Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0WXM6

Protein Details
Accession A0A4T0WXM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-123GVAPRAKMNQQRSRRFRSAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIISSVVDEEGPIIDGVEQPIKYTDPNPNGELDNLYLDMNAIVHPCSHPENRPPPETEEEMMMAIFKYTDHVLNIARPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKDAQVAHEEKQRELAEMEARGEVIDETIKGKKSWDSNSITPGTPFMDILAASLKYWVAHKLSTDPGWAELQVIISDASVPGEGEHKIMNFIRSQRSDPEYDPNVTHCIHGLDADLIFLSLATHEPHFKVLREDVFAADNRQRQLTARDQLHMDEETKEKLRNQKQPFIWLHINVLREYLQIELQVPRLPFKYDFERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDVRDSSLDTLVGIWKGLLPKLKHYITCDGNLNLDRVEQLLSELAKREDGIFKARHEQDMKREANFKRRRFDNEQKNIVQKQLLASVSRGKDNAPITPSQNMVLTNLKSGKTAGLQMSNNDIVQNITVVSKANAENRNVADLLRENLLQSNSDTSNSKKRNIEEIDDIDVNPDAEDGEGGDDDNDNDNDEDEVDDFEDEEIRLWEPGYKTRYYQQKFRTTDEKEIARIKRDMTRCYVEGISWVLLYYYQGCPSWNWYYPYHYAPFAADFTNLKDFDIKFEQGTPFKPFEQLMSVLPAASNHNLPEVFRSLMSDANSEIIDFYPEDFKIDMNGEKQSWRGIALLPFIDEERLLKAVRSKYHELTELEHERNSHKKEVLFVGKNNTYFKKFAKLYNQEKKKESIKFTFHKTHLAGTASPHVLYTPGSIFKFPFETSNEEYKDLHTSDFVLVEYQMPPKVFGKSMLLTGYRPHNMVLGPEDRDKILYYRNYNNNRFNRNEQHGNNIDFSKHTGPGQDSMYTNRPGGYKYFVQMYGKEVNQQQQVAAFNQGRANFNNMYHNEYDVYANPNEGYNQYGYNNGRGGYGGRGSHHNGGSRGGYGRGGYTGARGGYNNTYGNRGGYNSRGRGGYSRGGSYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.62
4 0.62
5 0.57
6 0.55
7 0.51
8 0.44
9 0.35
10 0.32
11 0.27
12 0.22
13 0.19
14 0.12
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.11
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.17
23 0.18
24 0.2
25 0.23
26 0.3
27 0.32
28 0.37
29 0.37
30 0.38
31 0.38
32 0.38
33 0.35
34 0.27
35 0.22
36 0.19
37 0.17
38 0.14
39 0.13
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.19
49 0.23
50 0.28
51 0.37
52 0.47
53 0.53
54 0.57
55 0.58
56 0.58
57 0.59
58 0.58
59 0.49
60 0.41
61 0.36
62 0.31
63 0.27
64 0.21
65 0.15
66 0.1
67 0.09
68 0.06
69 0.08
70 0.09
71 0.11
72 0.11
73 0.14
74 0.16
75 0.23
76 0.32
77 0.37
78 0.36
79 0.35
80 0.36
81 0.36
82 0.36
83 0.33
84 0.26
85 0.25
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.36
98 0.45
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.84
104 0.82
105 0.78
106 0.79
107 0.78
108 0.76
109 0.76
110 0.69
111 0.61
112 0.64
113 0.6
114 0.53
115 0.5
116 0.42
117 0.34
118 0.39
119 0.37
120 0.29
121 0.26
122 0.27
123 0.25
124 0.25
125 0.26
126 0.19
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.13
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.1
135 0.14
136 0.16
137 0.16
138 0.18
139 0.22
140 0.28
141 0.33
142 0.39
143 0.42
144 0.43
145 0.5
146 0.51
147 0.46
148 0.4
149 0.36
150 0.29
151 0.22
152 0.19
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.14
165 0.13
166 0.14
167 0.16
168 0.19
169 0.23
170 0.24
171 0.25
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.2
176 0.17
177 0.13
178 0.13
179 0.1
180 0.1
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.18
198 0.22
199 0.29
200 0.31
201 0.33
202 0.36
203 0.39
204 0.4
205 0.39
206 0.43
207 0.39
208 0.38
209 0.36
210 0.33
211 0.32
212 0.29
213 0.27
214 0.19
215 0.16
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.09
232 0.1
233 0.15
234 0.17
235 0.18
236 0.2
237 0.24
238 0.25
239 0.26
240 0.26
241 0.23
242 0.23
243 0.23
244 0.23
245 0.24
246 0.25
247 0.24
248 0.24
249 0.23
250 0.22
251 0.27
252 0.32
253 0.35
254 0.33
255 0.34
256 0.34
257 0.35
258 0.35
259 0.31
260 0.24
261 0.18
262 0.18
263 0.19
264 0.21
265 0.22
266 0.23
267 0.32
268 0.39
269 0.47
270 0.52
271 0.57
272 0.57
273 0.65
274 0.63
275 0.6
276 0.55
277 0.47
278 0.44
279 0.39
280 0.38
281 0.28
282 0.27
283 0.2
284 0.17
285 0.16
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.15
293 0.14
294 0.16
295 0.16
296 0.18
297 0.18
298 0.21
299 0.26
300 0.27
301 0.29
302 0.29
303 0.32
304 0.3
305 0.33
306 0.29
307 0.22
308 0.18
309 0.17
310 0.14
311 0.1
312 0.1
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.1
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.1
344 0.15
345 0.14
346 0.19
347 0.26
348 0.28
349 0.29
350 0.32
351 0.37
352 0.34
353 0.36
354 0.34
355 0.28
356 0.28
357 0.28
358 0.24
359 0.18
360 0.15
361 0.12
362 0.1
363 0.1
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.13
376 0.18
377 0.18
378 0.19
379 0.27
380 0.28
381 0.32
382 0.33
383 0.34
384 0.36
385 0.44
386 0.44
387 0.38
388 0.44
389 0.42
390 0.5
391 0.56
392 0.54
393 0.52
394 0.55
395 0.61
396 0.63
397 0.7
398 0.71
399 0.71
400 0.72
401 0.68
402 0.69
403 0.62
404 0.54
405 0.44
406 0.34
407 0.26
408 0.23
409 0.21
410 0.15
411 0.15
412 0.2
413 0.2
414 0.2
415 0.19
416 0.15
417 0.2
418 0.2
419 0.21
420 0.18
421 0.18
422 0.19
423 0.21
424 0.21
425 0.16
426 0.16
427 0.14
428 0.14
429 0.15
430 0.14
431 0.15
432 0.17
433 0.16
434 0.15
435 0.15
436 0.14
437 0.12
438 0.14
439 0.13
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.19
444 0.18
445 0.17
446 0.14
447 0.13
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.05
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.07
457 0.09
458 0.15
459 0.18
460 0.19
461 0.21
462 0.21
463 0.22
464 0.2
465 0.19
466 0.14
467 0.12
468 0.12
469 0.1
470 0.09
471 0.08
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.1
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.13
481 0.22
482 0.24
483 0.29
484 0.3
485 0.31
486 0.38
487 0.4
488 0.4
489 0.35
490 0.35
491 0.33
492 0.29
493 0.28
494 0.2
495 0.17
496 0.14
497 0.09
498 0.07
499 0.04
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.05
530 0.08
531 0.09
532 0.14
533 0.18
534 0.18
535 0.19
536 0.25
537 0.35
538 0.35
539 0.43
540 0.46
541 0.52
542 0.55
543 0.57
544 0.6
545 0.54
546 0.58
547 0.55
548 0.48
549 0.41
550 0.46
551 0.43
552 0.38
553 0.36
554 0.31
555 0.33
556 0.35
557 0.35
558 0.33
559 0.35
560 0.31
561 0.33
562 0.31
563 0.23
564 0.21
565 0.19
566 0.14
567 0.1
568 0.09
569 0.06
570 0.06
571 0.07
572 0.08
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.15
579 0.19
580 0.21
581 0.23
582 0.23
583 0.28
584 0.3
585 0.33
586 0.3
587 0.26
588 0.23
589 0.2
590 0.2
591 0.16
592 0.14
593 0.12
594 0.1
595 0.12
596 0.17
597 0.16
598 0.15
599 0.17
600 0.17
601 0.2
602 0.23
603 0.22
604 0.18
605 0.2
606 0.23
607 0.22
608 0.24
609 0.24
610 0.23
611 0.22
612 0.24
613 0.21
614 0.19
615 0.2
616 0.19
617 0.15
618 0.16
619 0.16
620 0.14
621 0.13
622 0.13
623 0.12
624 0.12
625 0.12
626 0.09
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.13
631 0.14
632 0.13
633 0.12
634 0.14
635 0.13
636 0.15
637 0.16
638 0.14
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.1
643 0.1
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.09
649 0.09
650 0.11
651 0.1
652 0.1
653 0.11
654 0.13
655 0.14
656 0.13
657 0.15
658 0.15
659 0.16
660 0.16
661 0.16
662 0.15
663 0.13
664 0.13
665 0.13
666 0.14
667 0.15
668 0.15
669 0.13
670 0.14
671 0.13
672 0.12
673 0.1
674 0.09
675 0.08
676 0.1
677 0.09
678 0.1
679 0.16
680 0.21
681 0.26
682 0.32
683 0.36
684 0.37
685 0.41
686 0.45
687 0.4
688 0.38
689 0.41
690 0.4
691 0.37
692 0.34
693 0.32
694 0.31
695 0.37
696 0.38
697 0.35
698 0.32
699 0.32
700 0.35
701 0.41
702 0.47
703 0.43
704 0.42
705 0.44
706 0.45
707 0.46
708 0.47
709 0.43
710 0.37
711 0.35
712 0.35
713 0.36
714 0.35
715 0.39
716 0.45
717 0.52
718 0.59
719 0.67
720 0.74
721 0.71
722 0.71
723 0.71
724 0.68
725 0.66
726 0.63
727 0.6
728 0.6
729 0.59
730 0.64
731 0.67
732 0.61
733 0.6
734 0.54
735 0.48
736 0.43
737 0.4
738 0.33
739 0.27
740 0.32
741 0.25
742 0.24
743 0.21
744 0.17
745 0.15
746 0.15
747 0.14
748 0.11
749 0.15
750 0.16
751 0.17
752 0.17
753 0.18
754 0.21
755 0.19
756 0.2
757 0.19
758 0.24
759 0.29
760 0.36
761 0.36
762 0.35
763 0.35
764 0.33
765 0.35
766 0.29
767 0.25
768 0.17
769 0.17
770 0.16
771 0.16
772 0.15
773 0.11
774 0.1
775 0.11
776 0.13
777 0.13
778 0.15
779 0.14
780 0.17
781 0.18
782 0.2
783 0.19
784 0.2
785 0.23
786 0.22
787 0.24
788 0.25
789 0.24
790 0.22
791 0.25
792 0.29
793 0.26
794 0.25
795 0.23
796 0.22
797 0.21
798 0.22
799 0.24
800 0.21
801 0.23
802 0.25
803 0.26
804 0.24
805 0.25
806 0.24
807 0.21
808 0.25
809 0.28
810 0.32
811 0.4
812 0.49
813 0.58
814 0.65
815 0.72
816 0.73
817 0.73
818 0.73
819 0.72
820 0.72
821 0.71
822 0.72
823 0.64
824 0.65
825 0.64
826 0.6
827 0.55
828 0.47
829 0.4
830 0.31
831 0.34
832 0.28
833 0.24
834 0.22
835 0.23
836 0.24
837 0.27
838 0.29
839 0.28
840 0.26
841 0.3
842 0.34
843 0.32
844 0.3
845 0.29
846 0.27
847 0.25
848 0.27
849 0.27
850 0.25
851 0.25
852 0.29
853 0.3
854 0.32
855 0.31
856 0.33
857 0.34
858 0.31
859 0.35
860 0.34
861 0.37
862 0.39
863 0.38
864 0.34
865 0.31
866 0.33
867 0.29
868 0.33
869 0.27
870 0.26
871 0.29
872 0.32
873 0.31
874 0.3
875 0.34
876 0.29
877 0.3
878 0.36
879 0.34
880 0.37
881 0.34
882 0.34
883 0.3
884 0.28
885 0.28
886 0.22
887 0.25
888 0.2
889 0.2
890 0.19
891 0.18
892 0.19
893 0.17
894 0.18
895 0.15
896 0.17
897 0.16
898 0.23
899 0.24
900 0.27
901 0.28
902 0.25
903 0.24
904 0.23
905 0.24
906 0.2
907 0.23
908 0.21
909 0.21
910 0.26
911 0.3
912 0.36
913 0.38
914 0.39
915 0.35
916 0.37
917 0.36
918 0.34
919 0.31
920 0.26
921 0.24
922 0.2
923 0.19
924 0.17
925 0.17
926 0.14
927 0.14
928 0.16
929 0.16
930 0.17
931 0.16
932 0.19
933 0.22
934 0.26
935 0.29
936 0.27
937 0.29
938 0.29
939 0.3
940 0.28
941 0.26
942 0.26
943 0.29
944 0.37
945 0.37
946 0.39
947 0.38
948 0.39
949 0.41
950 0.42
951 0.42
952 0.37