Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DC80

Protein Details
Accession A5DC80    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-213LENQEKLKKRRQRRAKTVVPAIKKLKPAPPKPKPKKQLTASESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-206KLKKRRQRRAKTVVPAIKKLKPAPPKPKPKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008895  Vps72/YL1  
IPR046757  YL1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140849  F:ATP-dependent H2AZ histone chaperone activity  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pgu:PGUG_00885  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05764  YL1  
Amino Acid Sequences MPIFDLCTCLASREKAAVAAIRGLMYKELRNSKSAKLRNCKLELYMAEEGLATSRARRANAGSRLKQLIAMEDDVSEKQRFVPDEEDEVALLFAEDENDEEVRSSSDDEEGSENDNEDDEDNASADEQSDNEDQTKEVSGSRKRATPDDEMLSSSDLSGSDTDESEGEKELENQEKLKKRRQRRAKTVVPAIKKLKPAPPKPKPKKQLTASESLMRSQRSSSRASAIESKQALVQKLKKDEKRRAAMAPVVRPKYVELTQEERLLEAVETERVNVKSLNEFMDQETPKKRNAAPTFASEAEEASKYHSFGESGVFCNSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.23
4 0.24
5 0.22
6 0.21
7 0.2
8 0.18
9 0.18
10 0.17
11 0.19
12 0.18
13 0.2
14 0.25
15 0.33
16 0.34
17 0.39
18 0.42
19 0.46
20 0.54
21 0.58
22 0.6
23 0.62
24 0.68
25 0.72
26 0.73
27 0.67
28 0.59
29 0.58
30 0.5
31 0.47
32 0.41
33 0.31
34 0.27
35 0.25
36 0.22
37 0.16
38 0.16
39 0.09
40 0.08
41 0.14
42 0.16
43 0.17
44 0.19
45 0.24
46 0.32
47 0.42
48 0.5
49 0.49
50 0.52
51 0.54
52 0.52
53 0.49
54 0.4
55 0.34
56 0.27
57 0.24
58 0.19
59 0.16
60 0.18
61 0.16
62 0.19
63 0.16
64 0.13
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.22
70 0.21
71 0.25
72 0.26
73 0.25
74 0.21
75 0.2
76 0.16
77 0.12
78 0.09
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.04
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.16
126 0.19
127 0.25
128 0.27
129 0.3
130 0.3
131 0.33
132 0.35
133 0.33
134 0.33
135 0.29
136 0.28
137 0.25
138 0.24
139 0.22
140 0.17
141 0.12
142 0.09
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.09
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.21
162 0.29
163 0.33
164 0.41
165 0.48
166 0.54
167 0.64
168 0.73
169 0.77
170 0.8
171 0.86
172 0.85
173 0.84
174 0.84
175 0.8
176 0.73
177 0.69
178 0.63
179 0.57
180 0.53
181 0.49
182 0.47
183 0.49
184 0.55
185 0.59
186 0.64
187 0.72
188 0.78
189 0.85
190 0.87
191 0.86
192 0.86
193 0.82
194 0.83
195 0.76
196 0.73
197 0.66
198 0.63
199 0.54
200 0.47
201 0.43
202 0.33
203 0.29
204 0.24
205 0.26
206 0.23
207 0.26
208 0.26
209 0.27
210 0.28
211 0.3
212 0.35
213 0.31
214 0.35
215 0.32
216 0.3
217 0.28
218 0.3
219 0.3
220 0.29
221 0.34
222 0.34
223 0.43
224 0.52
225 0.56
226 0.63
227 0.7
228 0.74
229 0.75
230 0.73
231 0.66
232 0.62
233 0.61
234 0.57
235 0.56
236 0.55
237 0.5
238 0.46
239 0.43
240 0.4
241 0.4
242 0.36
243 0.32
244 0.28
245 0.31
246 0.34
247 0.37
248 0.36
249 0.3
250 0.27
251 0.23
252 0.18
253 0.14
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.18
262 0.19
263 0.21
264 0.23
265 0.26
266 0.23
267 0.24
268 0.25
269 0.32
270 0.32
271 0.33
272 0.39
273 0.38
274 0.39
275 0.44
276 0.44
277 0.46
278 0.51
279 0.53
280 0.49
281 0.52
282 0.55
283 0.5
284 0.49
285 0.38
286 0.33
287 0.28
288 0.25
289 0.19
290 0.18
291 0.19
292 0.18
293 0.19
294 0.19
295 0.16
296 0.16
297 0.23
298 0.2
299 0.21