Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0VYP2

Protein Details
Accession A0A4T0VYP2    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-56KVEPEKVTKKKTTKVEKAEKAEKVEBasic
88-110AAKKQKPVKASSKSKKSKPEPVEHydrophilic
167-188DVGKVPKHAKKQKQLTNGKKEEBasic
302-327ESNWTHKVSREEKKRLERAQKLKEIGHydrophilic
382-405SAEAEKPKAAKPKAKKGGRRKSKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-106KRTRSATASAEKPAAKKTAKVEKVEKVEPEKVTKKKTTKVEKAEKAEKVEKVEKVEKVEKVVKAEKAPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPVKASSKSKKSKP
282-286RFKKI
313-316EKKR
387-405KPKAAKPKAKKGGRRKSKA
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.5, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRTRSATASAEKPAAKKTAKVEKVEKVEPEKVTKKKTTKVEKAEKAEKVEKVEKVEKVEKVVKAEKAPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPVKASSKSKKSKPEPVEEAEPETIEAAEESVVALDDAADSDEELDADIQALAAGLDSDAEKTPAGNGTFKEGMDVGKVPKHAKKQKQLTNGKKEEPGIVFISRLPHGFYEHELKGYFSQFGPINRLRLARNKKTGASKHYAFLEFAEESTAEIVSKTMDSYLLFGHILKVKTVPRDQLHEDVWKGANKRFKKIPWSKIAAGEVAKPRTESNWTHKVSREEKKRLERAQKLKEIGYEFEAPKLKEAVAPPPEPMVVDAPEEPKAVEAAPVEEKPVEEAAAEEAAAEEEESAEAEKPKAAKPKAKKGGRRKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.58
3 0.57
4 0.51
5 0.49
6 0.48
7 0.46
8 0.4
9 0.4
10 0.45
11 0.51
12 0.54
13 0.6
14 0.62
15 0.63
16 0.68
17 0.68
18 0.66
19 0.62
20 0.62
21 0.58
22 0.6
23 0.6
24 0.6
25 0.64
26 0.67
27 0.67
28 0.69
29 0.75
30 0.77
31 0.79
32 0.82
33 0.84
34 0.84
35 0.85
36 0.86
37 0.8
38 0.77
39 0.73
40 0.66
41 0.63
42 0.6
43 0.54
44 0.53
45 0.55
46 0.51
47 0.52
48 0.55
49 0.49
50 0.49
51 0.53
52 0.47
53 0.47
54 0.5
55 0.47
56 0.47
57 0.56
58 0.57
59 0.61
60 0.66
61 0.67
62 0.69
63 0.7
64 0.7
65 0.67
66 0.69
67 0.67
68 0.62
69 0.58
70 0.5
71 0.46
72 0.4
73 0.36
74 0.31
75 0.28
76 0.27
77 0.32
78 0.4
79 0.44
80 0.47
81 0.52
82 0.57
83 0.62
84 0.71
85 0.74
86 0.76
87 0.79
88 0.82
89 0.85
90 0.82
91 0.82
92 0.78
93 0.77
94 0.73
95 0.69
96 0.69
97 0.6
98 0.56
99 0.46
100 0.39
101 0.3
102 0.23
103 0.18
104 0.11
105 0.09
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.02
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.16
148 0.18
149 0.17
150 0.17
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.14
155 0.1
156 0.11
157 0.14
158 0.16
159 0.21
160 0.3
161 0.38
162 0.45
163 0.54
164 0.61
165 0.67
166 0.75
167 0.8
168 0.81
169 0.82
170 0.78
171 0.71
172 0.64
173 0.57
174 0.5
175 0.4
176 0.33
177 0.24
178 0.2
179 0.17
180 0.16
181 0.17
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.09
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.24
206 0.23
207 0.3
208 0.38
209 0.4
210 0.46
211 0.47
212 0.49
213 0.55
214 0.58
215 0.55
216 0.53
217 0.47
218 0.42
219 0.42
220 0.39
221 0.31
222 0.26
223 0.23
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.1
246 0.13
247 0.14
248 0.13
249 0.17
250 0.18
251 0.24
252 0.27
253 0.31
254 0.29
255 0.34
256 0.37
257 0.38
258 0.38
259 0.36
260 0.34
261 0.3
262 0.3
263 0.29
264 0.28
265 0.27
266 0.33
267 0.32
268 0.38
269 0.41
270 0.44
271 0.51
272 0.59
273 0.64
274 0.65
275 0.69
276 0.65
277 0.63
278 0.6
279 0.52
280 0.43
281 0.4
282 0.37
283 0.32
284 0.3
285 0.26
286 0.25
287 0.24
288 0.29
289 0.29
290 0.3
291 0.38
292 0.4
293 0.43
294 0.48
295 0.54
296 0.57
297 0.61
298 0.64
299 0.63
300 0.7
301 0.76
302 0.81
303 0.82
304 0.83
305 0.83
306 0.83
307 0.84
308 0.82
309 0.76
310 0.68
311 0.64
312 0.56
313 0.48
314 0.42
315 0.39
316 0.31
317 0.34
318 0.36
319 0.31
320 0.31
321 0.3
322 0.26
323 0.23
324 0.25
325 0.28
326 0.3
327 0.31
328 0.3
329 0.3
330 0.3
331 0.26
332 0.26
333 0.2
334 0.14
335 0.16
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.19
340 0.17
341 0.15
342 0.14
343 0.12
344 0.13
345 0.11
346 0.13
347 0.17
348 0.17
349 0.19
350 0.18
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.15
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.08
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.09
371 0.11
372 0.11
373 0.14
374 0.17
375 0.23
376 0.32
377 0.38
378 0.46
379 0.55
380 0.65
381 0.73
382 0.8
383 0.85
384 0.87
385 0.9