Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X4T6

Protein Details
Accession A0A4T0X4T6    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-368PIPVDMKSKKRGGRKFRKMRERLKMSEVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-363KSKKRGGRKFRKMRERLK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042239  Nop_C  
IPR002687  Nop_dom  
IPR036070  Nop_dom_sf  
IPR012976  NOSIC  
IPR027105  Prp31  
IPR019175  Prp31_C  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000244  P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01798  Nop  
PF09785  Prp31_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51358  NOP  
Amino Acid Sequences MSLADSLLDDLSDDDLNIEDKSDEKIGLAVSDAARQSTHNINDLLKISDFASIETIESFCPILPKLKTLKERLAESELRENEQKALSSSEQQLLFDANSLITEMNTYFNVLISFIKNNYSKFWPDLFGIVKNPLNYIRVIQSIKFDISSLKGTSSELEFLPKDQILSLTMSSNFLLKLNESIPLTEHLQTLILEACNILLSINETQLDLRGFITRRISKIAPNLTEIVGPIVASQLITTLSLELLCATPACNIPSIGKSSNNSQGFINQCELVKGTPEEFKRQAMRQVSAKVVLAARVDLGASKSGDMDCKLGSKWKEEIKAKLDKLMLPPENVQIKPLPIPVDMKSKKRGGRKFRKMRERLKMSEVEKAQNKMVFGEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.08
7 0.09
8 0.12
9 0.14
10 0.13
11 0.12
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.19
24 0.23
25 0.25
26 0.25
27 0.27
28 0.27
29 0.31
30 0.32
31 0.31
32 0.23
33 0.22
34 0.18
35 0.2
36 0.19
37 0.16
38 0.16
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.08
47 0.1
48 0.11
49 0.16
50 0.17
51 0.23
52 0.28
53 0.36
54 0.43
55 0.47
56 0.54
57 0.53
58 0.56
59 0.54
60 0.55
61 0.5
62 0.46
63 0.49
64 0.42
65 0.4
66 0.39
67 0.35
68 0.31
69 0.3
70 0.27
71 0.19
72 0.22
73 0.2
74 0.23
75 0.25
76 0.27
77 0.26
78 0.25
79 0.24
80 0.21
81 0.19
82 0.15
83 0.13
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.16
103 0.18
104 0.19
105 0.22
106 0.24
107 0.25
108 0.26
109 0.27
110 0.24
111 0.23
112 0.25
113 0.24
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.22
118 0.2
119 0.2
120 0.18
121 0.18
122 0.16
123 0.16
124 0.14
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.12
134 0.13
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.09
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.2
201 0.21
202 0.22
203 0.26
204 0.26
205 0.26
206 0.32
207 0.36
208 0.3
209 0.3
210 0.3
211 0.26
212 0.25
213 0.22
214 0.16
215 0.1
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.13
242 0.17
243 0.17
244 0.19
245 0.2
246 0.24
247 0.32
248 0.32
249 0.31
250 0.27
251 0.3
252 0.3
253 0.31
254 0.28
255 0.2
256 0.19
257 0.19
258 0.2
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.17
264 0.2
265 0.26
266 0.27
267 0.31
268 0.34
269 0.36
270 0.42
271 0.4
272 0.42
273 0.41
274 0.43
275 0.41
276 0.37
277 0.35
278 0.3
279 0.25
280 0.23
281 0.18
282 0.15
283 0.12
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.21
300 0.22
301 0.25
302 0.3
303 0.35
304 0.44
305 0.47
306 0.54
307 0.53
308 0.61
309 0.58
310 0.57
311 0.53
312 0.48
313 0.48
314 0.5
315 0.46
316 0.39
317 0.4
318 0.41
319 0.45
320 0.41
321 0.38
322 0.31
323 0.31
324 0.3
325 0.32
326 0.27
327 0.22
328 0.26
329 0.27
330 0.36
331 0.39
332 0.42
333 0.47
334 0.52
335 0.57
336 0.64
337 0.71
338 0.71
339 0.77
340 0.82
341 0.86
342 0.89
343 0.93
344 0.93
345 0.94
346 0.93
347 0.91
348 0.86
349 0.82
350 0.8
351 0.71
352 0.7
353 0.64
354 0.62
355 0.59
356 0.56
357 0.54
358 0.48
359 0.46