FuNGI

A0A4T0X0C6

Protein Details

Accession

A0A4T0X0C6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
281-300	RDVSKSKKSKQPVTRRKVFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
280-292	KRDVSKSKKSKQP
468-468	K

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.499, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MSLVLSVEETNRLREKAGLRPIPVPVSSSKNEKHLSNGGGSVSKSSLIELSVSETNQLRLKLGLKPIPEEEIDQELQNYAVLQRTTQEKENVANLKSKLDKTKNEIKNSRRLASGGILDRMSTGKTEVLDFDTWLDKIGNEVKIGNIKRLRFKPAKQQTEQAIEPASIKISHDKEQFSEELTKVKQIILTAKDVNVLDDDNDEFENTILKKESEIKSTHKEINNNGKLVALEDGNKTGTFVLKEGDKLEAPVKRKLETLNLELDDNDSDDEGKRMNKFMKRDVSKSKKSKQPVTRRKVFDTVPVSKEFEPLKLDESEGDDDDDELDKVLEEQRKNIFSKSKKILAPVDEVKRDGELFDERLDFIENLQVDQDDSKQESLQNLPIQPKPSEIGVTIGSDRYHKLLESEESNHNTLGVSEILSVLKSNGKLQEGKSESSMDIKYTDDNGKELSTKEAFKYMSRKFHGSRKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.35
3	0.38
4	0.47
5	0.48
6	0.47
7	0.49
8	0.52
9	0.49
10	0.46
11	0.39
12	0.33
13	0.34
14	0.34
15	0.39
16	0.38
17	0.42
18	0.45
19	0.44
20	0.46
21	0.46
22	0.45
23	0.4
24	0.39
25	0.33
26	0.32
27	0.31
28	0.27
29	0.21
30	0.19
31	0.16
32	0.15
33	0.14
34	0.11
35	0.12
36	0.1
37	0.14
38	0.15
39	0.15
40	0.17
41	0.17
42	0.2
43	0.22
44	0.23
45	0.19
46	0.2
47	0.22
48	0.25
49	0.32
50	0.33
51	0.32
52	0.35
53	0.36
54	0.36
55	0.34
56	0.3
57	0.25
58	0.26
59	0.26
60	0.22
61	0.21
62	0.18
63	0.17
64	0.15
65	0.12
66	0.08
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.13
71	0.19
72	0.23
73	0.27
74	0.3
75	0.28
76	0.31
77	0.38
78	0.4
79	0.36
80	0.38
81	0.35
82	0.37
83	0.39
84	0.41
85	0.44
86	0.46
87	0.5
88	0.51
89	0.61
90	0.63
91	0.69
92	0.73
93	0.69
94	0.72
95	0.72
96	0.68
97	0.58
98	0.51
99	0.43
100	0.38
101	0.38
102	0.31
103	0.27
104	0.24
105	0.22
106	0.22
107	0.2
108	0.17
109	0.12
110	0.1
111	0.09
112	0.1
113	0.11
114	0.11
115	0.14
116	0.14
117	0.14
118	0.14
119	0.14
120	0.13
121	0.14
122	0.13
123	0.09
124	0.11
125	0.16
126	0.16
127	0.15
128	0.15
129	0.15
130	0.22
131	0.23
132	0.28
133	0.28
134	0.3
135	0.38
136	0.41
137	0.49
138	0.49
139	0.52
140	0.56
141	0.62
142	0.68
143	0.62
144	0.64
145	0.61
146	0.6
147	0.56
148	0.46
149	0.36
150	0.27
151	0.25
152	0.2
153	0.15
154	0.09
155	0.1
156	0.15
157	0.17
158	0.22
159	0.25
160	0.26
161	0.26
162	0.29
163	0.29
164	0.25
165	0.26
166	0.2
167	0.21
168	0.2
169	0.21
170	0.18
171	0.18
172	0.17
173	0.14
174	0.19
175	0.17
176	0.2
177	0.19
178	0.19
179	0.21
180	0.2
181	0.19
182	0.14
183	0.12
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.09
193	0.08
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.17
199	0.19
200	0.21
201	0.24
202	0.27
203	0.32
204	0.36
205	0.41
206	0.37
207	0.38
208	0.4
209	0.49
210	0.48
211	0.43
212	0.38
213	0.33
214	0.29
215	0.27
216	0.21
217	0.11
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.1
233	0.09
234	0.1
235	0.13
236	0.16
237	0.19
238	0.23
239	0.24
240	0.24
241	0.25
242	0.25
243	0.29
244	0.29
245	0.28
246	0.27
247	0.26
248	0.25
249	0.24
250	0.23
251	0.16
252	0.13
253	0.1
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.09
260	0.1
261	0.13
262	0.19
263	0.23
264	0.26
265	0.33
266	0.42
267	0.44
268	0.49
269	0.57
270	0.6
271	0.66
272	0.72
273	0.73
274	0.7
275	0.73
276	0.77
277	0.76
278	0.78
279	0.79
280	0.8
281	0.81
282	0.78
283	0.76
284	0.71
285	0.62
286	0.59
287	0.55
288	0.52
289	0.45
290	0.43
291	0.41
292	0.36
293	0.39
294	0.32
295	0.26
296	0.23
297	0.2
298	0.21
299	0.18
300	0.18
301	0.15
302	0.17
303	0.17
304	0.15
305	0.15
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.12
310	0.09
311	0.07
312	0.06
313	0.05
314	0.06
315	0.12
316	0.16
317	0.16
318	0.2
319	0.25
320	0.3
321	0.32
322	0.35
323	0.39
324	0.38
325	0.47
326	0.49
327	0.52
328	0.49
329	0.53
330	0.53
331	0.48
332	0.5
333	0.49
334	0.49
335	0.43
336	0.42
337	0.38
338	0.34
339	0.3
340	0.23
341	0.18
342	0.15
343	0.14
344	0.15
345	0.16
346	0.15
347	0.15
348	0.17
349	0.15
350	0.12
351	0.15
352	0.13
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.1
357	0.11
358	0.13
359	0.11
360	0.13
361	0.14
362	0.15
363	0.16
364	0.19
365	0.2
366	0.25
367	0.26
368	0.28
369	0.32
370	0.34
371	0.36
372	0.34
373	0.34
374	0.3
375	0.27
376	0.25
377	0.21
378	0.2
379	0.17
380	0.19
381	0.17
382	0.17
383	0.16
384	0.16
385	0.17
386	0.17
387	0.16
388	0.14
389	0.15
390	0.17
391	0.21
392	0.24
393	0.28
394	0.32
395	0.36
396	0.37
397	0.35
398	0.31
399	0.27
400	0.22
401	0.19
402	0.13
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.09
410	0.13
411	0.13
412	0.17
413	0.21
414	0.25
415	0.29
416	0.3
417	0.39
418	0.39
419	0.4
420	0.38
421	0.36
422	0.33
423	0.34
424	0.33
425	0.24
426	0.21
427	0.2
428	0.21
429	0.23
430	0.28
431	0.23
432	0.24
433	0.25
434	0.26
435	0.27
436	0.25
437	0.27
438	0.26
439	0.28
440	0.28
441	0.32
442	0.32
443	0.36
444	0.44
445	0.46
446	0.51
447	0.54
448	0.6
449	0.59

A0A4T0X0C6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer