FuNGI

A0A4T0VYI2

Protein Details

Accession

A0A4T0VYI2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
557-585	NATPSEKPEKPEHHKRTRRGRGGGKAAAN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-210	KKASKQKEAAAAKSAKQARQESNTKGKAPVSTADDSKKGKKDTKGEKSADKPKE
337-358	KSGRSRRGGGGKNAGASESKGK
371-391	AKAPVVLLKKKDEERNKEKAT
562-582	EKPEKPEHHKRTRRGRGGGKA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MTEQELWNNLGDEWKAGNGLVSWHNFAQGKISQDPAKPSRPGRVYLHVLKRESLNTLSTLIQAKSWEDAKMTSNSPSLVGPPVLEFAIYNKVPGGKKRTDPRQGTIDQDPEFMSFLLSLTNPEMDKENEGSESKDAEESKPEAKVTTTPLIEYIKEKKASKQKEAAAAKSAKQARQESNTKGKAPVSTADDSKKGKKDTKGEKSADKPKETVKILTKKANAEAVKAAEAAASQIAQASSSSQDAPKSRRAGIAAAARILQRDLGISPGSAHRRARLDAAKAEAEAKTTTTATATTKEPAQPAAEPATPAPAPVAAPAQPSSAASQASERSTTPTAAKSGRSRRGGGGKNAGASESKGKSTEASSNAPAPPAKAPVVLLKKKDEERNKEKATKADKADKDVSGSASQAAAPSTNAKSNPPAAPKSSGKGGNSKKSSAAVTPGVTRGFVKHANPSQGVTEALLKQAMEVFGTVTFVEIDKRKGFAYVDFSDHASLVRAVAASPVQVAQGTVQVLERKEKKAAAPNSNTKAEPGGANAESSAAATRSNSAAPSASGSAKNATPSEKPEKPEHHKRTRRGRGGGKAAANASGSNSGNKDASAAGTG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.14
3	0.13
4	0.14
5	0.11
6	0.14
7	0.18
8	0.19
9	0.22
10	0.22
11	0.27
12	0.27
13	0.27
14	0.29
15	0.27
16	0.3
17	0.28
18	0.34
19	0.34
20	0.36
21	0.45
22	0.46
23	0.49
24	0.51
25	0.52
26	0.56
27	0.55
28	0.58
29	0.55
30	0.57
31	0.58
32	0.62
33	0.68
34	0.65
35	0.63
36	0.59
37	0.57
38	0.5
39	0.46
40	0.39
41	0.31
42	0.25
43	0.25
44	0.24
45	0.23
46	0.25
47	0.21
48	0.2
49	0.19
50	0.19
51	0.21
52	0.22
53	0.2
54	0.17
55	0.19
56	0.21
57	0.24
58	0.25
59	0.24
60	0.24
61	0.23
62	0.23
63	0.22
64	0.2
65	0.18
66	0.17
67	0.14
68	0.13
69	0.14
70	0.13
71	0.12
72	0.11
73	0.1
74	0.17
75	0.17
76	0.16
77	0.16
78	0.22
79	0.25
80	0.32
81	0.37
82	0.36
83	0.45
84	0.54
85	0.63
86	0.68
87	0.7
88	0.69
89	0.7
90	0.66
91	0.63
92	0.59
93	0.55
94	0.45
95	0.41
96	0.36
97	0.29
98	0.27
99	0.21
100	0.15
101	0.09
102	0.08
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.09
107	0.11
108	0.11
109	0.11
110	0.14
111	0.14
112	0.17
113	0.17
114	0.17
115	0.18
116	0.18
117	0.19
118	0.18
119	0.18
120	0.16
121	0.18
122	0.18
123	0.16
124	0.2
125	0.21
126	0.22
127	0.23
128	0.23
129	0.2
130	0.2
131	0.21
132	0.23
133	0.26
134	0.23
135	0.21
136	0.24
137	0.25
138	0.25
139	0.26
140	0.27
141	0.28
142	0.33
143	0.34
144	0.4
145	0.48
146	0.54
147	0.58
148	0.59
149	0.57
150	0.62
151	0.65
152	0.59
153	0.57
154	0.52
155	0.46
156	0.46
157	0.46
158	0.39
159	0.41
160	0.44
161	0.42
162	0.47
163	0.52
164	0.51
165	0.57
166	0.59
167	0.54
168	0.51
169	0.47
170	0.41
171	0.37
172	0.34
173	0.29
174	0.27
175	0.28
176	0.28
177	0.31
178	0.33
179	0.37
180	0.39
181	0.39
182	0.43
183	0.47
184	0.54
185	0.6
186	0.67
187	0.7
188	0.67
189	0.69
190	0.71
191	0.74
192	0.71
193	0.63
194	0.54
195	0.49
196	0.53
197	0.48
198	0.46
199	0.45
200	0.46
201	0.48
202	0.53
203	0.52
204	0.47
205	0.47
206	0.48
207	0.4
208	0.33
209	0.31
210	0.25
211	0.22
212	0.2
213	0.18
214	0.1
215	0.1
216	0.08
217	0.06
218	0.05
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.12
230	0.15
231	0.19
232	0.25
233	0.27
234	0.27
235	0.29
236	0.29
237	0.27
238	0.28
239	0.3
240	0.24
241	0.21
242	0.21
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.12
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.06
253	0.07
254	0.12
255	0.15
256	0.18
257	0.18
258	0.2
259	0.22
260	0.23
261	0.28
262	0.27
263	0.27
264	0.26
265	0.28
266	0.25
267	0.23
268	0.23
269	0.18
270	0.15
271	0.12
272	0.1
273	0.09
274	0.08
275	0.08
276	0.07
277	0.08
278	0.08
279	0.1
280	0.11
281	0.11
282	0.12
283	0.14
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.12
288	0.13
289	0.15
290	0.13
291	0.12
292	0.12
293	0.13
294	0.12
295	0.12
296	0.1
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.06
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.09
310	0.08
311	0.09
312	0.11
313	0.11
314	0.12
315	0.11
316	0.13
317	0.14
318	0.15
319	0.15
320	0.15
321	0.17
322	0.17
323	0.21
324	0.25
325	0.33
326	0.39
327	0.41
328	0.42
329	0.43
330	0.5
331	0.51
332	0.48
333	0.46
334	0.4
335	0.38
336	0.36
337	0.32
338	0.24
339	0.2
340	0.21
341	0.15
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.15
346	0.17
347	0.21
348	0.19
349	0.21
350	0.21
351	0.24
352	0.24
353	0.25
354	0.22
355	0.19
356	0.16
357	0.16
358	0.15
359	0.12
360	0.13
361	0.19
362	0.28
363	0.3
364	0.32
365	0.32
366	0.37
367	0.42
368	0.49
369	0.51
370	0.52
371	0.56
372	0.64
373	0.66
374	0.68
375	0.65
376	0.65
377	0.62
378	0.6
379	0.58
380	0.58
381	0.53
382	0.53
383	0.54
384	0.47
385	0.42
386	0.36
387	0.33
388	0.24
389	0.22
390	0.16
391	0.13
392	0.12
393	0.1
394	0.09
395	0.07
396	0.07
397	0.1
398	0.11
399	0.14
400	0.15
401	0.16
402	0.19
403	0.23
404	0.27
405	0.29
406	0.31
407	0.3
408	0.36
409	0.36
410	0.36
411	0.38
412	0.37
413	0.34
414	0.4
415	0.45
416	0.48
417	0.49
418	0.48
419	0.44
420	0.41
421	0.41
422	0.33
423	0.3
424	0.24
425	0.22
426	0.22
427	0.23
428	0.21
429	0.2
430	0.19
431	0.16
432	0.17
433	0.19
434	0.19
435	0.26
436	0.3
437	0.35
438	0.35
439	0.35
440	0.32
441	0.29
442	0.28
443	0.21
444	0.2
445	0.15
446	0.15
447	0.15
448	0.13
449	0.12
450	0.13
451	0.12
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.11
462	0.12
463	0.17
464	0.17
465	0.19
466	0.19
467	0.2
468	0.21
469	0.21
470	0.26
471	0.24
472	0.26
473	0.26
474	0.27
475	0.26
476	0.25
477	0.21
478	0.15
479	0.13
480	0.1
481	0.09
482	0.08
483	0.08
484	0.09
485	0.09
486	0.07
487	0.08
488	0.08
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.07
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.11
497	0.15
498	0.16
499	0.25
500	0.29
501	0.29
502	0.33
503	0.36
504	0.39
505	0.46
506	0.53
507	0.55
508	0.59
509	0.66
510	0.68
511	0.69
512	0.63
513	0.54
514	0.47
515	0.39
516	0.31
517	0.24
518	0.23
519	0.19
520	0.19
521	0.18
522	0.16
523	0.15
524	0.14
525	0.13
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.11
530	0.12
531	0.13
532	0.13
533	0.13
534	0.14
535	0.14
536	0.17
537	0.17
538	0.19
539	0.19
540	0.21
541	0.22
542	0.23
543	0.26
544	0.24
545	0.25
546	0.25
547	0.32
548	0.39
549	0.42
550	0.45
551	0.51
552	0.59
553	0.65
554	0.73
555	0.76
556	0.78
557	0.82
558	0.88
559	0.9
560	0.91
561	0.91
562	0.89
563	0.88
564	0.87
565	0.87
566	0.85
567	0.77
568	0.7
569	0.61
570	0.54
571	0.45
572	0.35
573	0.28
574	0.26
575	0.23
576	0.22
577	0.22
578	0.23
579	0.22
580	0.22
581	0.21
582	0.16

A0A4T0VYI2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer