Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X1D2

Protein Details
Accession A0A4T0X1D2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-180ELSPTRTERKKIKMNLKTKLPTTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 13.999, cyto_nucl 11.666, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MARRVAINLGQRSSTNGTRGRGRFSKRSGQTDSSANSVSKDEHAVAQKDIDFNCGATNTGKIDSDISCTKAEMGTSSEFDSPLSEISDTSRGRKRTMSDIQKEDMEGLLVDVKGIMGFDNFATTKNKHVKGTECYGIKFKQVTEYRQYMNREGGFNRELSPTRTERKKIKMNLKTKLPTTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.34
4 0.36
5 0.44
6 0.46
7 0.49
8 0.51
9 0.55
10 0.57
11 0.58
12 0.65
13 0.63
14 0.68
15 0.67
16 0.64
17 0.59
18 0.56
19 0.51
20 0.44
21 0.39
22 0.32
23 0.26
24 0.23
25 0.21
26 0.17
27 0.17
28 0.15
29 0.17
30 0.21
31 0.22
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.22
37 0.2
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.12
50 0.11
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.13
58 0.13
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.14
75 0.14
76 0.17
77 0.22
78 0.23
79 0.24
80 0.27
81 0.28
82 0.3
83 0.39
84 0.44
85 0.45
86 0.47
87 0.47
88 0.45
89 0.43
90 0.35
91 0.25
92 0.16
93 0.09
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.04
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.12
110 0.13
111 0.21
112 0.29
113 0.32
114 0.33
115 0.36
116 0.41
117 0.42
118 0.48
119 0.46
120 0.4
121 0.38
122 0.4
123 0.38
124 0.36
125 0.31
126 0.26
127 0.29
128 0.32
129 0.36
130 0.38
131 0.42
132 0.42
133 0.47
134 0.5
135 0.44
136 0.46
137 0.43
138 0.4
139 0.36
140 0.38
141 0.33
142 0.3
143 0.29
144 0.27
145 0.26
146 0.26
147 0.31
148 0.31
149 0.39
150 0.46
151 0.51
152 0.55
153 0.63
154 0.69
155 0.73
156 0.78
157 0.8
158 0.81
159 0.83
160 0.85
161 0.82