Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S2N8B3

Protein Details
Accession A0A4S2N8B3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-59LRDHCQCKHCRHGETKQRLLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_pero 9.5, pero 6.5, nucl 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010376  GBBH-like_N  
IPR038492  GBBH-like_N_sf  
IPR042098  TauD-like_sf  
IPR003819  TauD/TfdA-like  
IPR012776  Trimethyllysine_dOase  
Gene Ontology GO:0005506  F:iron ion binding  
GO:0050353  F:trimethyllysine dioxygenase activity  
GO:0045329  P:carnitine biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF06155  GBBH-like_N  
PF02668  TauD  
CDD cd00250  CAS_like  
Amino Acid Sequences MKADATATVSGHHKVSFDDRKVLVPWDEGKTSQFHHIWLRDHCQCKHCRHGETKQRLLDTFSIPRNIKPDDVVQGEEGLTIKWKDGHESSFSFKWLHLHSYSPRLEKYLSPQFKFWGAEIADELPEVDYEAVMESDKGVAIWVHKIYKYGFCLVNNVPPTPEATQSLIERIAFIRHTHYGGFWDFTADLAKKDLAYSDVFLGVHTDTTYFSDPAGLQMFHLLSHTDGSGGANTFVDGFRAAKLLREENPEAYKTLSSIRIPAHASGNEDSSIQPFSPFPVFNHHPVNGELMQIRWNNDDRGTMDRWSDMEDVEMFYDACRAWNDILTRKENVYRVQLKPGRPLIFDNWRVLHGREAFTGKRRMCGAYVNRDDWISRFKTLTTKRETVLNAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.29
3 0.36
4 0.37
5 0.42
6 0.41
7 0.44
8 0.45
9 0.47
10 0.39
11 0.34
12 0.35
13 0.33
14 0.34
15 0.31
16 0.31
17 0.3
18 0.3
19 0.33
20 0.29
21 0.28
22 0.34
23 0.39
24 0.43
25 0.46
26 0.51
27 0.52
28 0.58
29 0.6
30 0.61
31 0.63
32 0.65
33 0.7
34 0.7
35 0.69
36 0.71
37 0.76
38 0.78
39 0.8
40 0.81
41 0.76
42 0.72
43 0.64
44 0.6
45 0.53
46 0.48
47 0.45
48 0.4
49 0.42
50 0.4
51 0.42
52 0.42
53 0.4
54 0.35
55 0.31
56 0.31
57 0.29
58 0.31
59 0.3
60 0.25
61 0.24
62 0.23
63 0.21
64 0.17
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.14
70 0.14
71 0.18
72 0.2
73 0.23
74 0.25
75 0.28
76 0.32
77 0.29
78 0.31
79 0.27
80 0.25
81 0.26
82 0.24
83 0.26
84 0.22
85 0.26
86 0.28
87 0.36
88 0.39
89 0.38
90 0.37
91 0.34
92 0.35
93 0.31
94 0.36
95 0.38
96 0.41
97 0.39
98 0.4
99 0.39
100 0.41
101 0.4
102 0.32
103 0.29
104 0.21
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.16
109 0.14
110 0.14
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.08
129 0.1
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.16
134 0.2
135 0.21
136 0.22
137 0.23
138 0.21
139 0.26
140 0.25
141 0.29
142 0.27
143 0.25
144 0.21
145 0.19
146 0.21
147 0.18
148 0.18
149 0.14
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.15
155 0.13
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.07
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.13
230 0.16
231 0.18
232 0.24
233 0.25
234 0.27
235 0.3
236 0.28
237 0.26
238 0.24
239 0.21
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.18
245 0.18
246 0.21
247 0.22
248 0.23
249 0.24
250 0.21
251 0.24
252 0.21
253 0.22
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.11
263 0.14
264 0.15
265 0.14
266 0.22
267 0.25
268 0.28
269 0.34
270 0.32
271 0.31
272 0.3
273 0.34
274 0.26
275 0.25
276 0.21
277 0.16
278 0.21
279 0.2
280 0.21
281 0.2
282 0.22
283 0.22
284 0.23
285 0.25
286 0.22
287 0.25
288 0.26
289 0.24
290 0.22
291 0.22
292 0.21
293 0.22
294 0.21
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.09
302 0.08
303 0.1
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.16
310 0.2
311 0.26
312 0.32
313 0.34
314 0.35
315 0.36
316 0.41
317 0.4
318 0.41
319 0.43
320 0.45
321 0.44
322 0.53
323 0.56
324 0.54
325 0.59
326 0.63
327 0.56
328 0.5
329 0.52
330 0.49
331 0.53
332 0.53
333 0.5
334 0.43
335 0.42
336 0.43
337 0.4
338 0.39
339 0.34
340 0.33
341 0.31
342 0.35
343 0.37
344 0.41
345 0.49
346 0.43
347 0.43
348 0.43
349 0.42
350 0.38
351 0.44
352 0.45
353 0.47
354 0.53
355 0.5
356 0.49
357 0.47
358 0.46
359 0.39
360 0.39
361 0.31
362 0.27
363 0.26
364 0.27
365 0.36
366 0.44
367 0.51
368 0.52
369 0.53
370 0.52
371 0.57