Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0VRH3

Protein Details
Accession A0A4T0VRH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MGSSTRKKKEKAKDFAKPKFKVGKAKVKPANFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28RKKKEKAKDFAKPKFKVGKAKVK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSTRKKKEKAKDFAKPKFKVGKAKVKPANFTDTSFKAKSIAMGHQKLSTEAPDNATQFKHNLSLASTSRADKQRKESLAHLTSQVLADNNPVGTATVLSKLLPLVSDASGPVRGQLLKLFRALPEAEVKYHAEKCIMYIRAGMTHLSADISNDSLAVLEWLLDVAEDETVSCPGGWVKTLNSFCALMGWTVKTNTGWSTAPKTGLRTKDAQSHARQIAVLAKFLQAGLKPEVAAPSNPNARSDNMYRVPRIPNPFAYLNLFGTRRDEEAEMYNDRESRQRVFHRRFLDSFARGVEQAKKEGGTIGRSAIQMDQALAEGMGGYEATSAVEPQDLLDLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.91
3 0.91
4 0.83
5 0.82
6 0.81
7 0.77
8 0.77
9 0.76
10 0.76
11 0.74
12 0.81
13 0.8
14 0.76
15 0.76
16 0.69
17 0.68
18 0.59
19 0.55
20 0.51
21 0.47
22 0.48
23 0.43
24 0.38
25 0.32
26 0.3
27 0.31
28 0.28
29 0.33
30 0.35
31 0.38
32 0.39
33 0.4
34 0.41
35 0.38
36 0.35
37 0.3
38 0.25
39 0.23
40 0.25
41 0.26
42 0.27
43 0.28
44 0.28
45 0.26
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.19
50 0.18
51 0.17
52 0.22
53 0.22
54 0.25
55 0.26
56 0.24
57 0.31
58 0.38
59 0.42
60 0.41
61 0.47
62 0.52
63 0.54
64 0.56
65 0.53
66 0.54
67 0.52
68 0.48
69 0.42
70 0.33
71 0.3
72 0.27
73 0.23
74 0.14
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.13
105 0.15
106 0.15
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.19
111 0.18
112 0.16
113 0.19
114 0.19
115 0.17
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.22
120 0.21
121 0.16
122 0.15
123 0.16
124 0.21
125 0.21
126 0.17
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.18
131 0.16
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.02
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.17
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.25
192 0.28
193 0.3
194 0.32
195 0.31
196 0.32
197 0.37
198 0.41
199 0.43
200 0.41
201 0.45
202 0.42
203 0.39
204 0.36
205 0.28
206 0.3
207 0.25
208 0.22
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.09
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.17
225 0.23
226 0.23
227 0.25
228 0.25
229 0.26
230 0.29
231 0.3
232 0.33
233 0.34
234 0.37
235 0.37
236 0.39
237 0.42
238 0.44
239 0.47
240 0.43
241 0.39
242 0.41
243 0.4
244 0.38
245 0.37
246 0.33
247 0.28
248 0.28
249 0.26
250 0.22
251 0.24
252 0.23
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.17
257 0.21
258 0.24
259 0.23
260 0.23
261 0.24
262 0.23
263 0.23
264 0.27
265 0.26
266 0.26
267 0.32
268 0.4
269 0.49
270 0.55
271 0.62
272 0.63
273 0.66
274 0.63
275 0.62
276 0.6
277 0.51
278 0.46
279 0.4
280 0.36
281 0.3
282 0.32
283 0.32
284 0.27
285 0.28
286 0.28
287 0.26
288 0.25
289 0.29
290 0.29
291 0.24
292 0.22
293 0.22
294 0.24
295 0.23
296 0.24
297 0.21
298 0.2
299 0.17
300 0.16
301 0.14
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07