Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X410

Protein Details
Accession A0A4T0X410    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
419-439VAVGRGSKKRKLNNKSVSESAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, cyto 8, cyto_mito 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSKFVPNLNITENEWAILRLPSGARKLIQLRIDGVINMGKFGAFNVSDVIGFPYGQAFEISSENKLIPIESIDIGITDLAELDSEELLNGSSVDNRELLDVANVQKLTVEQIEEMKNKVGGNDIARELIQKMVQNHGSFDKKTSYSQEKYLDRKHKKFLRRFSISYLTSNEMLDYLFYEKEPFKIMNLSIEMLGLMMSIGNVMPGGNYLVVDETGGLIVYAMLERMGGRGSITLLHENDQPSMHLLNKTRFAKEMSLTPTSMVQCINVLQFLEPESEKPDVEELSKEEYAKLEEPMKTQYDRKLNKAKILQNVINRVLDKSFESLIYVSTLNPATFVPQILPRLRGSSPLVIYNMYKESLVELNHQFLRQKSILLPNIHHSVVRRYQTIPGKIHPLMTSRCDGGYILTGILVFPIENVVAVGRGSKKRKLNNKSVSESAESTPAVETPEVETPEIASVETPVINE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.18
4 0.16
5 0.14
6 0.12
7 0.15
8 0.2
9 0.23
10 0.26
11 0.26
12 0.32
13 0.37
14 0.4
15 0.42
16 0.39
17 0.37
18 0.36
19 0.36
20 0.3
21 0.27
22 0.24
23 0.19
24 0.17
25 0.15
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.14
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.16
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.09
45 0.1
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.16
52 0.16
53 0.14
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.08
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.16
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.14
96 0.13
97 0.1
98 0.15
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.21
103 0.22
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.17
108 0.18
109 0.2
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.21
120 0.25
121 0.24
122 0.26
123 0.29
124 0.31
125 0.29
126 0.3
127 0.29
128 0.26
129 0.29
130 0.34
131 0.36
132 0.35
133 0.4
134 0.45
135 0.47
136 0.53
137 0.6
138 0.63
139 0.65
140 0.68
141 0.72
142 0.72
143 0.76
144 0.78
145 0.79
146 0.78
147 0.76
148 0.73
149 0.69
150 0.69
151 0.61
152 0.54
153 0.47
154 0.39
155 0.32
156 0.3
157 0.23
158 0.15
159 0.13
160 0.1
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.04
182 0.03
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.02
205 0.02
206 0.03
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.06
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.15
233 0.17
234 0.24
235 0.26
236 0.26
237 0.26
238 0.27
239 0.26
240 0.24
241 0.27
242 0.24
243 0.24
244 0.23
245 0.22
246 0.23
247 0.21
248 0.21
249 0.15
250 0.11
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.15
272 0.16
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.21
283 0.23
284 0.23
285 0.26
286 0.3
287 0.36
288 0.38
289 0.45
290 0.51
291 0.51
292 0.55
293 0.6
294 0.59
295 0.57
296 0.6
297 0.57
298 0.52
299 0.55
300 0.51
301 0.45
302 0.4
303 0.33
304 0.27
305 0.23
306 0.19
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.13
326 0.19
327 0.2
328 0.23
329 0.21
330 0.25
331 0.25
332 0.27
333 0.27
334 0.27
335 0.27
336 0.27
337 0.27
338 0.24
339 0.25
340 0.23
341 0.21
342 0.16
343 0.15
344 0.12
345 0.13
346 0.15
347 0.16
348 0.19
349 0.19
350 0.23
351 0.24
352 0.26
353 0.26
354 0.24
355 0.3
356 0.25
357 0.26
358 0.25
359 0.33
360 0.38
361 0.39
362 0.4
363 0.38
364 0.41
365 0.4
366 0.36
367 0.3
368 0.31
369 0.35
370 0.37
371 0.34
372 0.32
373 0.4
374 0.47
375 0.53
376 0.49
377 0.45
378 0.49
379 0.47
380 0.48
381 0.42
382 0.39
383 0.36
384 0.36
385 0.35
386 0.29
387 0.28
388 0.25
389 0.23
390 0.19
391 0.18
392 0.15
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.08
399 0.05
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.1
409 0.16
410 0.24
411 0.3
412 0.37
413 0.46
414 0.55
415 0.66
416 0.71
417 0.76
418 0.78
419 0.82
420 0.81
421 0.78
422 0.73
423 0.67
424 0.6
425 0.51
426 0.45
427 0.35
428 0.29
429 0.25
430 0.21
431 0.19
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.21
436 0.22
437 0.21
438 0.21
439 0.19
440 0.22
441 0.21
442 0.17
443 0.11
444 0.11
445 0.12