Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DHD4

Protein Details
Accession A5DHD4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-184STDKTEKSPPRKPSHRSISTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
555-579RPKLTSREPAKLPKQKISTKDGKKR
Subcellular Location(s) E.R. 7, nucl 4, golg 4, plas 3, extr 3, cyto_nucl 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR011044  Quino_amine_DH_bsu  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pgu:PGUG_02685  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MSHSGRWCFLLFMKAIVFPTLLHAGEVHTTDISSDGALVLTGGSDGAVSVYNYADFMAFDMSKTCSLTPAKTIELDSTVTVGRFCPTEPTIMAVGTTHGSIYLVGENTLECIFPLSKWNVAQSTDKINIDHSSEAPNDKSPKINHDTEKLASHSSEKTLEITNSTDKTEKSPPRKPSHRSISTPNILDVAWSPDGRLIAWISAFEVHIHDRSKNTYQTLISSKPNSSPRSIAFDPTSSFFVCLGDDTVIDIYRYHYKDDMYQFKHFTTNSRMANAVPNIVDYRRISWSPDGEYVSVPTASKGQTSLVSLISRSSQWSTKVSLVGHDTCCEVVRFNPTIYAWDGGEKSDSPPAEQPMVPNAQPTNNESNDSTEQDRPHYVYNIVATAGSDMTLSIWNTIKEKPLLLLKDIAKKPISDLVWHPNGRSLLQSSMDGHVTLYNFEEHELGNPAEETIKNQLLEFSKKVIHPFEYSQPVEGTKKTPAPVIIDQRNATEQNLKPDQEPESITEELSTTENKSKKEKQVPEDEDIRPVILEPSTSTDTSQHSFSNDSPIIKRPKLTSREPAKLPKQKISTKDGKKRIQPMLISSTNGSGSTTPLSTNGHDMWNNNNTPSLPMEYEKPSYAVADSVSRKRPKNDDSTKKKRELEPIKFIGSQLQNPNTAFAAIRLAVPKVRLSFQIEQNSSAFLDVKNGSGNESTPTRITYLRNDRQLWTDFIPRYILLATKGTNFWATATADGEIYTYLLESGKRIFPPIVLGSAISFLESHEQFLLAITSVGELYVWDLNEKKIVLHSPQSIKALLDLSSKYEEDGLSKSENITMCSVTSKGIPLITLSSGSGYLFNNDLGVWHIVTESWWAFGSHYWDSLAQNRNQPDSKQEESIIALLEQKTNEEILRRSRTGRGKFMNKISKNMIMKEGFENLENSISINHLENRMLASELLGEKNDFHAFFLTYVRRISELGLKAQLLGICSELYGPEDLKSNGWKPTICEWDKRALLKELVLTCAKYRNVQRILVHYAEKIGVVAEMYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.2
5 0.14
6 0.18
7 0.2
8 0.18
9 0.16
10 0.15
11 0.16
12 0.18
13 0.19
14 0.16
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.11
20 0.09
21 0.08
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.05
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.03
31 0.03
32 0.03
33 0.04
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.06
43 0.07
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.18
51 0.17
52 0.19
53 0.22
54 0.24
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.3
59 0.31
60 0.27
61 0.26
62 0.25
63 0.21
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.16
73 0.16
74 0.2
75 0.2
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.15
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.07
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.17
102 0.18
103 0.22
104 0.23
105 0.28
106 0.27
107 0.3
108 0.34
109 0.31
110 0.36
111 0.37
112 0.37
113 0.33
114 0.32
115 0.31
116 0.29
117 0.28
118 0.22
119 0.22
120 0.23
121 0.26
122 0.25
123 0.29
124 0.31
125 0.31
126 0.36
127 0.34
128 0.4
129 0.44
130 0.5
131 0.48
132 0.49
133 0.52
134 0.48
135 0.5
136 0.43
137 0.39
138 0.32
139 0.31
140 0.27
141 0.25
142 0.25
143 0.22
144 0.21
145 0.23
146 0.23
147 0.21
148 0.22
149 0.25
150 0.24
151 0.26
152 0.27
153 0.24
154 0.28
155 0.36
156 0.43
157 0.46
158 0.53
159 0.61
160 0.69
161 0.77
162 0.79
163 0.79
164 0.81
165 0.8
166 0.77
167 0.75
168 0.75
169 0.72
170 0.67
171 0.57
172 0.47
173 0.38
174 0.33
175 0.26
176 0.21
177 0.17
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.12
194 0.15
195 0.17
196 0.19
197 0.2
198 0.25
199 0.31
200 0.33
201 0.33
202 0.33
203 0.32
204 0.36
205 0.39
206 0.37
207 0.37
208 0.36
209 0.35
210 0.38
211 0.45
212 0.43
213 0.4
214 0.4
215 0.37
216 0.43
217 0.42
218 0.4
219 0.34
220 0.33
221 0.32
222 0.3
223 0.29
224 0.21
225 0.21
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.1
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.2
243 0.21
244 0.27
245 0.35
246 0.42
247 0.39
248 0.43
249 0.43
250 0.43
251 0.46
252 0.4
253 0.36
254 0.35
255 0.37
256 0.34
257 0.34
258 0.34
259 0.3
260 0.36
261 0.32
262 0.27
263 0.19
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.21
268 0.15
269 0.17
270 0.19
271 0.2
272 0.22
273 0.24
274 0.27
275 0.27
276 0.29
277 0.28
278 0.25
279 0.25
280 0.23
281 0.2
282 0.18
283 0.14
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.21
305 0.22
306 0.25
307 0.23
308 0.23
309 0.25
310 0.26
311 0.25
312 0.22
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.16
317 0.12
318 0.1
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.18
323 0.17
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.12
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.15
335 0.14
336 0.14
337 0.16
338 0.18
339 0.2
340 0.2
341 0.19
342 0.2
343 0.23
344 0.21
345 0.2
346 0.18
347 0.18
348 0.19
349 0.23
350 0.25
351 0.23
352 0.25
353 0.23
354 0.27
355 0.27
356 0.28
357 0.27
358 0.24
359 0.24
360 0.25
361 0.26
362 0.23
363 0.23
364 0.22
365 0.19
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.13
370 0.11
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.12
384 0.13
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.15
389 0.18
390 0.19
391 0.18
392 0.23
393 0.24
394 0.32
395 0.33
396 0.34
397 0.3
398 0.29
399 0.29
400 0.29
401 0.26
402 0.19
403 0.22
404 0.25
405 0.32
406 0.32
407 0.31
408 0.29
409 0.29
410 0.27
411 0.25
412 0.2
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.13
417 0.14
418 0.14
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.1
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.11
440 0.13
441 0.12
442 0.12
443 0.16
444 0.17
445 0.2
446 0.19
447 0.17
448 0.19
449 0.19
450 0.22
451 0.21
452 0.2
453 0.2
454 0.21
455 0.24
456 0.28
457 0.27
458 0.26
459 0.24
460 0.24
461 0.23
462 0.21
463 0.18
464 0.15
465 0.17
466 0.17
467 0.18
468 0.17
469 0.2
470 0.24
471 0.3
472 0.3
473 0.31
474 0.31
475 0.3
476 0.31
477 0.27
478 0.22
479 0.22
480 0.19
481 0.24
482 0.26
483 0.26
484 0.25
485 0.26
486 0.27
487 0.22
488 0.22
489 0.18
490 0.19
491 0.19
492 0.18
493 0.16
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.11
498 0.08
499 0.13
500 0.17
501 0.18
502 0.24
503 0.3
504 0.38
505 0.47
506 0.52
507 0.52
508 0.6
509 0.62
510 0.6
511 0.59
512 0.51
513 0.43
514 0.37
515 0.31
516 0.2
517 0.16
518 0.13
519 0.07
520 0.06
521 0.05
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.15
528 0.16
529 0.17
530 0.13
531 0.12
532 0.14
533 0.14
534 0.19
535 0.18
536 0.18
537 0.18
538 0.24
539 0.29
540 0.28
541 0.3
542 0.27
543 0.34
544 0.39
545 0.42
546 0.46
547 0.47
548 0.53
549 0.55
550 0.59
551 0.6
552 0.62
553 0.61
554 0.58
555 0.58
556 0.57
557 0.58
558 0.57
559 0.58
560 0.6
561 0.66
562 0.68
563 0.67
564 0.68
565 0.71
566 0.68
567 0.63
568 0.54
569 0.49
570 0.47
571 0.42
572 0.37
573 0.29
574 0.25
575 0.2
576 0.19
577 0.15
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.08
584 0.1
585 0.1
586 0.13
587 0.13
588 0.14
589 0.15
590 0.15
591 0.19
592 0.23
593 0.23
594 0.2
595 0.2
596 0.18
597 0.18
598 0.18
599 0.16
600 0.12
601 0.12
602 0.15
603 0.17
604 0.19
605 0.18
606 0.17
607 0.15
608 0.14
609 0.14
610 0.11
611 0.09
612 0.13
613 0.16
614 0.2
615 0.28
616 0.33
617 0.36
618 0.4
619 0.46
620 0.47
621 0.54
622 0.6
623 0.63
624 0.68
625 0.77
626 0.8
627 0.8
628 0.79
629 0.73
630 0.73
631 0.73
632 0.7
633 0.68
634 0.64
635 0.6
636 0.55
637 0.5
638 0.46
639 0.37
640 0.34
641 0.31
642 0.3
643 0.29
644 0.29
645 0.3
646 0.23
647 0.22
648 0.17
649 0.11
650 0.11
651 0.09
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.11
656 0.12
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.16
661 0.21
662 0.26
663 0.32
664 0.4
665 0.38
666 0.38
667 0.37
668 0.36
669 0.29
670 0.24
671 0.18
672 0.09
673 0.12
674 0.11
675 0.11
676 0.12
677 0.12
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.13
683 0.14
684 0.13
685 0.13
686 0.14
687 0.16
688 0.18
689 0.25
690 0.34
691 0.39
692 0.46
693 0.47
694 0.47
695 0.49
696 0.49
697 0.44
698 0.36
699 0.37
700 0.3
701 0.29
702 0.29
703 0.24
704 0.22
705 0.19
706 0.17
707 0.12
708 0.13
709 0.13
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.13
715 0.12
716 0.13
717 0.12
718 0.11
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.1
723 0.1
724 0.07
725 0.06
726 0.05
727 0.04
728 0.04
729 0.05
730 0.05
731 0.06
732 0.09
733 0.13
734 0.13
735 0.15
736 0.15
737 0.14
738 0.19
739 0.19
740 0.17
741 0.14
742 0.14
743 0.12
744 0.13
745 0.13
746 0.09
747 0.07
748 0.06
749 0.11
750 0.11
751 0.12
752 0.11
753 0.11
754 0.11
755 0.11
756 0.12
757 0.06
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.04
764 0.04
765 0.05
766 0.07
767 0.07
768 0.08
769 0.09
770 0.1
771 0.13
772 0.13
773 0.12
774 0.13
775 0.16
776 0.19
777 0.23
778 0.29
779 0.32
780 0.35
781 0.37
782 0.35
783 0.31
784 0.29
785 0.25
786 0.2
787 0.19
788 0.15
789 0.16
790 0.18
791 0.18
792 0.17
793 0.17
794 0.16
795 0.14
796 0.16
797 0.15
798 0.14
799 0.15
800 0.15
801 0.17
802 0.18
803 0.18
804 0.18
805 0.16
806 0.15
807 0.16
808 0.16
809 0.13
810 0.13
811 0.13
812 0.12
813 0.12
814 0.12
815 0.11
816 0.12
817 0.12
818 0.12
819 0.1
820 0.1
821 0.1
822 0.1
823 0.11
824 0.1
825 0.1
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.09
830 0.09
831 0.1
832 0.11
833 0.09
834 0.08
835 0.09
836 0.08
837 0.09
838 0.12
839 0.1
840 0.1
841 0.1
842 0.11
843 0.11
844 0.13
845 0.18
846 0.16
847 0.16
848 0.16
849 0.18
850 0.19
851 0.26
852 0.31
853 0.3
854 0.36
855 0.38
856 0.43
857 0.44
858 0.43
859 0.42
860 0.43
861 0.43
862 0.39
863 0.37
864 0.32
865 0.31
866 0.31
867 0.25
868 0.18
869 0.18
870 0.16
871 0.17
872 0.16
873 0.15
874 0.15
875 0.16
876 0.17
877 0.17
878 0.2
879 0.27
880 0.34
881 0.35
882 0.38
883 0.45
884 0.53
885 0.56
886 0.62
887 0.62
888 0.64
889 0.69
890 0.76
891 0.78
892 0.71
893 0.7
894 0.66
895 0.65
896 0.6
897 0.55
898 0.52
899 0.43
900 0.43
901 0.4
902 0.39
903 0.32
904 0.29
905 0.27
906 0.21
907 0.21
908 0.18
909 0.16
910 0.12
911 0.11
912 0.12
913 0.14
914 0.15
915 0.16
916 0.16
917 0.17
918 0.18
919 0.18
920 0.18
921 0.14
922 0.12
923 0.14
924 0.16
925 0.16
926 0.15
927 0.15
928 0.15
929 0.18
930 0.21
931 0.17
932 0.16
933 0.17
934 0.17
935 0.18
936 0.23
937 0.23
938 0.22
939 0.24
940 0.24
941 0.23
942 0.22
943 0.24
944 0.26
945 0.26
946 0.28
947 0.3
948 0.29
949 0.28
950 0.3
951 0.28
952 0.2
953 0.18
954 0.15
955 0.11
956 0.11
957 0.11
958 0.09
959 0.1
960 0.11
961 0.11
962 0.11
963 0.15
964 0.16
965 0.18
966 0.24
967 0.26
968 0.3
969 0.33
970 0.33
971 0.34
972 0.42
973 0.5
974 0.47
975 0.51
976 0.49
977 0.55
978 0.59
979 0.58
980 0.55
981 0.5
982 0.48
983 0.43
984 0.46
985 0.39
986 0.38
987 0.36
988 0.33
989 0.3
990 0.35
991 0.34
992 0.35
993 0.4
994 0.45
995 0.48
996 0.53
997 0.55
998 0.55
999 0.6
1000 0.56
1001 0.52
1002 0.42
1003 0.4
1004 0.34
1005 0.29
1006 0.22
1007 0.16
1008 0.12