FuNGI

A5DQ08

Protein Details

Accession

A5DQ08

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
393-424	TSTKRTFKPSISKVHKNKRKPRFSAKKEFVAA	Hydrophilic
436-465	RWLPMRLRSYYKPTKKDRKKGGQQGALEQP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
400-419	KPSISKVHKNKRKPRFSAKK
447-475	KPTKKDRKKGGQQGALEQPKDKKKKKSKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72
Gene Ontology	GO:0048500 C:signal recognition particle GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	pgu:PGUG_05359 -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72

Amino Acid Sequences

MKVGKMSVTDYQSDEKSYDCLFNDSLILIANNQLGDALKLLDLAQSVCTTQNQDLDAGDLLLELAPIKLTIAYIYQVQGRISEAKALLDEFRNNETVDHMTKLVTTNNYYALEGIPDSKSSIALRDLDYQARMHKLQQKLTKPQSNVLMKNKLLLQFHAHALSKSSKYFTKAFTSEYQKLYPGDYTFNVYKVLNQLDITISDVNDGNAEQCARKLYQHAKTDLSEPERISTTLLLVAVNNIMGRYDQCLSVLEKIWDSRTSETLIPALAGTLFGLLNELNYHQDDQRDSLSKTKAKQTSFIVALIKYFQDHGVSKCYNFAREIAFRLYQNGDEKAEDVLRVLQKEDPQDRLVAAALDGDNSKLDKVETLQSSTDINELLSTSIASMIPAPPATSTKRTFKPSISKVHKNKRKPRFSAKKEFVAAEKFNAADLDEERWLPMRLRSYYKPTKKDRKKGGQQGALEQPKDKKKKKSKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.23
3	0.23
4	0.23
5	0.24
6	0.21
7	0.23
8	0.22
9	0.23
10	0.22
11	0.19
12	0.17
13	0.14
14	0.13
15	0.09
16	0.11
17	0.11
18	0.1
19	0.1
20	0.1
21	0.1
22	0.1
23	0.1
24	0.09
25	0.07
26	0.08
27	0.08
28	0.09
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.1
33	0.11
34	0.12
35	0.14
36	0.16
37	0.17
38	0.2
39	0.2
40	0.2
41	0.19
42	0.19
43	0.18
44	0.14
45	0.12
46	0.08
47	0.07
48	0.06
49	0.06
50	0.05
51	0.04
52	0.04
53	0.04
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.06
58	0.07
59	0.08
60	0.09
61	0.11
62	0.13
63	0.15
64	0.15
65	0.15
66	0.16
67	0.18
68	0.17
69	0.2
70	0.18
71	0.17
72	0.17
73	0.18
74	0.18
75	0.18
76	0.2
77	0.19
78	0.21
79	0.22
80	0.21
81	0.2
82	0.2
83	0.21
84	0.21
85	0.2
86	0.17
87	0.16
88	0.17
89	0.18
90	0.19
91	0.18
92	0.19
93	0.18
94	0.22
95	0.22
96	0.22
97	0.2
98	0.17
99	0.15
100	0.13
101	0.14
102	0.1
103	0.1
104	0.11
105	0.1
106	0.12
107	0.11
108	0.13
109	0.13
110	0.15
111	0.17
112	0.21
113	0.23
114	0.24
115	0.25
116	0.24
117	0.24
118	0.26
119	0.24
120	0.25
121	0.3
122	0.34
123	0.4
124	0.48
125	0.52
126	0.58
127	0.67
128	0.68
129	0.62
130	0.61
131	0.63
132	0.62
133	0.61
134	0.58
135	0.56
136	0.49
137	0.49
138	0.48
139	0.43
140	0.37
141	0.31
142	0.28
143	0.24
144	0.26
145	0.27
146	0.24
147	0.2
148	0.22
149	0.25
150	0.22
151	0.21
152	0.22
153	0.21
154	0.24
155	0.27
156	0.27
157	0.29
158	0.28
159	0.31
160	0.35
161	0.41
162	0.42
163	0.41
164	0.39
165	0.34
166	0.34
167	0.31
168	0.27
169	0.2
170	0.17
171	0.15
172	0.19
173	0.17
174	0.17
175	0.18
176	0.16
177	0.16
178	0.17
179	0.17
180	0.14
181	0.13
182	0.13
183	0.12
184	0.12
185	0.13
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.08
199	0.09
200	0.09
201	0.15
202	0.22
203	0.29
204	0.34
205	0.37
206	0.37
207	0.37
208	0.4
209	0.38
210	0.34
211	0.29
212	0.24
213	0.22
214	0.21
215	0.2
216	0.17
217	0.13
218	0.1
219	0.08
220	0.08
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.09
236	0.1
237	0.12
238	0.13
239	0.11
240	0.11
241	0.12
242	0.13
243	0.14
244	0.14
245	0.14
246	0.14
247	0.16
248	0.16
249	0.15
250	0.14
251	0.12
252	0.11
253	0.09
254	0.08
255	0.05
256	0.04
257	0.03
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.07
268	0.08
269	0.09
270	0.11
271	0.12
272	0.13
273	0.16
274	0.18
275	0.18
276	0.23
277	0.28
278	0.3
279	0.32
280	0.39
281	0.41
282	0.39
283	0.42
284	0.4
285	0.4
286	0.38
287	0.37
288	0.3
289	0.24
290	0.24
291	0.2
292	0.17
293	0.11
294	0.11
295	0.09
296	0.1
297	0.12
298	0.13
299	0.19
300	0.2
301	0.2
302	0.25
303	0.26
304	0.24
305	0.23
306	0.23
307	0.21
308	0.22
309	0.25
310	0.23
311	0.24
312	0.23
313	0.25
314	0.24
315	0.22
316	0.24
317	0.23
318	0.2
319	0.18
320	0.19
321	0.18
322	0.17
323	0.14
324	0.12
325	0.14
326	0.16
327	0.16
328	0.16
329	0.17
330	0.2
331	0.27
332	0.3
333	0.28
334	0.27
335	0.27
336	0.26
337	0.24
338	0.21
339	0.14
340	0.11
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.1
353	0.17
354	0.18
355	0.2
356	0.21
357	0.21
358	0.22
359	0.21
360	0.2
361	0.13
362	0.11
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.14
379	0.19
380	0.24
381	0.28
382	0.35
383	0.41
384	0.48
385	0.51
386	0.55
387	0.6
388	0.61
389	0.67
390	0.68
391	0.73
392	0.76
393	0.84
394	0.86
395	0.86
396	0.89
397	0.89
398	0.9
399	0.89
400	0.9
401	0.9
402	0.91
403	0.91
404	0.88
405	0.86
406	0.79
407	0.72
408	0.66
409	0.62
410	0.53
411	0.45
412	0.4
413	0.31
414	0.27
415	0.25
416	0.21
417	0.16
418	0.15
419	0.16
420	0.15
421	0.16
422	0.16
423	0.18
424	0.19
425	0.19
426	0.22
427	0.26
428	0.3
429	0.37
430	0.42
431	0.5
432	0.6
433	0.68
434	0.72
435	0.76
436	0.82
437	0.86
438	0.9
439	0.91
440	0.91
441	0.93
442	0.94
443	0.94
444	0.91
445	0.83
446	0.8
447	0.8
448	0.76
449	0.66
450	0.6
451	0.58
452	0.61
453	0.68
454	0.68
455	0.69

A5DQ08

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer