Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X090

Protein Details
Accession A0A4T0X090    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-106LLRVDIAKRRDRKDKSKIGATPHydrophilic
679-703KDGRVEKGNKRQKTGKNGNRGNMNKBasic
721-742VKTKDSVKRIIAQKRRQRKNRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-103KKTKLKDRLLRVDIAKRRDRKDKSKIG
661-715PKRKREEDKDGMDKKASFKDGRVEKGNKRQKTGKNGNRGNMNKGPKQDATKPSRE
721-742VKTKDSVKRIIAQKRRQRKNRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSETDNKSSDDSLDRKTLFVRAIPLDVTNEQLTDFFSDFAPVKHAVIVNDNENKSRGFGFVSFTSDDDTLTALQAAKKTKLKDRLLRVDIAKRRDRKDKSKIGATPSKHVTAPEKVAVQKTARLIVRNLPWNVKNPDELVQIFKKFGPVKEAKIPKKPDGKMFGFGFVTMAKHANAEKAVKESAGLKINGREVAVDYAVNKTHWDTLRASQQGADDDEEREEDKVEGKEEEEEEEEEEEEEEEEEEEKGEVDGIEVKSENIQSISKGSSKKNGEVTSDTDDKEGEDEDARLLELGEDEDSKSDRVKRNRQERFCVFVRNLPYDVTEEGLKAHFEKLGPVKYALPVVDKETGLPKGTAFVAFDKHMAYEECLLNAPVVSPNSVLLPDDVSPFYVYEGRIMQIAPALDRDSAARMSEKSASSRKELLGRLPKESDKRNLYLLNEGRIGPNSKLAQLLSQSDLDIRERSFALRVEQLKKNPSLHLSMTRLAIRNLPRAMNDKSLKQLGRKAIVEFATEVKQGLRQPLSKEEIDRSTKQKHFVLEKLGITDDEEKKRISKHGVVTQAKVINEVKGSGEYGRSRGYGFLEFRDHKHALMALRWLNAHEVTKAEVVNGLTEEQRKMAEREKTTGKRRLVVEFAIENASVVKRRYEQIIRSRENGFDPKRKREEDKDGMDKKASFKDGRVEKGNKRQKTGKNGNRGNMNKGPKQDATKPSREENQSEVKTKDSVKRIIAQKRRQRKNRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.36
4 0.37
5 0.32
6 0.31
7 0.32
8 0.27
9 0.29
10 0.29
11 0.28
12 0.28
13 0.26
14 0.27
15 0.22
16 0.19
17 0.17
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.12
23 0.12
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.18
28 0.16
29 0.16
30 0.19
31 0.21
32 0.19
33 0.25
34 0.27
35 0.3
36 0.37
37 0.38
38 0.37
39 0.36
40 0.35
41 0.31
42 0.29
43 0.23
44 0.18
45 0.18
46 0.21
47 0.21
48 0.25
49 0.24
50 0.23
51 0.25
52 0.22
53 0.21
54 0.16
55 0.16
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.13
61 0.17
62 0.21
63 0.26
64 0.31
65 0.36
66 0.44
67 0.52
68 0.6
69 0.64
70 0.71
71 0.74
72 0.73
73 0.74
74 0.71
75 0.71
76 0.68
77 0.68
78 0.66
79 0.64
80 0.66
81 0.7
82 0.74
83 0.75
84 0.79
85 0.8
86 0.79
87 0.81
88 0.79
89 0.78
90 0.77
91 0.7
92 0.67
93 0.61
94 0.56
95 0.48
96 0.45
97 0.42
98 0.39
99 0.41
100 0.37
101 0.36
102 0.37
103 0.38
104 0.4
105 0.37
106 0.35
107 0.32
108 0.35
109 0.34
110 0.33
111 0.33
112 0.35
113 0.4
114 0.44
115 0.44
116 0.44
117 0.44
118 0.49
119 0.51
120 0.46
121 0.41
122 0.36
123 0.37
124 0.34
125 0.32
126 0.31
127 0.32
128 0.31
129 0.3
130 0.28
131 0.31
132 0.31
133 0.31
134 0.34
135 0.33
136 0.37
137 0.45
138 0.55
139 0.55
140 0.6
141 0.66
142 0.65
143 0.7
144 0.69
145 0.67
146 0.66
147 0.62
148 0.6
149 0.55
150 0.51
151 0.41
152 0.37
153 0.3
154 0.22
155 0.19
156 0.13
157 0.14
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.14
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.19
166 0.2
167 0.18
168 0.18
169 0.17
170 0.19
171 0.22
172 0.22
173 0.2
174 0.23
175 0.26
176 0.26
177 0.24
178 0.19
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.13
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.17
190 0.18
191 0.21
192 0.22
193 0.25
194 0.34
195 0.34
196 0.33
197 0.28
198 0.29
199 0.28
200 0.26
201 0.23
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.1
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.15
253 0.19
254 0.2
255 0.27
256 0.3
257 0.34
258 0.38
259 0.38
260 0.37
261 0.36
262 0.38
263 0.35
264 0.35
265 0.31
266 0.25
267 0.23
268 0.19
269 0.17
270 0.14
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.1
289 0.16
290 0.22
291 0.31
292 0.41
293 0.49
294 0.6
295 0.69
296 0.72
297 0.75
298 0.72
299 0.69
300 0.61
301 0.57
302 0.47
303 0.42
304 0.4
305 0.34
306 0.3
307 0.24
308 0.23
309 0.19
310 0.19
311 0.15
312 0.12
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.11
322 0.15
323 0.17
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.18
328 0.19
329 0.16
330 0.14
331 0.11
332 0.13
333 0.15
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.14
340 0.11
341 0.1
342 0.11
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.08
400 0.1
401 0.14
402 0.14
403 0.17
404 0.22
405 0.23
406 0.25
407 0.27
408 0.27
409 0.29
410 0.3
411 0.33
412 0.38
413 0.37
414 0.37
415 0.37
416 0.4
417 0.39
418 0.43
419 0.43
420 0.38
421 0.38
422 0.38
423 0.38
424 0.35
425 0.38
426 0.36
427 0.3
428 0.27
429 0.26
430 0.23
431 0.23
432 0.24
433 0.16
434 0.19
435 0.17
436 0.16
437 0.17
438 0.17
439 0.16
440 0.15
441 0.17
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.18
457 0.24
458 0.28
459 0.33
460 0.36
461 0.39
462 0.42
463 0.41
464 0.38
465 0.35
466 0.33
467 0.3
468 0.33
469 0.31
470 0.29
471 0.3
472 0.3
473 0.29
474 0.26
475 0.29
476 0.26
477 0.28
478 0.28
479 0.27
480 0.26
481 0.3
482 0.33
483 0.36
484 0.35
485 0.31
486 0.33
487 0.38
488 0.38
489 0.36
490 0.39
491 0.36
492 0.39
493 0.39
494 0.36
495 0.34
496 0.33
497 0.3
498 0.25
499 0.23
500 0.19
501 0.17
502 0.17
503 0.12
504 0.15
505 0.15
506 0.2
507 0.22
508 0.23
509 0.26
510 0.32
511 0.36
512 0.34
513 0.35
514 0.33
515 0.36
516 0.39
517 0.4
518 0.4
519 0.44
520 0.46
521 0.49
522 0.48
523 0.47
524 0.47
525 0.46
526 0.47
527 0.43
528 0.4
529 0.37
530 0.34
531 0.28
532 0.25
533 0.29
534 0.28
535 0.28
536 0.28
537 0.28
538 0.29
539 0.32
540 0.35
541 0.34
542 0.34
543 0.37
544 0.43
545 0.52
546 0.53
547 0.52
548 0.53
549 0.5
550 0.43
551 0.4
552 0.33
553 0.25
554 0.23
555 0.22
556 0.17
557 0.14
558 0.15
559 0.12
560 0.16
561 0.16
562 0.18
563 0.19
564 0.18
565 0.18
566 0.19
567 0.2
568 0.22
569 0.22
570 0.23
571 0.29
572 0.3
573 0.32
574 0.38
575 0.36
576 0.3
577 0.3
578 0.3
579 0.25
580 0.25
581 0.29
582 0.24
583 0.25
584 0.25
585 0.24
586 0.23
587 0.23
588 0.21
589 0.16
590 0.15
591 0.16
592 0.18
593 0.17
594 0.15
595 0.15
596 0.14
597 0.14
598 0.14
599 0.13
600 0.13
601 0.16
602 0.16
603 0.14
604 0.16
605 0.18
606 0.2
607 0.27
608 0.32
609 0.34
610 0.39
611 0.48
612 0.56
613 0.62
614 0.67
615 0.64
616 0.62
617 0.62
618 0.61
619 0.55
620 0.48
621 0.43
622 0.35
623 0.33
624 0.28
625 0.25
626 0.19
627 0.17
628 0.17
629 0.16
630 0.16
631 0.18
632 0.19
633 0.21
634 0.29
635 0.35
636 0.42
637 0.49
638 0.58
639 0.59
640 0.59
641 0.6
642 0.54
643 0.53
644 0.54
645 0.52
646 0.52
647 0.56
648 0.62
649 0.68
650 0.72
651 0.74
652 0.74
653 0.76
654 0.76
655 0.78
656 0.78
657 0.74
658 0.72
659 0.68
660 0.61
661 0.55
662 0.53
663 0.5
664 0.41
665 0.39
666 0.45
667 0.48
668 0.53
669 0.57
670 0.58
671 0.61
672 0.7
673 0.77
674 0.73
675 0.73
676 0.76
677 0.75
678 0.78
679 0.8
680 0.78
681 0.8
682 0.82
683 0.81
684 0.82
685 0.77
686 0.74
687 0.71
688 0.7
689 0.64
690 0.62
691 0.62
692 0.57
693 0.6
694 0.61
695 0.63
696 0.64
697 0.67
698 0.67
699 0.67
700 0.7
701 0.69
702 0.64
703 0.6
704 0.62
705 0.59
706 0.6
707 0.55
708 0.49
709 0.47
710 0.5
711 0.52
712 0.49
713 0.49
714 0.48
715 0.56
716 0.62
717 0.68
718 0.72
719 0.75
720 0.78
721 0.82
722 0.88