Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0WLH1

Protein Details
Accession A0A4T0WLH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-163CPLGPRCSKKHVRRKLCAYYLHydrophilic
228-251DRRHGGRGGKWRDRGNRRFRGRGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-251GDRRHGGRGGKWRDRGNRRFRGRGH
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAAVAPRPETTHILNHAPTATSFSFTPFLRQTYRHELSSDRPQCKSFLAGHCPLGASCPDRHASSTSSNPSGGPSLVCKHWLRGLCKKGESCEFLHEYNLRKMPECNFFMRNGYCSNGEECLYLHIDPQSKLPPCPHYDKGFCPLGPRCSKKHVRRKLCAYYLVGFCPEGPGCKYGAHPRWRTDLEKPSAKVEGEDEPKRDGEREDGESFQQQRDRQRDMHDDRGHGDRRHGGRGGKWRDRGNRRFRGRGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.32
4 0.29
5 0.26
6 0.26
7 0.22
8 0.19
9 0.18
10 0.2
11 0.23
12 0.22
13 0.28
14 0.24
15 0.27
16 0.29
17 0.32
18 0.36
19 0.42
20 0.46
21 0.42
22 0.4
23 0.4
24 0.42
25 0.5
26 0.52
27 0.46
28 0.44
29 0.44
30 0.44
31 0.43
32 0.4
33 0.36
34 0.34
35 0.38
36 0.38
37 0.38
38 0.37
39 0.36
40 0.31
41 0.26
42 0.21
43 0.17
44 0.15
45 0.17
46 0.18
47 0.19
48 0.21
49 0.21
50 0.22
51 0.24
52 0.3
53 0.31
54 0.31
55 0.3
56 0.28
57 0.27
58 0.25
59 0.21
60 0.15
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.23
68 0.29
69 0.32
70 0.38
71 0.44
72 0.44
73 0.48
74 0.47
75 0.46
76 0.45
77 0.42
78 0.35
79 0.34
80 0.31
81 0.27
82 0.29
83 0.28
84 0.27
85 0.29
86 0.31
87 0.27
88 0.25
89 0.27
90 0.28
91 0.32
92 0.31
93 0.29
94 0.27
95 0.27
96 0.29
97 0.28
98 0.26
99 0.2
100 0.19
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.22
120 0.23
121 0.25
122 0.31
123 0.33
124 0.33
125 0.35
126 0.36
127 0.38
128 0.37
129 0.33
130 0.31
131 0.31
132 0.33
133 0.38
134 0.39
135 0.38
136 0.44
137 0.54
138 0.59
139 0.67
140 0.7
141 0.72
142 0.77
143 0.83
144 0.83
145 0.77
146 0.71
147 0.64
148 0.58
149 0.5
150 0.42
151 0.34
152 0.24
153 0.2
154 0.18
155 0.15
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.16
162 0.23
163 0.31
164 0.39
165 0.42
166 0.44
167 0.5
168 0.53
169 0.55
170 0.53
171 0.54
172 0.52
173 0.55
174 0.53
175 0.49
176 0.48
177 0.44
178 0.37
179 0.3
180 0.3
181 0.3
182 0.33
183 0.32
184 0.31
185 0.32
186 0.32
187 0.31
188 0.25
189 0.24
190 0.24
191 0.29
192 0.29
193 0.29
194 0.3
195 0.35
196 0.35
197 0.34
198 0.34
199 0.32
200 0.39
201 0.45
202 0.48
203 0.46
204 0.51
205 0.58
206 0.6
207 0.66
208 0.62
209 0.57
210 0.55
211 0.59
212 0.59
213 0.5
214 0.48
215 0.46
216 0.45
217 0.49
218 0.5
219 0.45
220 0.46
221 0.55
222 0.6
223 0.61
224 0.64
225 0.66
226 0.73
227 0.8
228 0.83
229 0.83
230 0.83
231 0.83