Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X6A4

Protein Details
Accession A0A4T0X6A4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-31TATKSTTTKAAKKPATKRKTGKSVTTPVNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-20AKKPATKRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.333, mito 4.5, cyto_mito 4.166, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
IPR000594  ThiF_NAD_FAD-bd  
IPR023318  Ub_act_enz_dom_a_sf  
IPR035985  Ubiquitin-activating_enz  
IPR033127  UBQ-activ_enz_E1_Cys_AS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0019781  F:NEDD8 activating enzyme activity  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0045116  P:protein neddylation  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
PF00899  ThiF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00865  UBIQUITIN_ACTIVAT_2  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MTATKSTTTKAAKKPATKRKTGKSVTTPVNSAGSEITKTPQKDRYINQENNEYDDSYDLKKGLDLSPAKRNAYHGSANGSVAFDPPRDKSRYKYRVEIQQMMFVSGETNDPPERTTDLIEDIVRDQVVSLVILAHKTAYARGQKSLLPEDLIFVIRHDKAKVNRLRTYLSWKDVRKGTKDQDSADIAGNGGGGDLLEDAVSGGAAAGTAPAVDGKILATKQKRTLKLPWELEFMFQEQPLTLGKDEEDKIDEAEREAVLAQLKRLRQNDERTKNMTQEEYVHWSECRQASFTFRKSKRFREWCGMPQITDSRPNDDVIDILGFLTFELVCSITEEALKVKNALDKSAEEHASHRYLFMEPSNDNRPISVEHVQEAWRRLQMSSYDKKALYNFRGGRILRGRSMHAGIGYITELTMVSYDGILEQRGPFTDDEFDTKVAYEELNQANVLVIGAGGLGCEILKDLAMSGICKISVIDMDTIELTNLNRQFLFRNKDVGKSKAIVASEAILEKVKGIEIKPFYNKIQDFDDTFYRQFTIIVCGLDSIEARRWINSKIVNIALNYDQIIPIIDGGTEGFQGSVKLIIPTITACFECYMPLIPEKVTYPLCTLASTPRLPEHCIEWAHQLKWEEEYPGISFDADNVDHIERMYKLALNRAKEFGIDGVTKTKTLGVVKNIIPAIASTNAIISGQCCNEVFKFLTSCNPNMKDSLFYNGEIGALCETDEYLKLPNCQVCGIKVEDLVIDDNKTTVREVAEIIKNELDLENPVLMIGGKEIFNFKTVNVSRDSERLIIEFGDCVIFEVIDKTIENSLKVKVTINKSDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.82
3 0.83
4 0.85
5 0.86
6 0.86
7 0.88
8 0.85
9 0.84
10 0.83
11 0.83
12 0.82
13 0.77
14 0.68
15 0.6
16 0.56
17 0.46
18 0.38
19 0.31
20 0.24
21 0.21
22 0.2
23 0.21
24 0.24
25 0.27
26 0.32
27 0.38
28 0.43
29 0.49
30 0.54
31 0.6
32 0.65
33 0.69
34 0.67
35 0.69
36 0.63
37 0.61
38 0.57
39 0.47
40 0.37
41 0.32
42 0.3
43 0.23
44 0.24
45 0.19
46 0.17
47 0.17
48 0.2
49 0.2
50 0.26
51 0.29
52 0.32
53 0.41
54 0.47
55 0.48
56 0.46
57 0.48
58 0.45
59 0.45
60 0.45
61 0.38
62 0.38
63 0.37
64 0.37
65 0.34
66 0.29
67 0.23
68 0.2
69 0.19
70 0.15
71 0.16
72 0.19
73 0.25
74 0.3
75 0.32
76 0.39
77 0.48
78 0.57
79 0.59
80 0.65
81 0.65
82 0.7
83 0.76
84 0.76
85 0.67
86 0.64
87 0.58
88 0.5
89 0.43
90 0.32
91 0.25
92 0.16
93 0.16
94 0.1
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.17
104 0.18
105 0.2
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.1
125 0.16
126 0.23
127 0.25
128 0.28
129 0.3
130 0.31
131 0.36
132 0.39
133 0.33
134 0.28
135 0.26
136 0.24
137 0.24
138 0.23
139 0.18
140 0.14
141 0.18
142 0.17
143 0.2
144 0.2
145 0.25
146 0.29
147 0.39
148 0.46
149 0.49
150 0.52
151 0.53
152 0.56
153 0.52
154 0.56
155 0.53
156 0.51
157 0.52
158 0.48
159 0.52
160 0.54
161 0.56
162 0.53
163 0.55
164 0.56
165 0.58
166 0.59
167 0.54
168 0.53
169 0.5
170 0.46
171 0.39
172 0.32
173 0.22
174 0.18
175 0.16
176 0.1
177 0.07
178 0.05
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.07
203 0.08
204 0.15
205 0.2
206 0.24
207 0.34
208 0.42
209 0.46
210 0.48
211 0.56
212 0.57
213 0.62
214 0.64
215 0.57
216 0.54
217 0.5
218 0.46
219 0.39
220 0.34
221 0.25
222 0.19
223 0.17
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.1
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.17
238 0.17
239 0.13
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.16
249 0.19
250 0.25
251 0.28
252 0.33
253 0.37
254 0.47
255 0.55
256 0.59
257 0.62
258 0.61
259 0.61
260 0.58
261 0.53
262 0.44
263 0.34
264 0.3
265 0.28
266 0.28
267 0.27
268 0.24
269 0.22
270 0.21
271 0.24
272 0.23
273 0.21
274 0.17
275 0.17
276 0.23
277 0.3
278 0.36
279 0.42
280 0.43
281 0.53
282 0.57
283 0.65
284 0.69
285 0.7
286 0.69
287 0.68
288 0.71
289 0.68
290 0.71
291 0.63
292 0.52
293 0.46
294 0.44
295 0.37
296 0.38
297 0.32
298 0.26
299 0.26
300 0.27
301 0.24
302 0.21
303 0.19
304 0.12
305 0.11
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.04
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.14
332 0.16
333 0.2
334 0.2
335 0.17
336 0.18
337 0.2
338 0.2
339 0.2
340 0.17
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.12
347 0.17
348 0.21
349 0.21
350 0.21
351 0.2
352 0.19
353 0.17
354 0.21
355 0.21
356 0.18
357 0.17
358 0.18
359 0.2
360 0.22
361 0.22
362 0.19
363 0.16
364 0.17
365 0.16
366 0.16
367 0.19
368 0.24
369 0.27
370 0.29
371 0.31
372 0.31
373 0.32
374 0.33
375 0.34
376 0.29
377 0.33
378 0.31
379 0.3
380 0.36
381 0.34
382 0.36
383 0.36
384 0.36
385 0.3
386 0.3
387 0.29
388 0.25
389 0.26
390 0.21
391 0.15
392 0.13
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.04
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.11
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.09
435 0.04
436 0.03
437 0.02
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.02
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.07
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.1
470 0.1
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.14
475 0.2
476 0.26
477 0.23
478 0.3
479 0.31
480 0.38
481 0.42
482 0.42
483 0.38
484 0.33
485 0.34
486 0.28
487 0.27
488 0.2
489 0.16
490 0.14
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.13
502 0.15
503 0.19
504 0.23
505 0.26
506 0.26
507 0.32
508 0.33
509 0.29
510 0.3
511 0.28
512 0.26
513 0.26
514 0.29
515 0.24
516 0.24
517 0.22
518 0.19
519 0.17
520 0.16
521 0.14
522 0.14
523 0.13
524 0.12
525 0.12
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.08
531 0.1
532 0.13
533 0.13
534 0.15
535 0.17
536 0.18
537 0.23
538 0.24
539 0.23
540 0.23
541 0.25
542 0.25
543 0.24
544 0.24
545 0.2
546 0.17
547 0.16
548 0.13
549 0.11
550 0.09
551 0.09
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.05
556 0.04
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.1
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.13
586 0.14
587 0.17
588 0.17
589 0.17
590 0.17
591 0.19
592 0.19
593 0.19
594 0.19
595 0.2
596 0.24
597 0.23
598 0.23
599 0.25
600 0.26
601 0.28
602 0.28
603 0.26
604 0.26
605 0.27
606 0.27
607 0.3
608 0.33
609 0.32
610 0.35
611 0.33
612 0.29
613 0.3
614 0.3
615 0.23
616 0.18
617 0.2
618 0.17
619 0.16
620 0.16
621 0.12
622 0.11
623 0.1
624 0.13
625 0.11
626 0.11
627 0.12
628 0.12
629 0.12
630 0.13
631 0.14
632 0.11
633 0.13
634 0.14
635 0.14
636 0.14
637 0.23
638 0.28
639 0.3
640 0.32
641 0.33
642 0.32
643 0.29
644 0.29
645 0.21
646 0.21
647 0.17
648 0.16
649 0.19
650 0.19
651 0.19
652 0.18
653 0.19
654 0.18
655 0.21
656 0.25
657 0.25
658 0.3
659 0.31
660 0.36
661 0.35
662 0.31
663 0.27
664 0.22
665 0.21
666 0.16
667 0.15
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.08
674 0.1
675 0.1
676 0.12
677 0.12
678 0.14
679 0.15
680 0.19
681 0.19
682 0.18
683 0.2
684 0.19
685 0.27
686 0.29
687 0.32
688 0.38
689 0.39
690 0.38
691 0.38
692 0.38
693 0.34
694 0.31
695 0.35
696 0.28
697 0.25
698 0.24
699 0.22
700 0.22
701 0.17
702 0.17
703 0.1
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.08
710 0.08
711 0.12
712 0.15
713 0.18
714 0.23
715 0.25
716 0.26
717 0.28
718 0.29
719 0.26
720 0.27
721 0.28
722 0.25
723 0.22
724 0.22
725 0.19
726 0.19
727 0.2
728 0.17
729 0.15
730 0.13
731 0.14
732 0.14
733 0.14
734 0.14
735 0.13
736 0.13
737 0.13
738 0.15
739 0.22
740 0.28
741 0.29
742 0.3
743 0.29
744 0.28
745 0.28
746 0.26
747 0.19
748 0.15
749 0.15
750 0.13
751 0.12
752 0.11
753 0.1
754 0.1
755 0.09
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.13
761 0.13
762 0.15
763 0.16
764 0.14
765 0.23
766 0.25
767 0.27
768 0.29
769 0.32
770 0.33
771 0.36
772 0.39
773 0.31
774 0.3
775 0.28
776 0.25
777 0.22
778 0.2
779 0.16
780 0.13
781 0.12
782 0.1
783 0.11
784 0.1
785 0.09
786 0.09
787 0.1
788 0.1
789 0.11
790 0.11
791 0.12
792 0.17
793 0.19
794 0.21
795 0.21
796 0.25
797 0.27
798 0.28
799 0.32
800 0.34
801 0.4