Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DDC8

Protein Details
Accession A5DDC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MAAAPSGQNRPRKRRAPLKPLPGYVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-17RPRKRRAP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG pgu:PGUG_01279  -  
Amino Acid Sequences MAAAPSGQNRPRKRRAPLKPLPGYVAMYNAHVREFFGEQKSFGLKPSMVSSDSLKYGEPDNTPGTWWSSGEKDKFFRLLSRYSIHCVDMISAALETKSELEILSYYHILQRSLKKMKRYSKSAHYKVSVPRRRTHHNFRLDMHVPVLISYRDMPIAYEMSEAFTSIEERQALILIQGERKRVNDENRRFQRHFDAYTSSASEDAPDGETGMVHNGAAAGSADPCLLNLDAALHISHGVSQTVNHDSVPRLHLKSFALLEELARIYTYKLVVDVAAKKIQSRWVATRNTENPSSVTRVDIERAVESWKRVPSVLFTPLQSEPLVSTIPHIEQLTQSRPQTSWDELIEEQLDTLVESYLDEKDGWESRSHEHIMLTFLSSYGRNEREIERRKEETNIDEEMPNNEEEDSHESISESDSDSETDFESANSLESDSESGSDLVSESTSESDSDLVSESDLESGSDLVSDFVSDSQSGVHFDIPNQLVLAHSKVFSRYEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.86
3 0.88
4 0.89
5 0.89
6 0.88
7 0.82
8 0.76
9 0.69
10 0.6
11 0.5
12 0.44
13 0.34
14 0.28
15 0.28
16 0.24
17 0.22
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.21
22 0.23
23 0.26
24 0.27
25 0.26
26 0.29
27 0.32
28 0.3
29 0.28
30 0.27
31 0.22
32 0.22
33 0.26
34 0.27
35 0.24
36 0.25
37 0.26
38 0.25
39 0.27
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.22
44 0.24
45 0.23
46 0.23
47 0.24
48 0.24
49 0.25
50 0.25
51 0.25
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.23
56 0.29
57 0.33
58 0.37
59 0.36
60 0.38
61 0.42
62 0.4
63 0.4
64 0.37
65 0.37
66 0.36
67 0.38
68 0.37
69 0.38
70 0.39
71 0.34
72 0.3
73 0.26
74 0.22
75 0.18
76 0.16
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.13
94 0.14
95 0.15
96 0.2
97 0.27
98 0.34
99 0.43
100 0.47
101 0.53
102 0.61
103 0.7
104 0.73
105 0.74
106 0.72
107 0.72
108 0.79
109 0.78
110 0.76
111 0.69
112 0.66
113 0.67
114 0.71
115 0.68
116 0.62
117 0.62
118 0.6
119 0.68
120 0.7
121 0.73
122 0.71
123 0.72
124 0.72
125 0.67
126 0.69
127 0.61
128 0.53
129 0.43
130 0.35
131 0.25
132 0.21
133 0.2
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.09
152 0.08
153 0.11
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.11
161 0.1
162 0.15
163 0.17
164 0.19
165 0.2
166 0.21
167 0.25
168 0.28
169 0.37
170 0.42
171 0.49
172 0.57
173 0.65
174 0.72
175 0.68
176 0.65
177 0.64
178 0.58
179 0.52
180 0.44
181 0.39
182 0.33
183 0.34
184 0.32
185 0.23
186 0.18
187 0.15
188 0.13
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.18
239 0.17
240 0.19
241 0.17
242 0.15
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.21
266 0.22
267 0.23
268 0.25
269 0.3
270 0.34
271 0.36
272 0.42
273 0.41
274 0.42
275 0.39
276 0.35
277 0.29
278 0.28
279 0.29
280 0.21
281 0.18
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.12
288 0.12
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.19
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.21
299 0.23
300 0.21
301 0.19
302 0.22
303 0.22
304 0.23
305 0.2
306 0.16
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.13
318 0.17
319 0.21
320 0.24
321 0.24
322 0.24
323 0.24
324 0.27
325 0.28
326 0.26
327 0.25
328 0.21
329 0.23
330 0.22
331 0.23
332 0.2
333 0.16
334 0.13
335 0.1
336 0.09
337 0.06
338 0.07
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.11
348 0.14
349 0.15
350 0.16
351 0.18
352 0.2
353 0.26
354 0.27
355 0.25
356 0.22
357 0.22
358 0.22
359 0.2
360 0.18
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.17
367 0.18
368 0.18
369 0.21
370 0.26
371 0.35
372 0.44
373 0.5
374 0.5
375 0.53
376 0.53
377 0.55
378 0.54
379 0.48
380 0.43
381 0.39
382 0.33
383 0.31
384 0.3
385 0.27
386 0.25
387 0.21
388 0.17
389 0.14
390 0.12
391 0.13
392 0.18
393 0.19
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.17
398 0.18
399 0.16
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.1
418 0.09
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.1
437 0.09
438 0.08
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.11
459 0.13
460 0.13
461 0.17
462 0.16
463 0.17
464 0.25
465 0.25
466 0.25
467 0.22
468 0.21
469 0.19
470 0.2
471 0.23
472 0.16
473 0.16
474 0.17
475 0.2