Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DHC7

Protein Details
Accession A5DHC7    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-231IQPETVKMKKIKKKSSKNRKREQTMDPFEHydrophilic
250-270QSMINHKRRLKQQQRKKLTSEHydrophilic
446-466VAEPKRKKKYDSYTSNNNYRPHydrophilic
490-516SHKFHGAKPGKADKHKAKKTEPSERILBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-223KMKKIKKKSSKNRKR
492-509KFHGAKPGKADKHKAKKT
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgu:PGUG_02678  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MEISLSLEETNKLRRQLGLREIPQGDDSVSTLQNKVSKNDLSIAETNKLRASAGLKPIPETDSKEKADDNVDTRVESRGSKLLDKLKSRRNVAHLDENEEPNENHDIVVNTDDWLNSLGKEATDTTESDSVQNVVHKDKTKDVNEVSRDSSTPMLDSKVPHILKESPNQEEKASLSGISDTAEPSEQPSKKRMAISLFDEDEIQPETVKMKKIKKKSSKNRKREQTMDPFEVKPVVLEQFEDNDDDFEVQSMINHKRRLKQQQRKKLTSEELAKEISQLESWDSKDALDRASALATASGLVFDDTSEFLSSLSTEKTEKKVDTAEPETEKEQTPKSNEQSEAHTEPSEPIEEGTTPRFNTGIAATLNYLKSHSVLETKQIQQEAREQREAAKRAEMTKLNIEIESRLVREQLESDGSYKSLPKEEKETIFERYLDERLREKGLLQVAEPKRKKKYDSYTSNNNYRPQVQLVYKDKDGHELSQKEAFKHLSHKFHGAKPGKADKHKAKKTEPSERIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.41
3 0.48
4 0.55
5 0.57
6 0.55
7 0.6
8 0.59
9 0.55
10 0.5
11 0.42
12 0.33
13 0.23
14 0.22
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.21
20 0.25
21 0.27
22 0.28
23 0.31
24 0.3
25 0.31
26 0.36
27 0.35
28 0.35
29 0.38
30 0.39
31 0.39
32 0.37
33 0.37
34 0.33
35 0.31
36 0.25
37 0.23
38 0.22
39 0.24
40 0.31
41 0.34
42 0.33
43 0.35
44 0.36
45 0.36
46 0.36
47 0.36
48 0.35
49 0.38
50 0.4
51 0.4
52 0.39
53 0.39
54 0.4
55 0.37
56 0.33
57 0.31
58 0.3
59 0.28
60 0.29
61 0.29
62 0.26
63 0.22
64 0.22
65 0.21
66 0.24
67 0.26
68 0.31
69 0.36
70 0.42
71 0.5
72 0.56
73 0.59
74 0.64
75 0.67
76 0.67
77 0.65
78 0.65
79 0.63
80 0.65
81 0.57
82 0.55
83 0.54
84 0.49
85 0.44
86 0.39
87 0.32
88 0.25
89 0.26
90 0.2
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.16
96 0.14
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.15
119 0.18
120 0.16
121 0.17
122 0.21
123 0.25
124 0.27
125 0.33
126 0.41
127 0.4
128 0.45
129 0.45
130 0.48
131 0.47
132 0.48
133 0.43
134 0.37
135 0.34
136 0.3
137 0.28
138 0.2
139 0.17
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.25
149 0.29
150 0.31
151 0.37
152 0.39
153 0.35
154 0.38
155 0.39
156 0.36
157 0.32
158 0.28
159 0.23
160 0.19
161 0.14
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.18
173 0.19
174 0.21
175 0.25
176 0.28
177 0.32
178 0.33
179 0.34
180 0.3
181 0.32
182 0.34
183 0.36
184 0.32
185 0.29
186 0.28
187 0.24
188 0.21
189 0.18
190 0.14
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.11
195 0.16
196 0.22
197 0.3
198 0.37
199 0.47
200 0.57
201 0.66
202 0.75
203 0.81
204 0.86
205 0.88
206 0.91
207 0.92
208 0.92
209 0.89
210 0.84
211 0.82
212 0.81
213 0.77
214 0.71
215 0.64
216 0.54
217 0.47
218 0.4
219 0.31
220 0.2
221 0.15
222 0.11
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.09
239 0.15
240 0.19
241 0.24
242 0.27
243 0.33
244 0.41
245 0.52
246 0.59
247 0.64
248 0.7
249 0.76
250 0.83
251 0.82
252 0.77
253 0.72
254 0.65
255 0.62
256 0.58
257 0.49
258 0.41
259 0.37
260 0.34
261 0.28
262 0.24
263 0.17
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.12
303 0.15
304 0.19
305 0.19
306 0.2
307 0.23
308 0.24
309 0.29
310 0.3
311 0.31
312 0.29
313 0.31
314 0.3
315 0.28
316 0.28
317 0.24
318 0.23
319 0.23
320 0.26
321 0.31
322 0.35
323 0.38
324 0.39
325 0.38
326 0.4
327 0.42
328 0.39
329 0.33
330 0.3
331 0.25
332 0.23
333 0.22
334 0.19
335 0.13
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.14
341 0.16
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.15
347 0.13
348 0.13
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.15
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.14
361 0.14
362 0.19
363 0.25
364 0.28
365 0.3
366 0.32
367 0.31
368 0.29
369 0.38
370 0.41
371 0.41
372 0.4
373 0.37
374 0.42
375 0.49
376 0.51
377 0.44
378 0.4
379 0.37
380 0.37
381 0.43
382 0.39
383 0.34
384 0.36
385 0.38
386 0.33
387 0.31
388 0.29
389 0.23
390 0.24
391 0.22
392 0.18
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.17
404 0.17
405 0.18
406 0.17
407 0.22
408 0.24
409 0.25
410 0.32
411 0.38
412 0.41
413 0.44
414 0.44
415 0.42
416 0.42
417 0.39
418 0.35
419 0.32
420 0.33
421 0.31
422 0.32
423 0.3
424 0.31
425 0.34
426 0.31
427 0.29
428 0.29
429 0.31
430 0.28
431 0.26
432 0.33
433 0.36
434 0.47
435 0.52
436 0.54
437 0.58
438 0.62
439 0.67
440 0.67
441 0.71
442 0.71
443 0.76
444 0.77
445 0.79
446 0.81
447 0.85
448 0.8
449 0.75
450 0.68
451 0.6
452 0.56
453 0.48
454 0.47
455 0.42
456 0.47
457 0.49
458 0.51
459 0.52
460 0.53
461 0.49
462 0.5
463 0.49
464 0.44
465 0.46
466 0.42
467 0.42
468 0.45
469 0.47
470 0.41
471 0.43
472 0.41
473 0.34
474 0.41
475 0.46
476 0.46
477 0.48
478 0.56
479 0.57
480 0.59
481 0.67
482 0.64
483 0.61
484 0.62
485 0.69
486 0.68
487 0.7
488 0.75
489 0.75
490 0.8
491 0.84
492 0.83
493 0.82
494 0.83
495 0.85
496 0.86