Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X1R6

Protein Details
Accession A0A4T0X1R6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
351-379GYPPPVVEKKVKKVKNRGSKYPGSKDEKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-373KKVKKVKNRGSKYPG
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 14.333, nucl 6, mito_nucl 4.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MTDLTPEQKYELITRDLQEVLNPQIIKDILQEERRTLKVYWGTAPTGKPHCGYFVPMVKLAHLLKAGVEVTVLIADLHAFLDNMKAPLEVVQYRAKYYEWVIKSILKSINVPIAKLKFVLGSSYELKPEYTMDLFKLSNIVSQNDAKRAGADVVKQVANPLLSGLIYPLMQVLDEEYLGVDVQLGGVDQRKIFVLAEENIQALGYKKRAHLMNRMVPGLMQGGKMSASDPNSKIDLLEEPKIVKKKISQAFCAPGNIEDNGLLAFVKNVVGPIYELKHGDNKFEFFIDRPEKYGGPITYTTYQDLEDAFKNEELSPVDLKSGVADAINGLLAPIIEEYKNTTEFQEAENKGYPPPVVEKKVKKVKNRGSKYPGSKDEKSESAPKAEKVDQVAEQLEKSNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.31
4 0.29
5 0.27
6 0.26
7 0.25
8 0.27
9 0.25
10 0.22
11 0.25
12 0.25
13 0.23
14 0.22
15 0.23
16 0.24
17 0.31
18 0.33
19 0.33
20 0.39
21 0.4
22 0.4
23 0.36
24 0.38
25 0.38
26 0.39
27 0.4
28 0.38
29 0.4
30 0.4
31 0.42
32 0.41
33 0.4
34 0.39
35 0.35
36 0.32
37 0.33
38 0.3
39 0.32
40 0.32
41 0.34
42 0.34
43 0.36
44 0.36
45 0.32
46 0.36
47 0.33
48 0.28
49 0.21
50 0.18
51 0.15
52 0.17
53 0.17
54 0.12
55 0.11
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.16
76 0.14
77 0.16
78 0.22
79 0.22
80 0.23
81 0.24
82 0.22
83 0.2
84 0.23
85 0.28
86 0.23
87 0.25
88 0.26
89 0.29
90 0.3
91 0.34
92 0.34
93 0.26
94 0.26
95 0.26
96 0.31
97 0.27
98 0.27
99 0.26
100 0.25
101 0.24
102 0.23
103 0.22
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.12
108 0.15
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.19
130 0.21
131 0.22
132 0.23
133 0.2
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.16
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.09
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.03
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.16
195 0.2
196 0.23
197 0.3
198 0.36
199 0.4
200 0.41
201 0.4
202 0.36
203 0.32
204 0.29
205 0.23
206 0.16
207 0.1
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.14
216 0.15
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.21
228 0.25
229 0.24
230 0.22
231 0.23
232 0.31
233 0.36
234 0.39
235 0.39
236 0.4
237 0.45
238 0.44
239 0.41
240 0.32
241 0.26
242 0.24
243 0.2
244 0.15
245 0.11
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.2
265 0.2
266 0.24
267 0.24
268 0.23
269 0.23
270 0.23
271 0.23
272 0.16
273 0.25
274 0.27
275 0.25
276 0.26
277 0.28
278 0.27
279 0.28
280 0.34
281 0.25
282 0.24
283 0.24
284 0.26
285 0.27
286 0.28
287 0.28
288 0.22
289 0.22
290 0.18
291 0.18
292 0.17
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.18
298 0.17
299 0.19
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.15
307 0.12
308 0.11
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.11
325 0.15
326 0.17
327 0.17
328 0.18
329 0.19
330 0.2
331 0.22
332 0.28
333 0.26
334 0.29
335 0.32
336 0.32
337 0.3
338 0.31
339 0.28
340 0.21
341 0.28
342 0.32
343 0.35
344 0.44
345 0.51
346 0.6
347 0.7
348 0.75
349 0.76
350 0.79
351 0.83
352 0.85
353 0.85
354 0.85
355 0.84
356 0.86
357 0.86
358 0.85
359 0.84
360 0.81
361 0.77
362 0.74
363 0.71
364 0.66
365 0.61
366 0.6
367 0.53
368 0.54
369 0.54
370 0.5
371 0.5
372 0.5
373 0.48
374 0.44
375 0.46
376 0.39
377 0.38
378 0.39
379 0.34
380 0.31