Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X1R9

Protein Details
Accession A0A4T0X1R9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-356GEGQTLRSAKKRKDKNKSHPPNKNKVRSPEAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-350SAKKRKDKNKSHPPNKNKV
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 13.5, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004854  Ufd1-like  
IPR042299  Ufd1-like_Nn  
Gene Ontology GO:0050896  P:response to stimulus  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF03152  UFD1  
Amino Acid Sequences MFSGFSGGFPQMIPIPQTFKEYFRCYPIKMMKDAGSKDASNYGGKIFLPPSALHKLTMLNIRYPMLFKISSKNTGKFTHSGVLEFTSDEGRCYLPDWMMSTLNISTGHVVSIETTDLAQGQYVKLEPQSTDFLEISDPKAVLENALRNFTTLTVGDIIELNYNNHVYKIKILEVKPESSSGGICVIETDLVTDFAPPVGYVEPDYEKIKEENERKKREQALSAPSLKGKGSMARQINYADMLKDTAGEAMKKFQGGGNRLSGKKVQPEETKEEINTKELDLSGPVRPLELPDGYYFFGFPVKPYVDEFEKAEKEQGVDDRVVFNGEGQTLRSAKKRKDKNKSHPPNKNKVRSPEAIVIDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.22
4 0.29
5 0.29
6 0.31
7 0.37
8 0.41
9 0.42
10 0.45
11 0.49
12 0.44
13 0.52
14 0.56
15 0.54
16 0.51
17 0.52
18 0.5
19 0.54
20 0.54
21 0.49
22 0.44
23 0.39
24 0.37
25 0.37
26 0.33
27 0.27
28 0.25
29 0.21
30 0.19
31 0.19
32 0.2
33 0.17
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.22
38 0.27
39 0.27
40 0.25
41 0.25
42 0.26
43 0.27
44 0.34
45 0.3
46 0.26
47 0.27
48 0.28
49 0.27
50 0.27
51 0.24
52 0.21
53 0.2
54 0.18
55 0.25
56 0.29
57 0.37
58 0.41
59 0.44
60 0.45
61 0.47
62 0.5
63 0.44
64 0.42
65 0.39
66 0.35
67 0.31
68 0.27
69 0.25
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.1
82 0.12
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.12
130 0.15
131 0.15
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.1
155 0.12
156 0.15
157 0.19
158 0.19
159 0.26
160 0.27
161 0.29
162 0.27
163 0.26
164 0.22
165 0.17
166 0.17
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.12
192 0.11
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.21
197 0.28
198 0.37
199 0.45
200 0.53
201 0.55
202 0.62
203 0.67
204 0.63
205 0.61
206 0.57
207 0.54
208 0.53
209 0.52
210 0.46
211 0.39
212 0.36
213 0.3
214 0.25
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.23
219 0.27
220 0.26
221 0.28
222 0.28
223 0.27
224 0.25
225 0.22
226 0.15
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.19
242 0.21
243 0.24
244 0.28
245 0.33
246 0.33
247 0.35
248 0.38
249 0.34
250 0.39
251 0.4
252 0.4
253 0.41
254 0.46
255 0.52
256 0.52
257 0.51
258 0.44
259 0.45
260 0.39
261 0.34
262 0.29
263 0.22
264 0.2
265 0.17
266 0.17
267 0.14
268 0.16
269 0.15
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.18
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.18
280 0.18
281 0.18
282 0.16
283 0.12
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.2
291 0.25
292 0.25
293 0.27
294 0.3
295 0.32
296 0.33
297 0.33
298 0.34
299 0.3
300 0.27
301 0.29
302 0.29
303 0.25
304 0.23
305 0.23
306 0.21
307 0.2
308 0.21
309 0.17
310 0.15
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.13
315 0.18
316 0.19
317 0.22
318 0.29
319 0.36
320 0.43
321 0.53
322 0.62
323 0.69
324 0.77
325 0.85
326 0.88
327 0.92
328 0.94
329 0.95
330 0.95
331 0.95
332 0.95
333 0.94
334 0.93
335 0.91
336 0.88
337 0.86
338 0.8
339 0.77
340 0.74
341 0.68