Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A5DHD4

Protein Details
Accession A5DHD4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-184STDKTEKSPPRKPSHRSISTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
555-579RPKLTSREPAKLPKQKISTKDGKKR
Subcellular Location(s) E.R. 7, nucl 4, golg 4, plas 3, extr 3, cyto_nucl 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR011044  Quino_amine_DH_bsu  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pgu:PGUG_02685  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MSHSGRWCFLLFMKAIVFPTLLHAGEVHTTDISSDGALVLTGGSDGAVSVYNYADFMAFDMSKTCSLTPAKTIELDSTVTVGRFCPTEPTIMAVGTTHGSIYLVGENTLECIFPLSKWNVAQSTDKINIDHSSEAPNDKSPKINHDTEKLASHSSEKTLEITNSTDKTEKSPPRKPSHRSISTPNILDVAWSPDGRLIAWISAFEVHIHDRSKNTYQTLISSKPNSSPRSIAFDPTSSFFVCLGDDTVIDIYRYHYKDDMYQFKHFTTNSRMANAVPNIVDYRRISWSPDGEYVSVPTASKGQTSLVSLISRSSQWSTKVSLVGHDTCCEVVRFNPTIYAWDGGEKSDSPPAEQPMVPNAQPTNNESNDSTEQDRPHYVYNIVATAGSDMTLSIWNTIKEKPLLLLKDIAKKPISDLVWHPNGRSLLQSSMDGHVTLYNFEEHELGNPAEETIKNQLLEFSKKVIHPFEYSQPVEGTKKTPAPVIIDQRNATEQNLKPDQEPESITEELSTTENKSKKEKQVPEDEDIRPVILEPSTSTDTSQHSFSNDSPIIKRPKLTSREPAKLPKQKISTKDGKKRIQPMLISSTNGSGSTTPLSTNGHDMWNNNNTPSLPMEYEKPSYAVADSVSRKRPKNDDSTKKKRELEPIKFIGSQLQNPNTAFAAIRLAVPKVRLSFQIEQNSSAFLDVKNGSGNESTPTRITYLRNDRQLWTDFIPRYILLATKGTNFWATATADGEIYTYLLESGKRIFPPIVLGSAISFLESHEQFLLAITSVGELYVWDLNEKKIVLHSPQSIKALLDLSSKYEEDGLSKSENITMCSVTSKGIPLITLSSGSGYLFNNDLGVWHIVTESWWAFGSHYWDSLAQNRNQPDSKQEESIIALLEQKTNEEILRRSRTGRGKFMNKISKNMIMKEGFENLENSISINHLENRMLASELLGEKNDFHAFFLTYVRRISELGLKAQLLGICSELYGPEDLKSNGWKPTICEWDKRALLKELVLTCAKYRNVQRILVHYAEKIGVVAEMYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.2
5 0.14
6 0.18
7 0.2
8 0.18
9 0.16
10 0.15
11 0.16
12 0.18
13 0.19
14 0.16
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.11
20 0.09
21 0.08
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.05
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.03
31 0.03
32 0.03
33 0.04
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.06
43 0.07
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.18
51 0.17
52 0.19
53 0.22
54 0.24
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.3
59 0.31
60 0.27
61 0.26
62 0.25
63 0.21
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.16
73 0.16
74 0.2
75 0.2
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.15
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.07
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.17
102 0.18
103 0.22
104 0.23
105 0.28
106 0.27
107 0.3
108 0.34
109 0.31
110 0.36
111 0.37
112 0.37
113 0.33
114 0.32
115 0.31
116 0.29
117 0.28
118 0.22
119 0.22
120 0.23
121 0.26
122 0.25
123 0.29
124 0.31
125 0.31
126 0.36
127 0.34
128 0.4
129 0.44
130 0.5
131 0.48
132 0.49
133 0.52
134 0.48
135 0.5
136 0.43
137 0.39
138 0.32
139 0.31
140 0.27
141 0.25
142 0.25
143 0.22
144 0.21
145 0.23
146 0.23
147 0.21
148 0.22
149 0.25
150 0.24
151 0.26
152 0.27
153 0.24
154 0.28
155 0.36
156 0.43
157 0.46
158 0.53
159 0.61
160 0.69
161 0.77
162 0.79
163 0.79
164 0.81
165 0.8
166 0.77
167 0.75
168 0.75
169 0.72
170 0.67
171 0.57
172 0.47
173 0.38
174 0.33
175 0.26
176 0.21
177 0.17
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.12
194 0.15
195 0.17
196 0.19
197 0.2
198 0.25
199 0.31
200 0.33
201 0.33
202 0.33
203 0.32
204 0.36
205 0.39
206 0.37
207 0.37
208 0.36
209 0.35
210 0.38
211 0.45
212 0.43
213 0.4
214 0.4
215 0.37
216 0.43
217 0.42
218 0.4
219 0.34
220 0.33
221 0.32
222 0.3
223 0.29
224 0.21
225 0.21
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.1
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.2
243 0.21
244 0.27
245 0.35
246 0.42
247 0.39
248 0.43
249 0.43
250 0.43
251 0.46
252 0.4
253 0.36
254 0.35
255 0.37
256 0.34
257 0.34
258 0.34
259 0.3
260 0.36
261 0.32
262 0.27
263 0.19
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.21
268 0.15
269 0.17
270 0.19
271 0.2
272 0.22
273 0.24
274 0.27
275 0.27
276 0.29
277 0.28
278 0.25
279 0.25
280 0.23
281 0.2
282 0.18
283 0.14
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.21
305 0.22
306 0.25
307 0.23
308 0.23
309 0.25
310 0.26
311 0.25
312 0.22
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.16
317 0.12
318 0.1
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.18
323 0.17
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.12
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.15
335 0.14
336 0.14
337 0.16
338 0.18
339 0.2
340 0.2
341 0.19
342 0.2
343 0.23
344 0.21
345 0.2
346 0.18
347 0.18
348 0.19
349 0.23
350 0.25
351 0.23
352 0.25
353 0.23
354 0.27
355 0.27
356 0.28
357 0.27
358 0.24
359 0.24
360 0.25
361 0.26
362 0.23
363 0.23
364 0.22
365 0.19
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.13
370 0.11
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.12
384 0.13
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.15
389 0.18
390 0.19
391 0.18
392 0.23
393 0.24
394 0.32
395 0.33
396 0.34
397 0.3
398 0.29
399 0.29
400 0.29
401 0.26
402 0.19
403 0.22
404 0.25
405 0.32
406 0.32
407 0.31
408 0.29
409 0.29
410 0.27
411 0.25
412 0.2
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.13
417 0.14
418 0.14
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.1
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.11
440 0.13
441 0.12
442 0.12
443 0.16
444 0.17
445 0.2
446 0.19
447 0.17
448 0.19
449 0.19
450 0.22
451 0.21
452 0.2
453 0.2
454 0.21
455 0.24
456 0.28
457 0.27
458 0.26
459 0.24
460 0.24
461 0.23
462 0.21
463 0.18
464 0.15
465 0.17
466 0.17
467 0.18
468 0.17
469 0.2
470 0.24
471 0.3
472 0.3
473 0.31
474 0.31
475 0.3
476 0.31
477 0.27
478 0.22
479 0.22
480 0.19
481 0.24
482 0.26
483 0.26
484 0.25
485 0.26
486 0.27
487 0.22
488 0.22
489 0.18
490 0.19
491 0.19
492 0.18
493 0.16
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.11
498 0.08
499 0.13
500 0.17
501 0.18
502 0.24
503 0.3
504 0.38
505 0.47
506 0.52
507 0.52
508 0.6
509 0.62
510 0.6
511 0.59
512 0.51
513 0.43
514 0.37
515 0.31
516 0.2
517 0.16
518 0.13
519 0.07
520 0.06
521 0.05
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.15
528 0.16
529 0.17
530 0.13
531 0.12
532 0.14
533 0.14
534 0.19
535 0.18
536 0.18
537 0.18
538 0.24
539 0.29
540 0.28
541 0.3
542 0.27
543 0.34
544 0.39
545 0.42
546 0.46
547 0.47
548 0.53
549 0.55
550 0.59
551 0.6
552 0.62
553 0.61
554 0.58
555 0.58
556 0.57
557 0.58
558 0.57
559 0.58
560 0.6
561 0.66
562 0.68
563 0.67
564 0.68
565 0.71
566 0.68
567 0.63
568 0.54
569 0.49
570 0.47
571 0.42
572 0.37
573 0.29
574 0.25
575 0.2
576 0.19
577 0.15
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.08
584 0.1
585 0.1
586 0.13
587 0.13
588 0.14
589 0.15
590 0.15
591 0.19
592 0.23
593 0.23
594 0.2
595 0.2
596 0.18
597 0.18
598 0.18
599 0.16
600 0.12
601 0.12
602 0.15
603 0.17
604 0.19
605 0.18
606 0.17
607 0.15
608 0.14
609 0.14
610 0.11
611 0.09
612 0.13
613 0.16
614 0.2
615 0.28
616 0.33
617 0.36
618 0.4
619 0.46
620 0.47
621 0.54
622 0.6
623 0.63
624 0.68
625 0.77
626 0.8
627 0.8
628 0.79
629 0.73
630 0.73
631 0.73
632 0.7
633 0.68
634 0.64
635 0.6
636 0.55
637 0.5
638 0.46
639 0.37
640 0.34
641 0.31
642 0.3
643 0.29
644 0.29
645 0.3
646 0.23
647 0.22
648 0.17
649 0.11
650 0.11
651 0.09
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.11
656 0.12
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.16
661 0.21
662 0.26
663 0.32
664 0.4
665 0.38
666 0.38
667 0.37
668 0.36
669 0.29
670 0.24
671 0.18
672 0.09
673 0.12
674 0.11
675 0.11
676 0.12
677 0.12
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.13
683 0.14
684 0.13
685 0.13
686 0.14
687 0.16
688 0.18
689 0.25
690 0.34
691 0.39
692 0.46
693 0.47
694 0.47
695 0.49
696 0.49
697 0.44
698 0.36
699 0.37
700 0.3
701 0.29
702 0.29
703 0.24
704 0.22
705 0.19
706 0.17
707 0.12
708 0.13
709 0.13
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.13
715 0.12
716 0.13
717 0.12
718 0.11
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.1
723 0.1
724 0.07
725 0.06
726 0.05
727 0.04
728 0.04
729 0.05
730 0.05
731 0.06
732 0.09
733 0.13
734 0.13
735 0.15
736 0.15
737 0.14
738 0.19
739 0.19
740 0.17
741 0.14
742 0.14
743 0.12
744 0.13
745 0.13
746 0.09
747 0.07
748 0.06
749 0.11
750 0.11
751 0.12
752 0.11
753 0.11
754 0.11
755 0.11
756 0.12
757 0.06
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.04
764 0.04
765 0.05
766 0.07
767 0.07
768 0.08
769 0.09
770 0.1
771 0.13
772 0.13
773 0.12
774 0.13
775 0.16
776 0.19
777 0.23
778 0.29
779 0.32
780 0.35
781 0.37
782 0.35
783 0.31
784 0.29
785 0.25
786 0.2
787 0.19
788 0.15
789 0.16
790 0.18
791 0.18
792 0.17
793 0.17
794 0.16
795 0.14
796 0.16
797 0.15
798 0.14
799 0.15
800 0.15
801 0.17
802 0.18
803 0.18
804 0.18
805 0.16
806 0.15
807 0.16
808 0.16
809 0.13
810 0.13
811 0.13
812 0.12
813 0.12
814 0.12
815 0.11
816 0.12
817 0.12
818 0.12
819 0.1
820 0.1
821 0.1
822 0.1
823 0.11
824 0.1
825 0.1
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.09
830 0.09
831 0.1
832 0.11
833 0.09
834 0.08
835 0.09
836 0.08
837 0.09
838 0.12
839 0.1
840 0.1
841 0.1
842 0.11
843 0.11
844 0.13
845 0.18
846 0.16
847 0.16
848 0.16
849 0.18
850 0.19
851 0.26
852 0.31
853 0.3
854 0.36
855 0.38
856 0.43
857 0.44
858 0.43
859 0.42
860 0.43
861 0.43
862 0.39
863 0.37
864 0.32
865 0.31
866 0.31
867 0.25
868 0.18
869 0.18
870 0.16
871 0.17
872 0.16
873 0.15
874 0.15
875 0.16
876 0.17
877 0.17
878 0.2
879 0.27
880 0.34
881 0.35
882 0.38
883 0.45
884 0.53
885 0.56
886 0.62
887 0.62
888 0.64
889 0.69
890 0.76
891 0.78
892 0.71
893 0.7
894 0.66
895 0.65
896 0.6
897 0.55
898 0.52
899 0.43
900 0.43
901 0.4
902 0.39
903 0.32
904 0.29
905 0.27
906 0.21
907 0.21
908 0.18
909 0.16
910 0.12
911 0.11
912 0.12
913 0.14
914 0.15
915 0.16
916 0.16
917 0.17
918 0.18
919 0.18
920 0.18
921 0.14
922 0.12
923 0.14
924 0.16
925 0.16
926 0.15
927 0.15
928 0.15
929 0.18
930 0.21
931 0.17
932 0.16
933 0.17
934 0.17
935 0.18
936 0.23
937 0.23
938 0.22
939 0.24
940 0.24
941 0.23
942 0.22
943 0.24
944 0.26
945 0.26
946 0.28
947 0.3
948 0.29
949 0.28
950 0.3
951 0.28
952 0.2
953 0.18
954 0.15
955 0.11
956 0.11
957 0.11
958 0.09
959 0.1
960 0.11
961 0.11
962 0.11
963 0.15
964 0.16
965 0.18
966 0.24
967 0.26
968 0.3
969 0.33
970 0.33
971 0.34
972 0.42
973 0.5
974 0.47
975 0.51
976 0.49
977 0.55
978 0.59
979 0.58
980 0.55
981 0.5
982 0.48
983 0.43
984 0.46
985 0.39
986 0.38
987 0.36
988 0.33
989 0.3
990 0.35
991 0.34
992 0.35
993 0.4
994 0.45
995 0.48
996 0.53
997 0.55
998 0.55
999 0.6
1000 0.56
1001 0.52
1002 0.42
1003 0.4
1004 0.34
1005 0.29
1006 0.22
1007 0.16
1008 0.12