Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X6X5

Protein Details
Accession A0A4T0X6X5    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-57LVPIIDKKKKSTKIRATAAEDLKHydrophilic
289-316KGLKSANTKSSKKKAKRKKGTTTDTSSYHydrophilic
375-396NYQLEKRGKRVVKKNEEMERYRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-307ANTKSSKKKAKRKK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSRRFDKNNSVKFQVVHRSQQDSRYYDDDASSTVLVPIIDKKKKSTKIRATAAEDLKEIESQLKKDEGKAALYGIAYDDTEYDYLQHLKPIGSGEGIFISKKEVIDPKVKNAKLAALLDDSVLPGEERAYNYQSQQDVPDEIAGFKPDLNPDLREALIALEDENYLDQEQDIDEIDVFEELLGGEGHRKKEISLKEYDQFDDEFYDDDYQDDDWDYDNFEEHEGQFEGIEESNEGNGFNWENDYAKYKNTRGRIADEYDSDSDYDESENDDFENENADFVGDLPNIGEKGLKSANTKSSKKKAKRKKGTTTDTSSYSMSSSALCRTEQMTIIDDKFDVLREQYDNMDEEEEEYEPFDIATERDDFMDLVDDFLDNYQLEKRGKRVVKKNEEMERYRLAAMSVTKDNSRVKNRNLANKSLTLSEEMNKLKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.56
3 0.56
4 0.54
5 0.57
6 0.57
7 0.63
8 0.63
9 0.56
10 0.54
11 0.49
12 0.47
13 0.4
14 0.38
15 0.3
16 0.24
17 0.23
18 0.19
19 0.16
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.19
25 0.26
26 0.32
27 0.34
28 0.41
29 0.5
30 0.6
31 0.69
32 0.72
33 0.73
34 0.77
35 0.84
36 0.85
37 0.82
38 0.81
39 0.76
40 0.67
41 0.56
42 0.48
43 0.4
44 0.32
45 0.26
46 0.23
47 0.21
48 0.2
49 0.23
50 0.28
51 0.27
52 0.3
53 0.36
54 0.32
55 0.3
56 0.3
57 0.27
58 0.23
59 0.22
60 0.2
61 0.14
62 0.12
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.1
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.17
77 0.18
78 0.16
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.1
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.16
90 0.19
91 0.23
92 0.32
93 0.34
94 0.41
95 0.49
96 0.49
97 0.47
98 0.42
99 0.41
100 0.37
101 0.36
102 0.28
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.14
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.09
115 0.12
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.22
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.17
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.11
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.11
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.08
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.2
178 0.25
179 0.25
180 0.27
181 0.3
182 0.34
183 0.35
184 0.35
185 0.29
186 0.25
187 0.21
188 0.17
189 0.14
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.19
234 0.22
235 0.27
236 0.3
237 0.35
238 0.34
239 0.38
240 0.39
241 0.39
242 0.37
243 0.33
244 0.33
245 0.28
246 0.26
247 0.21
248 0.17
249 0.13
250 0.11
251 0.1
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.1
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.06
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.21
281 0.3
282 0.37
283 0.43
284 0.48
285 0.56
286 0.64
287 0.71
288 0.78
289 0.8
290 0.83
291 0.89
292 0.91
293 0.92
294 0.92
295 0.91
296 0.88
297 0.85
298 0.78
299 0.7
300 0.62
301 0.51
302 0.41
303 0.32
304 0.24
305 0.16
306 0.13
307 0.11
308 0.12
309 0.14
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.17
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.19
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.12
325 0.1
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.15
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.15
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.07
362 0.09
363 0.12
364 0.17
365 0.22
366 0.24
367 0.28
368 0.37
369 0.44
370 0.53
371 0.6
372 0.65
373 0.72
374 0.78
375 0.83
376 0.83
377 0.84
378 0.79
379 0.74
380 0.68
381 0.59
382 0.51
383 0.43
384 0.33
385 0.29
386 0.27
387 0.27
388 0.27
389 0.27
390 0.27
391 0.32
392 0.39
393 0.44
394 0.52
395 0.55
396 0.56
397 0.63
398 0.69
399 0.75
400 0.73
401 0.72
402 0.67
403 0.63
404 0.6
405 0.53
406 0.47
407 0.39
408 0.36
409 0.32
410 0.34