Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X5R3

Protein Details
Accession A0A4T0X5R3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MGSIRKTKQKKKDFVKPKLKVGKSNVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-20RKTKQKKKDFVKPKLK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSIRKTKQKKKDFVKPKLKVGKSNVPTNATNTDFKAKKINLSRTILIPSDYTKKLSLLKKSTTNVNSRKEILTELITDFEKNSTDLPLDAIISTIRLLFVDQSKKVRSLARDTLSLIIKSNENLILLNQDSLMLFLYSAMTHLKPTIRADSIHILQLLFNNENLRTQILTNHWIRLWNNLLILLNWKSENKSYIEANEDFTQTRLAQLSFINNLLLNGIHSNSESISIPTIQQHDLTSTYLINQTLILNTQTDDNEQTLDINDRVRSFVELFGKTVQSGINDLIKLDNTQISTAATAILNPLSQYNSIYTNLVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.93
3 0.89
4 0.89
5 0.89
6 0.84
7 0.81
8 0.79
9 0.78
10 0.73
11 0.74
12 0.69
13 0.64
14 0.6
15 0.56
16 0.53
17 0.46
18 0.43
19 0.37
20 0.41
21 0.37
22 0.37
23 0.42
24 0.38
25 0.43
26 0.5
27 0.56
28 0.55
29 0.6
30 0.6
31 0.54
32 0.56
33 0.48
34 0.4
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.27
40 0.24
41 0.26
42 0.32
43 0.38
44 0.43
45 0.43
46 0.48
47 0.53
48 0.54
49 0.6
50 0.59
51 0.62
52 0.61
53 0.61
54 0.59
55 0.54
56 0.53
57 0.45
58 0.4
59 0.33
60 0.26
61 0.22
62 0.18
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.07
87 0.12
88 0.17
89 0.19
90 0.24
91 0.26
92 0.27
93 0.3
94 0.32
95 0.3
96 0.33
97 0.38
98 0.36
99 0.36
100 0.35
101 0.37
102 0.35
103 0.31
104 0.24
105 0.18
106 0.16
107 0.14
108 0.15
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.12
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.2
139 0.2
140 0.19
141 0.18
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.1
156 0.11
157 0.17
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.21
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.19
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.14
170 0.17
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.16
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.17
182 0.21
183 0.2
184 0.22
185 0.21
186 0.2
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.13
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.12
239 0.11
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.17
256 0.22
257 0.25
258 0.24
259 0.26
260 0.27
261 0.27
262 0.24
263 0.24
264 0.2
265 0.14
266 0.15
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.17
271 0.18
272 0.18
273 0.17
274 0.17
275 0.18
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.15
294 0.17
295 0.18