Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X6S2

Protein Details
Accession A0A4T0X6S2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-130ALKQERGEIRSKKKKKKPEANSNENDHAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-120RGEIRSKKKKKKP
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
IPR027113  Transc_fact_NFYB/HAP3  
IPR003956  Transcrpt_fac_NFYB/HAP3_CS  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00685  NFYB_HAP3  
Amino Acid Sequences MAQEKEFELREQDRWLPIANVARLMKNTLPPTAKVSKDAKECMQECVSEFISFVTSEASDRCLMEKRKTINGEDILYSLHTLGFENYAEVLKIYLAKFRQQQALKQERGEIRSKKKKKKPEANSNENDHASIIEGNESVTNDSEGNTNQDNGILQNTYETNNEVKEQSKAGIDQEYVSQLYEQGYADAPLNISNPDYHGGGSSESILLKRKQQLESTGKDDSNLEDETTEALSLGLGVGIAIDEEDDQNVEVPTKKSVEISDKSTKETLVEKKEGVKSMGDINDLKIESLEESSLNKVKKEDSGTSKVSKTPATTTAGDLFLLNDNIEGISEREEIVGLTNGHQGMFFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.29
4 0.3
5 0.35
6 0.31
7 0.33
8 0.32
9 0.34
10 0.33
11 0.36
12 0.34
13 0.33
14 0.35
15 0.35
16 0.36
17 0.35
18 0.41
19 0.44
20 0.43
21 0.43
22 0.46
23 0.46
24 0.49
25 0.52
26 0.5
27 0.52
28 0.51
29 0.5
30 0.47
31 0.41
32 0.36
33 0.36
34 0.32
35 0.23
36 0.22
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.1
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.15
49 0.21
50 0.26
51 0.31
52 0.38
53 0.4
54 0.47
55 0.5
56 0.51
57 0.5
58 0.49
59 0.45
60 0.39
61 0.34
62 0.27
63 0.23
64 0.21
65 0.13
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.09
80 0.09
81 0.13
82 0.14
83 0.2
84 0.25
85 0.28
86 0.36
87 0.35
88 0.4
89 0.46
90 0.54
91 0.52
92 0.48
93 0.51
94 0.46
95 0.48
96 0.51
97 0.49
98 0.5
99 0.59
100 0.68
101 0.72
102 0.77
103 0.84
104 0.86
105 0.89
106 0.9
107 0.9
108 0.9
109 0.9
110 0.88
111 0.83
112 0.76
113 0.65
114 0.55
115 0.43
116 0.32
117 0.23
118 0.17
119 0.11
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.11
194 0.12
195 0.16
196 0.22
197 0.26
198 0.28
199 0.3
200 0.39
201 0.41
202 0.44
203 0.44
204 0.42
205 0.37
206 0.35
207 0.33
208 0.25
209 0.21
210 0.18
211 0.14
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.19
245 0.25
246 0.26
247 0.32
248 0.39
249 0.38
250 0.41
251 0.41
252 0.38
253 0.32
254 0.36
255 0.36
256 0.34
257 0.36
258 0.35
259 0.41
260 0.45
261 0.45
262 0.4
263 0.33
264 0.27
265 0.3
266 0.3
267 0.26
268 0.23
269 0.21
270 0.25
271 0.24
272 0.22
273 0.16
274 0.15
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.09
279 0.1
280 0.15
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.22
285 0.23
286 0.28
287 0.33
288 0.37
289 0.4
290 0.45
291 0.49
292 0.52
293 0.52
294 0.5
295 0.47
296 0.42
297 0.37
298 0.34
299 0.34
300 0.34
301 0.33
302 0.33
303 0.34
304 0.31
305 0.28
306 0.24
307 0.21
308 0.18
309 0.18
310 0.14
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.08
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.15
325 0.13
326 0.14
327 0.18
328 0.18
329 0.18