Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DFG3

Protein Details
Accession A5DFG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-277EPTASPRKRRPPSIFLSRPKRPSRPPPKTEKHTSKSNPEPSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-266PRKRRPPSIFLSRPKRPSRPPPKTEK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG pgu:PGUG_02014  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPIQRLRDLAAQKCVSNVALLHDVGDTPYHILKPILCRMSARQLDQIESKSSQIIPYSDQLWPNLISRDFPNRPLASRSLVDTPMPHKALYFKYLSEREALQRDSAQRLRSMTQRLRQEKSKNAITPVKHLLRDPTIRRRPVSKSSPPLSSLSIIQRARRETQERSRLFQKNAPKDSFSKYLVQPKKQPVMRPAAAHVGASAPLHAPKPIKITETSSNAPPTTSTQNDIPKPQNLEPTASPRKRRPPSIFLSRPKRPSRPPPKTEKHTSKSNPEPSEVQAIRSTIFNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.32
3 0.27
4 0.22
5 0.18
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.11
14 0.1
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.22
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.35
26 0.44
27 0.46
28 0.42
29 0.4
30 0.39
31 0.42
32 0.43
33 0.41
34 0.35
35 0.31
36 0.29
37 0.25
38 0.24
39 0.22
40 0.2
41 0.19
42 0.17
43 0.18
44 0.2
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.21
49 0.21
50 0.2
51 0.22
52 0.2
53 0.19
54 0.21
55 0.3
56 0.29
57 0.31
58 0.37
59 0.35
60 0.36
61 0.38
62 0.38
63 0.32
64 0.31
65 0.31
66 0.26
67 0.26
68 0.24
69 0.23
70 0.23
71 0.25
72 0.26
73 0.22
74 0.19
75 0.22
76 0.24
77 0.26
78 0.24
79 0.19
80 0.25
81 0.27
82 0.27
83 0.25
84 0.24
85 0.24
86 0.27
87 0.27
88 0.21
89 0.23
90 0.24
91 0.29
92 0.3
93 0.27
94 0.25
95 0.26
96 0.27
97 0.29
98 0.35
99 0.35
100 0.38
101 0.46
102 0.5
103 0.52
104 0.57
105 0.58
106 0.58
107 0.58
108 0.58
109 0.5
110 0.5
111 0.51
112 0.44
113 0.44
114 0.43
115 0.41
116 0.35
117 0.33
118 0.31
119 0.3
120 0.36
121 0.37
122 0.4
123 0.44
124 0.47
125 0.48
126 0.49
127 0.5
128 0.51
129 0.54
130 0.51
131 0.51
132 0.51
133 0.52
134 0.49
135 0.45
136 0.38
137 0.31
138 0.25
139 0.2
140 0.24
141 0.23
142 0.24
143 0.26
144 0.27
145 0.29
146 0.32
147 0.35
148 0.34
149 0.43
150 0.5
151 0.48
152 0.5
153 0.56
154 0.56
155 0.54
156 0.52
157 0.52
158 0.51
159 0.56
160 0.54
161 0.48
162 0.46
163 0.48
164 0.48
165 0.41
166 0.36
167 0.33
168 0.42
169 0.45
170 0.48
171 0.5
172 0.52
173 0.58
174 0.57
175 0.57
176 0.53
177 0.55
178 0.53
179 0.47
180 0.43
181 0.4
182 0.37
183 0.31
184 0.26
185 0.17
186 0.15
187 0.13
188 0.12
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.18
196 0.2
197 0.21
198 0.22
199 0.27
200 0.31
201 0.36
202 0.36
203 0.35
204 0.36
205 0.34
206 0.32
207 0.28
208 0.25
209 0.26
210 0.25
211 0.25
212 0.27
213 0.35
214 0.38
215 0.43
216 0.43
217 0.42
218 0.46
219 0.46
220 0.49
221 0.42
222 0.44
223 0.41
224 0.46
225 0.52
226 0.52
227 0.56
228 0.57
229 0.66
230 0.7
231 0.77
232 0.75
233 0.73
234 0.76
235 0.8
236 0.81
237 0.8
238 0.82
239 0.81
240 0.82
241 0.82
242 0.82
243 0.8
244 0.82
245 0.83
246 0.84
247 0.84
248 0.86
249 0.88
250 0.88
251 0.89
252 0.89
253 0.83
254 0.83
255 0.82
256 0.81
257 0.81
258 0.82
259 0.74
260 0.68
261 0.65
262 0.57
263 0.6
264 0.51
265 0.44
266 0.37
267 0.35
268 0.31