Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0WVT0

Protein Details
Accession A0A4T0WVT0    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-435SKSDSKKRKAEEVKPNTNKKAKKBasic
505-529LGRVRGKDFTKGKNKMKRGSYRGGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
418-434KKRKAEEVKPNTNKKAK
511-522KDFTKGKNKMKR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAAVSKKGKGANSKSVTSADKKALEEKNVSSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSDSSSSSSSESGSESDSSSDSSSDSDEEDGEDAKKDNTDEKLQTTKEKESKVNEVSKSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSDSDSSDTQNTQNKTEIEQTEKDNDVEMKDVTNSAESSSSSSSSESSSSSSSDSSSDSDSSSDSDDSEDDSNAKPVLDDKNTTTVQETEIKSLASSSSESSSSSSESSDSSDDSGSESDDESSDSDTEPKDEMKLEDKQTSTTDTKSESSSSSSNSSSDSDSSSDSSSSSSSSDSSSDSSSSSSSSDSSSDSDSSSSSDSSSDSDSNSSSDSDSDSSSDSDSDSDSDSDSDSDSDSSSDSDSDSDSSSDSSSDYSSDSDSDSSSDSDSKSDSKKRKAEEVKPNTNKKAKKDIIDSENQESSRTQTPETYIPATVIEEKPGERHHFSRIERTKVAFAGEEVMDNTYKGAAGTWGELANEKLGRVRGKDFTKGKNKMKRGSYRGGSITLGVGSFKFQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.55
3 0.55
4 0.5
5 0.48
6 0.44
7 0.43
8 0.43
9 0.49
10 0.5
11 0.5
12 0.5
13 0.46
14 0.48
15 0.45
16 0.44
17 0.38
18 0.33
19 0.31
20 0.3
21 0.29
22 0.22
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.2
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.13
84 0.13
85 0.17
86 0.2
87 0.26
88 0.27
89 0.31
90 0.38
91 0.38
92 0.44
93 0.44
94 0.49
95 0.49
96 0.51
97 0.52
98 0.5
99 0.57
100 0.57
101 0.6
102 0.53
103 0.5
104 0.49
105 0.45
106 0.43
107 0.36
108 0.3
109 0.25
110 0.24
111 0.23
112 0.2
113 0.19
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.16
141 0.22
142 0.23
143 0.23
144 0.27
145 0.26
146 0.28
147 0.33
148 0.32
149 0.31
150 0.32
151 0.33
152 0.33
153 0.33
154 0.31
155 0.26
156 0.24
157 0.19
158 0.18
159 0.16
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.1
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.17
212 0.23
213 0.23
214 0.24
215 0.22
216 0.18
217 0.18
218 0.23
219 0.22
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.16
224 0.16
225 0.14
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.13
266 0.18
267 0.19
268 0.22
269 0.22
270 0.23
271 0.23
272 0.26
273 0.24
274 0.2
275 0.18
276 0.17
277 0.18
278 0.18
279 0.18
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.14
290 0.14
291 0.13
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.17
401 0.23
402 0.31
403 0.39
404 0.46
405 0.53
406 0.56
407 0.65
408 0.7
409 0.74
410 0.76
411 0.78
412 0.79
413 0.82
414 0.87
415 0.85
416 0.83
417 0.79
418 0.74
419 0.75
420 0.7
421 0.67
422 0.67
423 0.67
424 0.65
425 0.68
426 0.65
427 0.6
428 0.58
429 0.51
430 0.44
431 0.36
432 0.33
433 0.32
434 0.3
435 0.26
436 0.24
437 0.27
438 0.3
439 0.34
440 0.32
441 0.25
442 0.24
443 0.23
444 0.23
445 0.25
446 0.21
447 0.19
448 0.18
449 0.19
450 0.21
451 0.27
452 0.31
453 0.3
454 0.32
455 0.37
456 0.43
457 0.46
458 0.54
459 0.56
460 0.58
461 0.57
462 0.58
463 0.54
464 0.47
465 0.46
466 0.36
467 0.28
468 0.25
469 0.21
470 0.19
471 0.15
472 0.16
473 0.14
474 0.13
475 0.13
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.1
483 0.12
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.17
489 0.16
490 0.15
491 0.17
492 0.22
493 0.26
494 0.28
495 0.33
496 0.37
497 0.41
498 0.5
499 0.54
500 0.59
501 0.66
502 0.72
503 0.77
504 0.79
505 0.83
506 0.82
507 0.85
508 0.85
509 0.83
510 0.83
511 0.79
512 0.76
513 0.7
514 0.64
515 0.55
516 0.45
517 0.38
518 0.29
519 0.23
520 0.16
521 0.13