Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0X3D6

Protein Details
Accession A0A4T0X3D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-431LWSKLESSITPRRKRRKLTLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-427RRKRRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR037379  WDR74/Nsa1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
CDD cd22858  Nsa1  
Amino Acid Sequences MKIVVACEDTGALKVICAQHGTDTSKPVDESNPLAPVKISTHAEKDNSRKTRVLHLVQSQITKNIIVTRLDGSIQVYDTSKVLNQDQKSSKKKDDEETEELLPQLYQYKQLIEPPTSSNSETFVNLIVDDIGRVLVPTSKGNVFIWTSEEKIAQKPHLCKVPLAKDEIIEAFQVHHGAENIDYVAYGGKETDLRIVKLPSLKKKGEEAEVVFKAKNMSNTRLELRVPVHIKNILFAKDSSTNAFKLYTFTAVGDMRYYDSAAGRKPRSSVLILPKKAPITKAIWLGNHLVVCDNRGTVVKVEPSTGSQICQFKGQIGSIQALYNFNGTILGTSGSDRYVRAYNNETRDCIVKVFIGTQSNALAIIEDNESLKRHKANIIGDTALEAIKKKEAWEEKKLQEQEEEESDEEELWSKLESSITPRRKRRKLTLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.17
4 0.18
5 0.18
6 0.2
7 0.26
8 0.31
9 0.29
10 0.31
11 0.32
12 0.33
13 0.33
14 0.31
15 0.28
16 0.26
17 0.28
18 0.27
19 0.31
20 0.29
21 0.28
22 0.27
23 0.26
24 0.25
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.29
29 0.34
30 0.38
31 0.43
32 0.5
33 0.55
34 0.57
35 0.58
36 0.56
37 0.54
38 0.6
39 0.61
40 0.59
41 0.56
42 0.56
43 0.6
44 0.59
45 0.61
46 0.52
47 0.45
48 0.4
49 0.32
50 0.27
51 0.24
52 0.24
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.17
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.15
69 0.19
70 0.25
71 0.25
72 0.34
73 0.42
74 0.5
75 0.57
76 0.61
77 0.64
78 0.65
79 0.69
80 0.68
81 0.69
82 0.68
83 0.65
84 0.62
85 0.56
86 0.49
87 0.43
88 0.35
89 0.25
90 0.17
91 0.15
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.17
96 0.18
97 0.24
98 0.27
99 0.25
100 0.27
101 0.26
102 0.29
103 0.29
104 0.29
105 0.24
106 0.22
107 0.21
108 0.19
109 0.16
110 0.14
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.06
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.17
133 0.16
134 0.17
135 0.16
136 0.18
137 0.17
138 0.2
139 0.22
140 0.23
141 0.28
142 0.3
143 0.34
144 0.38
145 0.38
146 0.36
147 0.41
148 0.45
149 0.42
150 0.42
151 0.38
152 0.31
153 0.32
154 0.3
155 0.23
156 0.15
157 0.12
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.17
184 0.22
185 0.27
186 0.3
187 0.35
188 0.35
189 0.35
190 0.39
191 0.4
192 0.37
193 0.35
194 0.29
195 0.29
196 0.29
197 0.29
198 0.24
199 0.22
200 0.21
201 0.19
202 0.24
203 0.2
204 0.23
205 0.24
206 0.27
207 0.28
208 0.28
209 0.27
210 0.23
211 0.21
212 0.23
213 0.23
214 0.21
215 0.22
216 0.23
217 0.22
218 0.22
219 0.23
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.13
249 0.2
250 0.21
251 0.22
252 0.24
253 0.25
254 0.26
255 0.27
256 0.3
257 0.34
258 0.41
259 0.41
260 0.42
261 0.43
262 0.43
263 0.42
264 0.36
265 0.29
266 0.24
267 0.27
268 0.31
269 0.31
270 0.29
271 0.29
272 0.31
273 0.29
274 0.25
275 0.2
276 0.16
277 0.13
278 0.14
279 0.13
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.1
285 0.13
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.21
292 0.2
293 0.18
294 0.2
295 0.22
296 0.22
297 0.24
298 0.22
299 0.2
300 0.22
301 0.22
302 0.19
303 0.18
304 0.19
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.09
324 0.12
325 0.15
326 0.16
327 0.19
328 0.26
329 0.32
330 0.39
331 0.42
332 0.4
333 0.38
334 0.39
335 0.36
336 0.31
337 0.25
338 0.18
339 0.16
340 0.17
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.16
348 0.13
349 0.1
350 0.07
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.12
357 0.14
358 0.18
359 0.2
360 0.22
361 0.26
362 0.32
363 0.36
364 0.4
365 0.42
366 0.38
367 0.35
368 0.33
369 0.29
370 0.23
371 0.18
372 0.14
373 0.11
374 0.14
375 0.15
376 0.16
377 0.24
378 0.34
379 0.4
380 0.49
381 0.56
382 0.59
383 0.68
384 0.7
385 0.63
386 0.58
387 0.53
388 0.48
389 0.43
390 0.41
391 0.32
392 0.3
393 0.28
394 0.23
395 0.21
396 0.17
397 0.13
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.12
403 0.13
404 0.2
405 0.3
406 0.4
407 0.5
408 0.59
409 0.69
410 0.77
411 0.85