Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0VKQ7

Protein Details
Accession A0A4T0VKQ7    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-87DPSLRFQPIRRPQAKTTKPKPTFPKTIHydrophilic
137-164ANGDKSHQRGGRRKKKKKGHNDQPAETNBasic
191-210QEWKRVLYRHRRRRSSSDDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-155HQRGGRRKKKKKG
378-383KRKKRS
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.333, cyto 9, cyto_mito 7.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MAAPPPPPPPPARGGLSLYANLLDPVVDASSATISSAPVRYNQDGTVADAKDDAAAKRLIDPSLRFQPIRRPQAKTTKPKPTFPKTIPSANASAGASSAPSPASAPSTAPQQPPPPKSTLADWAVTEDDEWRYSVNANGDKSHQRGGRRKKKKKGHNDQPAETNWDDIYDPTKPTNVEEYLRSDERIREVQEWKRVLYRHRRRRSSSDDSDEEPARQQATNQFAPPPEYSFVPPPPASPPPASAVQIPDDAAGEDAYTRRLALSGDVPPPPPDANLPPLPPPTDAATISRAPVRYTPSTEPQPAAEKGDSDRDSPPPAFGLGATPADADDEPPVPRSSRPGQAGFAQRLMSKYGWTKGSGLGADESGIVNPLRVQVEKRKKRSDAEGGGWAEPANRAKVLGGKRKDDAEGGKFGGPMSEVIVLQQMLDNMEDLRGEIANGLGQEIGEECGEKYGRVERLYIDVENRQVFIRFTDQVSALRAVNELDGRVFNGNTVVPKFYDTEKFERGVYQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.42
4 0.38
5 0.34
6 0.28
7 0.24
8 0.2
9 0.16
10 0.11
11 0.08
12 0.08
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.11
23 0.13
24 0.14
25 0.18
26 0.24
27 0.27
28 0.29
29 0.29
30 0.3
31 0.29
32 0.32
33 0.34
34 0.28
35 0.25
36 0.23
37 0.23
38 0.2
39 0.22
40 0.18
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.2
45 0.23
46 0.22
47 0.25
48 0.27
49 0.31
50 0.39
51 0.44
52 0.39
53 0.39
54 0.48
55 0.54
56 0.62
57 0.61
58 0.58
59 0.62
60 0.72
61 0.8
62 0.8
63 0.8
64 0.8
65 0.79
66 0.81
67 0.82
68 0.8
69 0.8
70 0.73
71 0.73
72 0.67
73 0.69
74 0.64
75 0.58
76 0.52
77 0.43
78 0.42
79 0.32
80 0.26
81 0.19
82 0.16
83 0.12
84 0.1
85 0.1
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.19
95 0.24
96 0.26
97 0.29
98 0.36
99 0.44
100 0.47
101 0.5
102 0.47
103 0.45
104 0.44
105 0.43
106 0.42
107 0.37
108 0.33
109 0.29
110 0.27
111 0.25
112 0.23
113 0.2
114 0.14
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.13
122 0.17
123 0.2
124 0.21
125 0.22
126 0.26
127 0.3
128 0.32
129 0.36
130 0.33
131 0.37
132 0.46
133 0.56
134 0.63
135 0.7
136 0.78
137 0.81
138 0.88
139 0.9
140 0.92
141 0.92
142 0.92
143 0.92
144 0.9
145 0.83
146 0.79
147 0.7
148 0.64
149 0.53
150 0.43
151 0.31
152 0.24
153 0.2
154 0.15
155 0.16
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.14
161 0.16
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.24
167 0.28
168 0.28
169 0.28
170 0.24
171 0.24
172 0.25
173 0.27
174 0.25
175 0.24
176 0.3
177 0.34
178 0.4
179 0.4
180 0.38
181 0.38
182 0.39
183 0.42
184 0.47
185 0.52
186 0.56
187 0.65
188 0.72
189 0.73
190 0.79
191 0.81
192 0.79
193 0.76
194 0.72
195 0.65
196 0.59
197 0.56
198 0.48
199 0.4
200 0.31
201 0.24
202 0.18
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.22
210 0.21
211 0.24
212 0.23
213 0.21
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.2
220 0.19
221 0.18
222 0.21
223 0.21
224 0.22
225 0.2
226 0.21
227 0.19
228 0.21
229 0.21
230 0.18
231 0.17
232 0.15
233 0.15
234 0.13
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.09
251 0.11
252 0.14
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.17
257 0.16
258 0.14
259 0.12
260 0.12
261 0.16
262 0.17
263 0.18
264 0.19
265 0.2
266 0.21
267 0.19
268 0.19
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.18
274 0.17
275 0.17
276 0.18
277 0.16
278 0.14
279 0.16
280 0.2
281 0.19
282 0.23
283 0.26
284 0.29
285 0.33
286 0.34
287 0.32
288 0.29
289 0.31
290 0.27
291 0.27
292 0.22
293 0.18
294 0.18
295 0.25
296 0.24
297 0.22
298 0.23
299 0.22
300 0.25
301 0.24
302 0.23
303 0.16
304 0.16
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.18
324 0.21
325 0.26
326 0.3
327 0.31
328 0.32
329 0.37
330 0.42
331 0.38
332 0.36
333 0.3
334 0.27
335 0.25
336 0.27
337 0.21
338 0.17
339 0.19
340 0.21
341 0.22
342 0.22
343 0.23
344 0.21
345 0.24
346 0.21
347 0.19
348 0.15
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.1
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.15
362 0.24
363 0.36
364 0.46
365 0.54
366 0.6
367 0.63
368 0.67
369 0.72
370 0.72
371 0.67
372 0.62
373 0.61
374 0.54
375 0.5
376 0.45
377 0.36
378 0.27
379 0.23
380 0.21
381 0.15
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.2
386 0.28
387 0.34
388 0.38
389 0.4
390 0.42
391 0.44
392 0.44
393 0.42
394 0.39
395 0.34
396 0.32
397 0.31
398 0.3
399 0.28
400 0.26
401 0.22
402 0.17
403 0.13
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.19
441 0.24
442 0.25
443 0.26
444 0.23
445 0.29
446 0.32
447 0.31
448 0.29
449 0.27
450 0.32
451 0.31
452 0.31
453 0.26
454 0.25
455 0.23
456 0.23
457 0.24
458 0.22
459 0.22
460 0.25
461 0.26
462 0.26
463 0.29
464 0.28
465 0.24
466 0.22
467 0.21
468 0.18
469 0.19
470 0.18
471 0.15
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.18
476 0.17
477 0.14
478 0.15
479 0.16
480 0.19
481 0.2
482 0.21
483 0.19
484 0.21
485 0.23
486 0.26
487 0.32
488 0.34
489 0.39
490 0.41
491 0.42