115 0.52
116 0.46
117 0.39
118 0.36
119 0.31
120 0.3
121 0.3
122 0.29
123 0.26
124 0.24
125 0.2
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.13
146 0.16
147 0.18
148 0.2
149 0.23
150 0.24
151 0.27
152 0.35
153 0.38
154 0.44
155 0.52
156 0.6
157 0.65
158 0.72
159 0.77
160 0.75
161 0.78
162 0.76
163 0.76
164 0.75
165 0.78
166 0.76
167 0.79
168 0.82
169 0.78
170 0.79
171 0.71
172 0.68
173 0.65
174 0.67
175 0.67
176 0.68
177 0.71
178 0.72
179 0.8
180 0.82
181 0.81
182 0.75
183 0.72
184 0.64
185 0.63
186 0.6
187 0.53
188 0.48
189 0.43
190 0.39
191 0.33
192 0.3
193 0.21
194 0.14
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.13
285 0.11
286 0.13
287 0.14
288 0.16
289 0.15
290 0.16
291 0.18
292 0.15
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.19
335 0.21
336 0.22
337 0.27
338 0.23
339 0.23
340 0.24
341 0.24
342 0.21
343 0.18
344 0.16
345 0.11
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.07
374 0.08
375 0.11
376 0.17
377 0.19
378 0.2
379 0.27
380 0.31
381 0.36
382 0.45
383 0.46
384 0.46
385 0.53
386 0.6
387 0.6
388 0.65
389 0.69
390 0.69
391 0.75
392 0.78
393 0.81
394 0.84
395 0.88
396 0.84
397 0.85
398 0.85
399 0.83
400 0.77
401 0.67
402 0.56
403 0.48
404 0.41
405 0.31
406 0.22
407 0.14
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.14
423 0.15
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.16
428 0.2
429 0.22
430 0.21
431 0.21
432 0.24
433 0.29
434 0.3
435 0.32
436 0.28
437 0.29
438 0.27
439 0.26
440 0.22
441 0.15
442 0.11
443 0.08
444 0.07
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.07
452 0.07
453 0.1
454 0.18
455 0.19
456 0.2
457 0.22
458 0.24
459 0.3
460 0.32
461 0.33
462 0.28
463 0.3
464 0.3
465 0.28
466 0.26
467 0.18
468 0.16
469 0.13
470 0.1
471 0.07
472 0.06
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.11
482 0.16
483 0.17
484 0.25
485 0.33
486 0.35
487 0.43
488 0.51
489 0.59
490 0.62
491 0.65
492 0.64
493 0.62
494 0.6
495 0.52
496 0.46
497 0.37
498 0.35
499 0.32
500 0.26
501 0.27
502 0.28
503 0.29
504 0.29
505 0.3
506 0.26
507 0.26
508 0.26
509 0.2
510 0.2
511 0.17
512 0.16
513 0.14
514 0.13
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.1
525 0.11
526 0.13
527 0.12
528 0.13
529 0.13
530 0.16
531 0.18
532 0.16
533 0.15
534 0.22
535 0.26
536 0.33
537 0.39
538 0.42
539 0.49
540 0.6
541 0.67
542 0.68
543 0.68
544 0.65
545 0.64
546 0.65
547 0.6
548 0.57
549 0.54
550 0.47
551 0.44
552 0.39
553 0.33
554 0.26
555 0.23
556 0.15
557 0.07
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.11
576 0.1
577 0.11
578 0.12
579 0.11
580 0.16
581 0.2
582 0.24
583 0.33
584 0.35
585 0.34
586 0.37
587 0.39
588 0.34
589 0.32
590 0.33
591 0.32
592 0.37
593 0.39
594 0.36
595 0.38
596 0.37
597 0.37
598 0.33
599 0.27
600 0.23
601 0.23
602 0.24
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.16
607 0.15
608 0.11
609 0.09
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.08
614 0.1
615 0.11
616 0.11
617 0.12
618 0.16
619 0.17
620 0.19
621 0.26
622 0.3
623 0.37
624 0.46
625 0.55
626 0.6
627 0.67
628 0.68
629 0.64
630 0.63
631 0.62
632 0.64
633 0.62
634 0.63
635 0.59
636 0.6
637 0.64
638 0.58
639 0.56
640 0.46
641 0.39
642 0.34
643 0.32
644 0.32
645 0.31
646 0.39
647 0.43
648 0.5
649 0.56
650 0.6
651 0.64
652 0.66
653 0.67
654 0.7
655 0.72
656 0.75
657 0.77
658 0.75
659 0.7
660 0.67
661 0.62
662 0.57
663 0.5
664 0.41
665 0.32
666 0.3
667 0.34
668 0.37
669 0.42
670 0.41
671 0.45
672 0.52
673 0.59
674 0.62
675 0.67
676 0.64
677 0.62
678 0.58
679 0.52
680 0.45
681 0.39
682 0.35
683 0.26
684 0.23
685 0.19
686 0.2
687 0.24
688 0.24
689 0.23
690 0.23
691 0.25
692 0.26
693 0.29
694 0.26
695 0.22
696 0.21
697 0.19
698 0.15
699 0.12
700 0.11
701 0.07
702 0.08
703 0.09
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.06