Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X0L0

Protein Details
Accession A0A4T0X0L0    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-36IISQNKPKAKPQKRTAKVGKKVQVTSHydrophilic
215-241AAKVRNAAPKKLPKKKKTIEELDQEMAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-68KPKAKPQKRTAKVGKKVQVTSKKAVNKPRALANRPRPTGPAASRKVAAATKAK
201-231RPVRPARPARPARVAAKVRNAAPKKLPKKKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSALEQSLDAIISQNKPKAKPQKRTAKVGKKVQVTSKKAVNKPRALANRPRPTGPAASRKVAAATKAKLNIGAKAIRAASLDVATKVVVSGLPRDINQDAIREFFNQSIGGVAKVILSFNSQGKSTGVATVVFKNAAAAHKAVQKYHNSPIDNGRSTLRLELIVDTTKVPLAARIQPNAPANRTNNNNNNFKNSRPAQNTRPVRPARPARPARVAAKVRNAAPKKLPKKKKTIEELDQEMADYFASNDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.34
4 0.43
5 0.52
6 0.59
7 0.65
8 0.71
9 0.77
10 0.79
11 0.87
12 0.88
13 0.88
14 0.88
15 0.87
16 0.84
17 0.81
18 0.79
19 0.78
20 0.77
21 0.73
22 0.69
23 0.67
24 0.68
25 0.67
26 0.71
27 0.71
28 0.67
29 0.65
30 0.68
31 0.7
32 0.67
33 0.71
34 0.72
35 0.73
36 0.69
37 0.67
38 0.59
39 0.54
40 0.56
41 0.52
42 0.51
43 0.45
44 0.45
45 0.44
46 0.42
47 0.41
48 0.35
49 0.32
50 0.28
51 0.26
52 0.28
53 0.3
54 0.3
55 0.31
56 0.31
57 0.29
58 0.27
59 0.26
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.17
64 0.17
65 0.15
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.07
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.14
90 0.15
91 0.12
92 0.12
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.04
104 0.05
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.1
127 0.15
128 0.16
129 0.17
130 0.19
131 0.23
132 0.25
133 0.32
134 0.35
135 0.32
136 0.33
137 0.39
138 0.42
139 0.39
140 0.36
141 0.3
142 0.26
143 0.26
144 0.25
145 0.18
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.11
159 0.18
160 0.21
161 0.23
162 0.24
163 0.28
164 0.34
165 0.35
166 0.34
167 0.33
168 0.33
169 0.37
170 0.42
171 0.45
172 0.48
173 0.52
174 0.58
175 0.54
176 0.59
177 0.55
178 0.51
179 0.52
180 0.48
181 0.51
182 0.5
183 0.55
184 0.53
185 0.61
186 0.68
187 0.65
188 0.7
189 0.65
190 0.61
191 0.65
192 0.68
193 0.65
194 0.68
195 0.7
196 0.67
197 0.7
198 0.72
199 0.67
200 0.67
201 0.65
202 0.6
203 0.62
204 0.6
205 0.57
206 0.61
207 0.6
208 0.56
209 0.59
210 0.64
211 0.65
212 0.71
213 0.78
214 0.76
215 0.84
216 0.88
217 0.88
218 0.88
219 0.87
220 0.86
221 0.83
222 0.81
223 0.73
224 0.64
225 0.54
226 0.43
227 0.34
228 0.24
229 0.16