Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X4J9

Protein Details
Accession A0A4T0X4J9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-179LDKFVKKVEKWERNVYQKRGHydrophilic
191-210HEKNRQFNQKLKRHLSKIEKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MQNDLSDRIKELKALRNKAVLENRREVYSEVSERKEKIVKEITQDDVLDTGKEAARNDAEFSSKEKLNSNIKDLEYTAEETEEWLKSRGRDQSTNDDNTEAHNFKILAAKTYNKNLKELEKSGLKRKEEYIKEKIVYSQLKAQGLSEAEIRSKMTSTENLDKFVKKVEKWERNVYQKRGKVEKEGIDSAIHEKNRQFNQKLKRHLSKIEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.51
3 0.53
4 0.54
5 0.58
6 0.62
7 0.61
8 0.58
9 0.59
10 0.56
11 0.52
12 0.51
13 0.44
14 0.38
15 0.37
16 0.38
17 0.35
18 0.38
19 0.4
20 0.4
21 0.44
22 0.44
23 0.37
24 0.38
25 0.42
26 0.4
27 0.43
28 0.46
29 0.44
30 0.41
31 0.41
32 0.33
33 0.26
34 0.23
35 0.17
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.17
47 0.16
48 0.19
49 0.21
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.27
54 0.34
55 0.35
56 0.36
57 0.36
58 0.35
59 0.34
60 0.32
61 0.28
62 0.2
63 0.2
64 0.16
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.17
75 0.22
76 0.25
77 0.29
78 0.32
79 0.4
80 0.44
81 0.46
82 0.42
83 0.36
84 0.32
85 0.29
86 0.29
87 0.2
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.18
93 0.16
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.26
99 0.31
100 0.27
101 0.29
102 0.29
103 0.33
104 0.34
105 0.34
106 0.3
107 0.32
108 0.34
109 0.41
110 0.46
111 0.42
112 0.39
113 0.42
114 0.47
115 0.47
116 0.51
117 0.48
118 0.48
119 0.47
120 0.46
121 0.43
122 0.41
123 0.36
124 0.3
125 0.31
126 0.29
127 0.3
128 0.29
129 0.27
130 0.23
131 0.22
132 0.21
133 0.17
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.16
143 0.22
144 0.31
145 0.31
146 0.34
147 0.37
148 0.36
149 0.34
150 0.38
151 0.37
152 0.29
153 0.38
154 0.45
155 0.52
156 0.57
157 0.67
158 0.67
159 0.72
160 0.8
161 0.79
162 0.78
163 0.73
164 0.75
165 0.74
166 0.68
167 0.65
168 0.64
169 0.62
170 0.59
171 0.57
172 0.5
173 0.42
174 0.4
175 0.37
176 0.35
177 0.3
178 0.26
179 0.28
180 0.35
181 0.43
182 0.51
183 0.51
184 0.53
185 0.63
186 0.69
187 0.76
188 0.78
189 0.79
190 0.76