Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DDE0

Protein Details
Accession A5DDE0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-90HKSVAKTTVSKRKKTNLKRENGTEGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-82KKHKSVAKTTVSKRKKTNLK
Subcellular Location(s) mito 23, mito_nucl 13.333, cyto_mito 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG pgu:PGUG_01291  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MTKVSPDSRMAMRLMVTRASAKRIQLENDQGLFLAEADDGGEGLAGEVAVHRIKRSYESNGEKKHKSVAKTTVSKRKKTNLKRENGTEGVKLEQGTERKIKTESFGEKSREESEIKTEIKVEPKTAIKSESKTEIISESKTEIKSEPTTEKAEMDWCDGTKPPNVFRKLQIEDIESVPSSLAPKNWDKVYNSVVEMRAKFMSPVDTMGCERIPSKIRPHGFDSPRTYRFQLLISLMLSSQTKDEVNFAAIKTLDDELMKRGFPNGLCLEAVLATSEQDINQCIQKVGFHHRKAGYIKRASQMLHDNHSGDIPDNIRDIVALPGVGPKMGYLLLQRGWYKNEGIGVDVHIHRLAQMWGWVSAKARTPEQTRLELESWLPRRLWGDINPILVGFGQVICPPNYGNCDICTLGKQKLCKGANKKLVNSGITADRIKRLQRQRGDLAMMIDELTSMQPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.25
4 0.29
5 0.3
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.4
10 0.43
11 0.46
12 0.46
13 0.52
14 0.53
15 0.5
16 0.47
17 0.38
18 0.34
19 0.3
20 0.22
21 0.14
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.03
30 0.04
31 0.04
32 0.03
33 0.03
34 0.04
35 0.06
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.15
41 0.2
42 0.25
43 0.31
44 0.38
45 0.48
46 0.56
47 0.64
48 0.7
49 0.68
50 0.65
51 0.66
52 0.61
53 0.56
54 0.54
55 0.53
56 0.56
57 0.62
58 0.7
59 0.72
60 0.74
61 0.78
62 0.77
63 0.78
64 0.79
65 0.8
66 0.83
67 0.82
68 0.83
69 0.84
70 0.83
71 0.81
72 0.75
73 0.67
74 0.58
75 0.49
76 0.41
77 0.34
78 0.28
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.24
83 0.29
84 0.27
85 0.28
86 0.3
87 0.29
88 0.28
89 0.34
90 0.36
91 0.36
92 0.42
93 0.44
94 0.43
95 0.45
96 0.44
97 0.39
98 0.33
99 0.29
100 0.27
101 0.3
102 0.3
103 0.27
104 0.27
105 0.26
106 0.32
107 0.32
108 0.28
109 0.26
110 0.29
111 0.32
112 0.31
113 0.34
114 0.31
115 0.32
116 0.34
117 0.34
118 0.32
119 0.29
120 0.28
121 0.26
122 0.24
123 0.22
124 0.2
125 0.17
126 0.2
127 0.2
128 0.21
129 0.18
130 0.21
131 0.22
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.28
136 0.27
137 0.27
138 0.23
139 0.25
140 0.22
141 0.21
142 0.19
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.19
148 0.2
149 0.23
150 0.3
151 0.34
152 0.35
153 0.39
154 0.45
155 0.43
156 0.45
157 0.41
158 0.35
159 0.33
160 0.32
161 0.28
162 0.2
163 0.17
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.12
170 0.15
171 0.18
172 0.21
173 0.24
174 0.24
175 0.26
176 0.28
177 0.26
178 0.24
179 0.24
180 0.23
181 0.24
182 0.22
183 0.21
184 0.19
185 0.17
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.11
190 0.12
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.15
200 0.17
201 0.22
202 0.28
203 0.3
204 0.33
205 0.39
206 0.44
207 0.43
208 0.47
209 0.49
210 0.49
211 0.5
212 0.49
213 0.44
214 0.36
215 0.34
216 0.28
217 0.23
218 0.18
219 0.15
220 0.13
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.11
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.11
257 0.11
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.14
273 0.23
274 0.31
275 0.31
276 0.37
277 0.38
278 0.44
279 0.48
280 0.53
281 0.52
282 0.49
283 0.51
284 0.47
285 0.49
286 0.44
287 0.43
288 0.43
289 0.37
290 0.36
291 0.33
292 0.31
293 0.28
294 0.28
295 0.24
296 0.16
297 0.15
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.1
319 0.12
320 0.16
321 0.18
322 0.19
323 0.22
324 0.23
325 0.23
326 0.21
327 0.23
328 0.19
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.18
333 0.17
334 0.17
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.14
339 0.13
340 0.09
341 0.11
342 0.11
343 0.13
344 0.14
345 0.16
346 0.16
347 0.18
348 0.23
349 0.23
350 0.25
351 0.29
352 0.33
353 0.4
354 0.43
355 0.47
356 0.43
357 0.46
358 0.44
359 0.39
360 0.37
361 0.37
362 0.36
363 0.34
364 0.31
365 0.27
366 0.28
367 0.3
368 0.33
369 0.28
370 0.33
371 0.33
372 0.34
373 0.33
374 0.3
375 0.28
376 0.23
377 0.19
378 0.11
379 0.07
380 0.07
381 0.09
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.15
387 0.2
388 0.22
389 0.22
390 0.2
391 0.23
392 0.24
393 0.24
394 0.26
395 0.25
396 0.29
397 0.31
398 0.33
399 0.35
400 0.43
401 0.47
402 0.52
403 0.58
404 0.62
405 0.69
406 0.73
407 0.71
408 0.69
409 0.7
410 0.62
411 0.55
412 0.48
413 0.42
414 0.39
415 0.39
416 0.33
417 0.32
418 0.36
419 0.4
420 0.46
421 0.51
422 0.57
423 0.62
424 0.68
425 0.7
426 0.71
427 0.7
428 0.62
429 0.54
430 0.45
431 0.37
432 0.29
433 0.21
434 0.15
435 0.12