Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DFS7

Protein Details
Accession A5DFS7    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-171KFIPKYSKSRSHRTHRRTGSBasic
224-252EVEGSSKKKKKEKKKRTRRTRNGVRYADABasic
300-320KSEFDKCRKIRHKVLRYLQYVHydrophilic
418-442QSTPKAPPPRPAKPSKLKSLDRVSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-218RPSTPPPRFKSPPPPRPKT
227-244GSSKKKKKEKKKRTRRTR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
KEGG pgu:PGUG_02128  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MPLFEAHNYTAITVKINQLSEANRNDEIDNSIELYMSDLIDLIKLQGNVGASEAARAIRKNIKYGKDQDTQLRSLYILELLVLNSGHKIGAIIARDDKLLDVLKGILNHSGTTGSGSHYSKDITDKVTALALGWRTEVAELDGYKYLASLYKFIPKYSKSRSHRTHRRTGSSNIFETAEDNAVSSPRSSGRQRSVSPPSRPSTPPPRFKSPPPPRPKTSSPYTEVEGSSKKKKKEKKKRTRRTRNGVRYADAEYQIPQINYKAEAPKIRQVIADCHTHTTALGNILLTLTVSPLDDERAKSEFDKCRKIRHKVLRYLQYVGAGSEETKTKEVRAMDEEFLGSLIMANEQLVDVFKKYDTACGYTEENPAPQVQDDDSDSLESYYTESSEEEDDDLGETSSTQFAQLSLSSEPSASPLQSTPKAPPPRPAKPSKLKSLDRVSTNDTVATTSSDPFGDKHGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.25
4 0.26
5 0.27
6 0.3
7 0.35
8 0.38
9 0.37
10 0.34
11 0.35
12 0.34
13 0.32
14 0.31
15 0.25
16 0.21
17 0.18
18 0.17
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.13
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.08
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.14
44 0.18
45 0.25
46 0.27
47 0.35
48 0.42
49 0.46
50 0.52
51 0.6
52 0.63
53 0.61
54 0.63
55 0.63
56 0.61
57 0.58
58 0.5
59 0.43
60 0.35
61 0.29
62 0.25
63 0.17
64 0.11
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.1
78 0.11
79 0.13
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.12
88 0.1
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.2
109 0.2
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.13
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.2
139 0.21
140 0.22
141 0.27
142 0.27
143 0.34
144 0.41
145 0.5
146 0.47
147 0.57
148 0.66
149 0.71
150 0.79
151 0.79
152 0.81
153 0.78
154 0.79
155 0.74
156 0.71
157 0.7
158 0.64
159 0.57
160 0.48
161 0.41
162 0.34
163 0.3
164 0.24
165 0.15
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.13
175 0.15
176 0.21
177 0.28
178 0.34
179 0.36
180 0.42
181 0.5
182 0.54
183 0.56
184 0.56
185 0.51
186 0.5
187 0.5
188 0.49
189 0.51
190 0.51
191 0.56
192 0.56
193 0.62
194 0.61
195 0.64
196 0.69
197 0.69
198 0.7
199 0.7
200 0.71
201 0.67
202 0.71
203 0.71
204 0.65
205 0.61
206 0.56
207 0.51
208 0.46
209 0.44
210 0.38
211 0.33
212 0.29
213 0.28
214 0.26
215 0.31
216 0.34
217 0.38
218 0.43
219 0.52
220 0.61
221 0.68
222 0.76
223 0.78
224 0.84
225 0.9
226 0.94
227 0.97
228 0.96
229 0.96
230 0.95
231 0.94
232 0.93
233 0.84
234 0.74
235 0.65
236 0.58
237 0.5
238 0.39
239 0.29
240 0.2
241 0.2
242 0.2
243 0.17
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.2
252 0.23
253 0.28
254 0.29
255 0.28
256 0.27
257 0.26
258 0.28
259 0.26
260 0.28
261 0.23
262 0.24
263 0.23
264 0.21
265 0.2
266 0.16
267 0.14
268 0.11
269 0.1
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.07
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.16
288 0.23
289 0.29
290 0.33
291 0.43
292 0.43
293 0.53
294 0.61
295 0.67
296 0.7
297 0.73
298 0.76
299 0.76
300 0.83
301 0.82
302 0.76
303 0.71
304 0.62
305 0.53
306 0.44
307 0.34
308 0.25
309 0.16
310 0.13
311 0.11
312 0.12
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.17
318 0.18
319 0.2
320 0.23
321 0.25
322 0.24
323 0.24
324 0.23
325 0.19
326 0.18
327 0.14
328 0.09
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.11
343 0.12
344 0.17
345 0.19
346 0.21
347 0.21
348 0.24
349 0.27
350 0.26
351 0.31
352 0.27
353 0.25
354 0.23
355 0.22
356 0.2
357 0.17
358 0.16
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.1
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.15
400 0.17
401 0.14
402 0.15
403 0.16
404 0.22
405 0.26
406 0.29
407 0.31
408 0.39
409 0.49
410 0.49
411 0.56
412 0.58
413 0.64
414 0.71
415 0.74
416 0.75
417 0.77
418 0.83
419 0.84
420 0.85
421 0.81
422 0.81
423 0.82
424 0.79
425 0.73
426 0.69
427 0.65
428 0.59
429 0.54
430 0.46
431 0.36
432 0.3
433 0.26
434 0.24
435 0.2
436 0.17
437 0.17
438 0.16
439 0.17
440 0.16