FuNGI

A0A4T0VPD8

Protein Details

Accession

A0A4T0VPD8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
123-148	TDDADPKKGSRKPKKGKTGKESSEDA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
128-151	PKKGSRKPKKGKTGKESSEDAKKE

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MATAFSYAQAAKGQAATTSATQPTESGKDAANSVSGEQSTADTNAVKSNDSVDDEPSRNTTLKAQLATKQDAPSAPTEANTSNTSAAASVTDSRRDDEDASIEGSARRSEKSVRSASASTRVTDDADPKKGSRKPKKGKTGKESSEDAKKEKAAEQEKEVQPKIELVEAPLPSVNIWTQRKETQAAKTSVTLPASNGVPNVSNPADAWPNSQESKKKSKAVDATEATNGAVSTNKSQRKVGDGEAAVRRNGARGSRVTEKDGRPTEVPPPVGDVQSWPTPETAVKETIKEDKRKPSDKVERAEAEAQEDAASKGRSKDKWERMDFVPTVQFSTPIPSVRGSRGGRGGARGGRDVTSRGGHGAAAAAASDKPAGAAAQTKSAASEGRERARDGNALARTNSQPPAANKRASMEGSNKEQRKPAAPSSGERNKESQSNATSEQAGPVRERGEGRGDRGRGGYRGRGGHPGNVPMHTQQSSFMGNGNSFGSQGPRQYTSPPLHQNGSFAPSYSNSQSRGGRGGRGQSNGSGAFRGAGGPSNSGRMRQVQTSMSQGSWEYGMPMTPGSYPAFYEQTRHLMIPQLEYYFSVENLLKDEFLRKHMDSQGFVPLDLVLGFSRVRTVADPQTLRSICAECPQLDYVIGDDGVERLRSRTHWQKFVYSKMELRFESARNAGPQYFYPRSLHAMAPYDHGMLGDYPVVSPSAYPNGTENSYVAYPAEVPAGQTNGAANGSGPDTQLSAQVPEFQPGTSPEQTAEASPAAAHSQLESKTQSLVNGSAEAHAEAVPLTNGNHAQPAEALES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.16
4	0.16
5	0.2
6	0.2
7	0.2
8	0.2
9	0.2
10	0.23
11	0.24
12	0.24
13	0.22
14	0.21
15	0.22
16	0.23
17	0.23
18	0.21
19	0.18
20	0.17
21	0.18
22	0.16
23	0.15
24	0.14
25	0.15
26	0.14
27	0.14
28	0.15
29	0.13
30	0.13
31	0.18
32	0.19
33	0.19
34	0.17
35	0.19
36	0.21
37	0.24
38	0.25
39	0.24
40	0.29
41	0.3
42	0.32
43	0.31
44	0.32
45	0.28
46	0.28
47	0.3
48	0.31
49	0.34
50	0.36
51	0.37
52	0.4
53	0.45
54	0.49
55	0.48
56	0.42
57	0.4
58	0.37
59	0.36
60	0.33
61	0.3
62	0.25
63	0.22
64	0.23
65	0.22
66	0.24
67	0.23
68	0.22
69	0.19
70	0.18
71	0.18
72	0.15
73	0.13
74	0.1
75	0.11
76	0.15
77	0.16
78	0.22
79	0.23
80	0.24
81	0.26
82	0.28
83	0.28
84	0.24
85	0.24
86	0.2
87	0.21
88	0.19
89	0.18
90	0.17
91	0.16
92	0.18
93	0.17
94	0.16
95	0.18
96	0.24
97	0.3
98	0.37
99	0.41
100	0.41
101	0.44
102	0.46
103	0.46
104	0.49
105	0.44
106	0.36
107	0.33
108	0.31
109	0.29
110	0.29
111	0.33
112	0.3
113	0.34
114	0.36
115	0.35
116	0.43
117	0.45
118	0.54
119	0.57
120	0.63
121	0.68
122	0.76
123	0.86
124	0.87
125	0.92
126	0.91
127	0.91
128	0.86
129	0.81
130	0.75
131	0.69
132	0.69
133	0.62
134	0.55
135	0.48
136	0.43
137	0.4
138	0.4
139	0.44
140	0.42
141	0.42
142	0.45
143	0.51
144	0.53
145	0.58
146	0.54
147	0.46
148	0.39
149	0.37
150	0.33
151	0.26
152	0.22
153	0.17
154	0.22
155	0.21
156	0.21
157	0.2
158	0.19
159	0.15
160	0.16
161	0.15
162	0.18
163	0.21
164	0.23
165	0.27
166	0.3
167	0.34
168	0.37
169	0.4
170	0.4
171	0.46
172	0.45
173	0.43
174	0.42
175	0.4
176	0.39
177	0.36
178	0.28
179	0.2
180	0.2
181	0.19
182	0.18
183	0.16
184	0.13
185	0.12
186	0.12
187	0.16
188	0.13
189	0.13
190	0.12
191	0.15
192	0.17
193	0.17
194	0.19
195	0.17
196	0.21
197	0.22
198	0.27
199	0.3
200	0.33
201	0.43
202	0.46
203	0.5
204	0.49
205	0.55
206	0.58
207	0.58
208	0.61
209	0.53
210	0.49
211	0.44
212	0.42
213	0.33
214	0.26
215	0.2
216	0.11
217	0.11
218	0.09
219	0.14
220	0.22
221	0.27
222	0.28
223	0.31
224	0.32
225	0.35
226	0.37
227	0.34
228	0.33
229	0.29
230	0.33
231	0.36
232	0.37
233	0.31
234	0.29
235	0.26
236	0.2
237	0.22
238	0.18
239	0.16
240	0.17
241	0.22
242	0.3
243	0.32
244	0.35
245	0.4
246	0.4
247	0.45
248	0.46
249	0.44
250	0.37
251	0.37
252	0.38
253	0.35
254	0.34
255	0.26
256	0.28
257	0.26
258	0.25
259	0.23
260	0.18
261	0.17
262	0.19
263	0.2
264	0.16
265	0.14
266	0.15
267	0.15
268	0.17
269	0.16
270	0.19
271	0.18
272	0.19
273	0.21
274	0.29
275	0.35
276	0.39
277	0.41
278	0.46
279	0.54
280	0.59
281	0.61
282	0.63
283	0.67
284	0.67
285	0.66
286	0.63
287	0.56
288	0.54
289	0.54
290	0.43
291	0.34
292	0.27
293	0.23
294	0.16
295	0.15
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.14
301	0.2
302	0.21
303	0.28
304	0.38
305	0.45
306	0.54
307	0.56
308	0.57
309	0.53
310	0.58
311	0.5
312	0.42
313	0.36
314	0.26
315	0.25
316	0.2
317	0.19
318	0.12
319	0.16
320	0.16
321	0.13
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.17
326	0.25
327	0.22
328	0.23
329	0.25
330	0.26
331	0.25
332	0.25
333	0.26
334	0.21
335	0.21
336	0.19
337	0.17
338	0.16
339	0.16
340	0.16
341	0.15
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.11
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.03
357	0.03
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.08
362	0.08
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.12
368	0.12
369	0.1
370	0.17
371	0.18
372	0.22
373	0.23
374	0.24
375	0.25
376	0.26
377	0.25
378	0.19
379	0.21
380	0.2
381	0.2
382	0.19
383	0.2
384	0.2
385	0.21
386	0.22
387	0.16
388	0.17
389	0.19
390	0.27
391	0.29
392	0.29
393	0.27
394	0.28
395	0.29
396	0.27
397	0.27
398	0.23
399	0.22
400	0.27
401	0.34
402	0.35
403	0.33
404	0.35
405	0.34
406	0.34
407	0.35
408	0.32
409	0.33
410	0.32
411	0.33
412	0.39
413	0.45
414	0.43
415	0.39
416	0.38
417	0.32
418	0.33
419	0.33
420	0.28
421	0.23
422	0.24
423	0.24
424	0.22
425	0.22
426	0.19
427	0.2
428	0.17
429	0.16
430	0.13
431	0.14
432	0.13
433	0.14
434	0.14
435	0.13
436	0.19
437	0.2
438	0.23
439	0.27
440	0.27
441	0.27
442	0.28
443	0.28
444	0.23
445	0.24
446	0.24
447	0.22
448	0.25
449	0.25
450	0.3
451	0.3
452	0.32
453	0.31
454	0.33
455	0.29
456	0.28
457	0.27
458	0.21
459	0.24
460	0.2
461	0.18
462	0.14
463	0.15
464	0.15
465	0.14
466	0.15
467	0.12
468	0.11
469	0.12
470	0.12
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.1
475	0.11
476	0.13
477	0.14
478	0.16
479	0.17
480	0.18
481	0.25
482	0.26
483	0.32
484	0.35
485	0.36
486	0.36
487	0.35
488	0.35
489	0.3
490	0.3
491	0.22
492	0.16
493	0.15
494	0.14
495	0.17
496	0.18
497	0.19
498	0.18
499	0.22
500	0.24
501	0.24
502	0.29
503	0.27
504	0.27
505	0.27
506	0.32
507	0.31
508	0.32
509	0.31
510	0.26
511	0.27
512	0.25
513	0.23
514	0.17
515	0.13
516	0.11
517	0.1
518	0.09
519	0.07
520	0.09
521	0.09
522	0.11
523	0.12
524	0.17
525	0.17
526	0.18
527	0.19
528	0.21
529	0.23
530	0.22
531	0.25
532	0.22
533	0.23
534	0.27
535	0.26
536	0.21
537	0.19
538	0.18
539	0.15
540	0.14
541	0.12
542	0.09
543	0.07
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.1
553	0.12
554	0.16
555	0.15
556	0.18
557	0.18
558	0.22
559	0.23
560	0.22
561	0.2
562	0.23
563	0.23
564	0.24
565	0.24
566	0.2
567	0.18
568	0.19
569	0.2
570	0.15
571	0.14
572	0.14
573	0.13
574	0.12
575	0.14
576	0.14
577	0.12
578	0.12
579	0.18
580	0.17
581	0.2
582	0.25
583	0.24
584	0.29
585	0.35
586	0.37
587	0.33
588	0.33
589	0.37
590	0.32
591	0.31
592	0.26
593	0.19
594	0.16
595	0.15
596	0.14
597	0.06
598	0.07
599	0.07
600	0.06
601	0.08
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.14
606	0.19
607	0.26
608	0.27
609	0.28
610	0.37
611	0.36
612	0.35
613	0.33
614	0.29
615	0.22
616	0.26
617	0.28
618	0.2
619	0.23
620	0.23
621	0.21
622	0.2
623	0.19
624	0.15
625	0.13
626	0.12
627	0.08
628	0.07
629	0.08
630	0.09
631	0.1
632	0.09
633	0.09
634	0.11
635	0.14
636	0.22
637	0.32
638	0.38
639	0.46
640	0.48
641	0.56
642	0.59
643	0.65
644	0.62
645	0.56
646	0.54
647	0.5
648	0.53
649	0.44
650	0.44
651	0.4
652	0.36
653	0.37
654	0.35
655	0.33
656	0.3
657	0.33
658	0.29
659	0.26
660	0.28
661	0.31
662	0.32
663	0.32
664	0.31
665	0.3
666	0.34
667	0.35
668	0.33
669	0.29
670	0.31
671	0.29
672	0.31
673	0.3
674	0.26
675	0.23
676	0.21
677	0.18
678	0.13
679	0.13
680	0.11
681	0.09
682	0.08
683	0.09
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.1
688	0.15
689	0.15
690	0.16
691	0.18
692	0.22
693	0.23
694	0.24
695	0.21
696	0.18
697	0.18
698	0.18
699	0.16
700	0.13
701	0.12
702	0.11
703	0.13
704	0.09
705	0.11
706	0.13
707	0.14
708	0.13
709	0.13
710	0.13
711	0.12
712	0.13
713	0.11
714	0.09
715	0.09
716	0.1
717	0.11
718	0.11
719	0.1
720	0.11
721	0.11
722	0.14
723	0.14
724	0.14
725	0.14
726	0.21
727	0.22
728	0.23
729	0.23
730	0.2
731	0.21
732	0.23
733	0.29
734	0.24
735	0.24
736	0.22
737	0.25
738	0.26
739	0.24
740	0.23
741	0.16
742	0.14
743	0.13
744	0.14
745	0.12
746	0.12
747	0.11
748	0.1
749	0.15
750	0.16
751	0.2
752	0.21
753	0.21
754	0.24
755	0.24
756	0.25
757	0.23
758	0.24
759	0.22
760	0.22
761	0.21
762	0.19
763	0.19
764	0.18
765	0.15
766	0.13
767	0.11
768	0.09
769	0.1
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.12
774	0.14
775	0.15
776	0.19
777	0.18
778	0.19
779	0.18

A0A4T0VPD8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer