FuNGI

A0A4T0X5D0

Protein Details

Accession

A0A4T0X5D0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
55-74	FEPPVRLHRKDPKNLQFQMS	Hydrophilic
86-106	QEKELKQKRLREEYLKRTGKT	Basic
535-556	STLVRSLKSKMQRDPNSKNTIK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
161-165	RKPKK

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSISNNISIKSEINDGEVEYDEFPLMACPPEELEETRYHILKFHSNKIIDPLKDFEPPVRLHRKDPKNLQFQMSLKELEQKKIADQEKELKQKRLREEYLKRTGKTGLTDAEIDDEILADGLEGEERKHFDERRQREREIREREEERERQMQLVAPDGGARKPKKNVLVKRTQQVRVYNEKKRKLRYEEFYPWVLEDYDAKQAWVSNYEAGLHDNYCMLIMDPITKSYKLAPVEKCYKFTSRNKYATLTLEEAEAKMKQGNSGQRWLMRKMMDEVATGKRVDLRYRKSVQVKTEVEEDDDEKRSDEDEDLDFDDEFQDDEEAPIMEGPDEEKKLIETKLKKEMLSANNLIEKVADEEEDDDLDDLFEVKKEDKESKKLRKALSKNAMNEVYASDDDEDENPYLSNSDIESEEDESKGETDNTIKVKTEEEDEIKVKEEDTDELSGVSKAKKEKSKNIYVEKFVSGFLTLKGKKEILLQFPKGEWNPRTAIRRDLTDTNVSTSLIEDKATVNDDESTTLKREDIDALLVNGPIELSTLVRSLKSKMQRDPNSKNTIKELLKDHFIVKNKQVWRKETA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.19
3	0.2
4	0.19
5	0.19
6	0.15
7	0.15
8	0.12
9	0.11
10	0.11
11	0.1
12	0.1
13	0.1
14	0.09
15	0.09
16	0.11
17	0.14
18	0.16
19	0.17
20	0.2
21	0.22
22	0.27
23	0.3
24	0.3
25	0.28
26	0.29
27	0.3
28	0.36
29	0.39
30	0.43
31	0.47
32	0.46
33	0.48
34	0.53
35	0.57
36	0.49
37	0.46
38	0.42
39	0.36
40	0.39
41	0.38
42	0.33
43	0.32
44	0.33
45	0.39
46	0.46
47	0.45
48	0.5
49	0.6
50	0.66
51	0.7
52	0.78
53	0.79
54	0.78
55	0.8
56	0.76
57	0.72
58	0.65
59	0.6
60	0.52
61	0.44
62	0.35
63	0.39
64	0.37
65	0.34
66	0.36
67	0.32
68	0.32
69	0.39
70	0.43
71	0.38
72	0.4
73	0.46
74	0.51
75	0.6
76	0.63
77	0.63
78	0.64
79	0.68
80	0.73
81	0.73
82	0.71
83	0.71
84	0.76
85	0.76
86	0.81
87	0.8
88	0.71
89	0.64
90	0.61
91	0.54
92	0.47
93	0.41
94	0.32
95	0.28
96	0.28
97	0.25
98	0.23
99	0.2
100	0.16
101	0.12
102	0.1
103	0.08
104	0.07
105	0.06
106	0.03
107	0.03
108	0.03
109	0.05
110	0.05
111	0.06
112	0.08
113	0.1
114	0.13
115	0.19
116	0.21
117	0.29
118	0.39
119	0.48
120	0.56
121	0.61
122	0.64
123	0.67
124	0.74
125	0.75
126	0.74
127	0.71
128	0.69
129	0.66
130	0.66
131	0.67
132	0.62
133	0.57
134	0.54
135	0.49
136	0.42
137	0.39
138	0.37
139	0.28
140	0.28
141	0.22
142	0.16
143	0.17
144	0.17
145	0.18
146	0.23
147	0.26
148	0.27
149	0.32
150	0.37
151	0.44
152	0.53
153	0.6
154	0.61
155	0.69
156	0.7
157	0.74
158	0.77
159	0.73
160	0.69
161	0.66
162	0.63
163	0.63
164	0.65
165	0.65
166	0.66
167	0.7
168	0.71
169	0.73
170	0.75
171	0.73
172	0.74
173	0.72
174	0.73
175	0.72
176	0.69
177	0.62
178	0.54
179	0.45
180	0.37
181	0.3
182	0.21
183	0.15
184	0.13
185	0.17
186	0.16
187	0.16
188	0.15
189	0.16
190	0.16
191	0.16
192	0.15
193	0.11
194	0.11
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.12
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.08
209	0.08
210	0.1
211	0.12
212	0.12
213	0.12
214	0.14
215	0.19
216	0.19
217	0.26
218	0.27
219	0.32
220	0.41
221	0.42
222	0.43
223	0.41
224	0.43
225	0.44
226	0.49
227	0.52
228	0.52
229	0.56
230	0.55
231	0.54
232	0.52
233	0.47
234	0.42
235	0.34
236	0.25
237	0.21
238	0.19
239	0.16
240	0.15
241	0.12
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.14
247	0.2
248	0.21
249	0.26
250	0.27
251	0.3
252	0.33
253	0.33
254	0.33
255	0.27
256	0.25
257	0.24
258	0.25
259	0.21
260	0.19
261	0.21
262	0.19
263	0.2
264	0.18
265	0.15
266	0.16
267	0.16
268	0.21
269	0.25
270	0.28
271	0.34
272	0.37
273	0.43
274	0.47
275	0.5
276	0.48
277	0.5
278	0.46
279	0.4
280	0.41
281	0.35
282	0.28
283	0.25
284	0.23
285	0.17
286	0.18
287	0.16
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.12
292	0.11
293	0.1
294	0.09
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.07
302	0.07
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.08
319	0.09
320	0.12
321	0.14
322	0.2
323	0.22
324	0.26
325	0.35
326	0.38
327	0.37
328	0.37
329	0.43
330	0.39
331	0.4
332	0.37
333	0.3
334	0.3
335	0.3
336	0.27
337	0.19
338	0.16
339	0.12
340	0.11
341	0.09
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.04
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.09
357	0.13
358	0.21
359	0.25
360	0.35
361	0.45
362	0.54
363	0.62
364	0.67
365	0.69
366	0.72
367	0.73
368	0.74
369	0.74
370	0.7
371	0.64
372	0.64
373	0.59
374	0.49
375	0.42
376	0.32
377	0.25
378	0.18
379	0.16
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.11
384	0.12
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.06
393	0.07
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.13
398	0.13
399	0.13
400	0.12
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.1
405	0.08
406	0.09
407	0.14
408	0.17
409	0.18
410	0.18
411	0.18
412	0.2
413	0.2
414	0.22
415	0.21
416	0.21
417	0.25
418	0.25
419	0.25
420	0.26
421	0.25
422	0.21
423	0.19
424	0.17
425	0.14
426	0.16
427	0.17
428	0.14
429	0.14
430	0.15
431	0.14
432	0.15
433	0.15
434	0.15
435	0.19
436	0.27
437	0.35
438	0.41
439	0.51
440	0.58
441	0.66
442	0.72
443	0.77
444	0.75
445	0.72
446	0.68
447	0.6
448	0.52
449	0.42
450	0.33
451	0.24
452	0.19
453	0.16
454	0.22
455	0.22
456	0.23
457	0.27
458	0.26
459	0.26
460	0.33
461	0.37
462	0.38
463	0.45
464	0.45
465	0.44
466	0.44
467	0.5
468	0.45
469	0.47
470	0.39
471	0.35
472	0.36
473	0.4
474	0.46
475	0.42
476	0.48
477	0.43
478	0.46
479	0.46
480	0.46
481	0.45
482	0.44
483	0.43
484	0.38
485	0.36
486	0.32
487	0.27
488	0.23
489	0.22
490	0.16
491	0.15
492	0.12
493	0.12
494	0.14
495	0.16
496	0.16
497	0.14
498	0.15
499	0.15
500	0.17
501	0.17
502	0.18
503	0.18
504	0.19
505	0.18
506	0.17
507	0.18
508	0.19
509	0.19
510	0.19
511	0.18
512	0.19
513	0.2
514	0.19
515	0.17
516	0.14
517	0.12
518	0.09
519	0.08
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.1
524	0.11
525	0.13
526	0.15
527	0.18
528	0.26
529	0.35
530	0.41
531	0.48
532	0.58
533	0.66
534	0.75
535	0.81
536	0.82
537	0.83
538	0.8
539	0.74
540	0.69
541	0.68
542	0.61
543	0.57
544	0.54
545	0.49
546	0.5
547	0.49
548	0.47
549	0.44
550	0.48
551	0.49
552	0.49
553	0.52
554	0.56
555	0.63
556	0.67

A0A4T0X5D0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer