Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V3SIX1

Protein Details
Accession A0A4V3SIX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-346TGGGQERRKRKMERRMRGGMNPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-341RRKRKMERRMR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 6, cyto 5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00048  DSRM_SF  
cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MSVLLGQSPSAPGNVHLQTAPAPGTTIFKSPTSNTTPTPTPGRTGPWYASIPLPQLQHPSLSGFTFTSKDLERQVFTHCSAAAPSSGNLQSATGNIWAQPQTPEPDNSTLQWTGASIVQTLCSIVLTSLFPALSSAALSDLRSALTAKPFHTNLSRLLRLPENLRHATQLPLSERIIAELFEAYIGGIARELGTEQFGRLHAWYYNLIQPYVKYYHEAYLNRDNINPIPTVSSSESKLRRQNVAAYTSRLMEYAAKNKLEPPKFEYKDNGLQGAGIEWQATVFLGGAQVATAKATTKLEAKHLASKGALGILRDPSALDPTAGVTGGGQERRKRKMERRMRGGMNPGIPHQGLMIHQQPLPTQWPQPSIVPQPPAIPYQLPMVFHQAPVAPMSIPMHQPMGFGSSPQPPPGLIIKREGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.19
4 0.2
5 0.21
6 0.23
7 0.22
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.18
12 0.18
13 0.2
14 0.2
15 0.21
16 0.24
17 0.25
18 0.32
19 0.35
20 0.37
21 0.36
22 0.39
23 0.41
24 0.42
25 0.46
26 0.41
27 0.37
28 0.36
29 0.39
30 0.38
31 0.4
32 0.37
33 0.36
34 0.36
35 0.34
36 0.35
37 0.31
38 0.3
39 0.29
40 0.29
41 0.26
42 0.29
43 0.28
44 0.27
45 0.25
46 0.25
47 0.23
48 0.22
49 0.21
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.19
57 0.24
58 0.26
59 0.26
60 0.26
61 0.31
62 0.31
63 0.31
64 0.31
65 0.25
66 0.22
67 0.21
68 0.21
69 0.16
70 0.14
71 0.13
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.16
88 0.19
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.27
93 0.27
94 0.27
95 0.28
96 0.25
97 0.22
98 0.2
99 0.16
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.13
133 0.15
134 0.16
135 0.21
136 0.21
137 0.23
138 0.26
139 0.26
140 0.28
141 0.33
142 0.33
143 0.29
144 0.32
145 0.31
146 0.3
147 0.33
148 0.31
149 0.31
150 0.31
151 0.31
152 0.3
153 0.28
154 0.28
155 0.25
156 0.24
157 0.19
158 0.2
159 0.2
160 0.2
161 0.18
162 0.18
163 0.16
164 0.12
165 0.1
166 0.07
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.16
199 0.14
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.22
204 0.23
205 0.24
206 0.3
207 0.33
208 0.31
209 0.31
210 0.29
211 0.25
212 0.25
213 0.21
214 0.13
215 0.12
216 0.11
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.22
222 0.26
223 0.29
224 0.35
225 0.35
226 0.36
227 0.36
228 0.4
229 0.38
230 0.4
231 0.36
232 0.33
233 0.31
234 0.29
235 0.27
236 0.21
237 0.17
238 0.15
239 0.16
240 0.2
241 0.23
242 0.23
243 0.23
244 0.28
245 0.36
246 0.36
247 0.35
248 0.35
249 0.42
250 0.43
251 0.45
252 0.44
253 0.42
254 0.46
255 0.45
256 0.39
257 0.28
258 0.26
259 0.24
260 0.21
261 0.15
262 0.08
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.14
284 0.15
285 0.2
286 0.26
287 0.28
288 0.33
289 0.33
290 0.34
291 0.3
292 0.29
293 0.24
294 0.21
295 0.2
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.11
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.06
312 0.09
313 0.12
314 0.17
315 0.2
316 0.27
317 0.34
318 0.41
319 0.48
320 0.55
321 0.61
322 0.68
323 0.74
324 0.79
325 0.81
326 0.84
327 0.82
328 0.78
329 0.75
330 0.7
331 0.64
332 0.55
333 0.47
334 0.42
335 0.36
336 0.31
337 0.24
338 0.2
339 0.16
340 0.19
341 0.22
342 0.2
343 0.21
344 0.22
345 0.22
346 0.24
347 0.28
348 0.25
349 0.26
350 0.27
351 0.3
352 0.31
353 0.34
354 0.37
355 0.4
356 0.43
357 0.41
358 0.38
359 0.38
360 0.38
361 0.37
362 0.33
363 0.27
364 0.22
365 0.26
366 0.27
367 0.26
368 0.25
369 0.31
370 0.3
371 0.29
372 0.29
373 0.24
374 0.22
375 0.21
376 0.21
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.19
383 0.21
384 0.2
385 0.2
386 0.19
387 0.22
388 0.18
389 0.18
390 0.2
391 0.25
392 0.27
393 0.29
394 0.29
395 0.23
396 0.27
397 0.34
398 0.38
399 0.32