Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V3SHN8

Protein Details
Accession A0A4V3SHN8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-349APATKNTSTKKKAEKENEEDYFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-387NEKKAEETAIKKEKKEG
Subcellular Location(s) mito 24.5, cyto_mito 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002043  UDG_fam1  
IPR018085  Ura-DNA_Glyclase_AS  
IPR005122  Uracil-DNA_glycosylase-like  
IPR036895  Uracil-DNA_glycosylase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004844  F:uracil DNA N-glycosylase activity  
GO:0006284  P:base-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03167  UDG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00130  U_DNA_GLYCOSYLASE  
CDD cd10027  UDG-F1-like  
Amino Acid Sequences MSNSAKRKATTTLSSSSKRASTITSFFTPKSSQTLSTNTSSTSSTSSTFDKSAWISKLTPEQRDLLQLEINTLHESWLAVLKDELVTPGFLGLKRFLRKEKEAGKKVFPPEEDVYAWSRYTPLETVKVVILGQDPYHGPNQAMGLSFSVRSPTPAPPSLQNIYKSLHHDYPSFTPPPNRSGLLTPWASRGVLMLNACLTVVQASANSHSGKGWEALTQKVIEVVAKRRTRGVVFMAWGSPAGKRVAGVEREKGRHCVLKSVHPSPLSAHKGFLDCGHFKAANEWLQTRYGDDGPIDWSLHGPPVGIPQSRISASSSTPNPDPNSASAAPATKNTSTKKKAEKENEEDYFDNDEEEAMMAAVAEAERKEKENEKKAEETAIKKEKKEGAEEKGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.54
3 0.52
4 0.47
5 0.42
6 0.37
7 0.34
8 0.33
9 0.33
10 0.36
11 0.37
12 0.38
13 0.37
14 0.4
15 0.37
16 0.33
17 0.35
18 0.32
19 0.3
20 0.32
21 0.37
22 0.37
23 0.39
24 0.38
25 0.32
26 0.31
27 0.28
28 0.25
29 0.22
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.22
35 0.22
36 0.21
37 0.21
38 0.22
39 0.27
40 0.27
41 0.27
42 0.25
43 0.28
44 0.38
45 0.4
46 0.42
47 0.37
48 0.38
49 0.36
50 0.41
51 0.38
52 0.3
53 0.28
54 0.24
55 0.23
56 0.21
57 0.21
58 0.17
59 0.15
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.12
79 0.15
80 0.22
81 0.26
82 0.3
83 0.35
84 0.4
85 0.44
86 0.51
87 0.57
88 0.61
89 0.65
90 0.66
91 0.66
92 0.66
93 0.66
94 0.62
95 0.53
96 0.49
97 0.43
98 0.41
99 0.36
100 0.31
101 0.29
102 0.25
103 0.24
104 0.17
105 0.16
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.15
111 0.16
112 0.17
113 0.16
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.12
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.08
137 0.1
138 0.12
139 0.15
140 0.19
141 0.22
142 0.23
143 0.24
144 0.3
145 0.31
146 0.32
147 0.31
148 0.28
149 0.27
150 0.28
151 0.29
152 0.28
153 0.29
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.28
158 0.3
159 0.28
160 0.24
161 0.26
162 0.26
163 0.28
164 0.28
165 0.25
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.23
170 0.22
171 0.19
172 0.19
173 0.19
174 0.17
175 0.15
176 0.13
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.11
210 0.16
211 0.23
212 0.25
213 0.26
214 0.27
215 0.29
216 0.29
217 0.29
218 0.26
219 0.2
220 0.2
221 0.2
222 0.18
223 0.16
224 0.16
225 0.13
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.11
232 0.15
233 0.2
234 0.22
235 0.27
236 0.32
237 0.36
238 0.38
239 0.38
240 0.36
241 0.36
242 0.34
243 0.36
244 0.32
245 0.38
246 0.43
247 0.43
248 0.45
249 0.4
250 0.4
251 0.34
252 0.41
253 0.38
254 0.32
255 0.3
256 0.27
257 0.28
258 0.28
259 0.28
260 0.25
261 0.19
262 0.2
263 0.23
264 0.22
265 0.21
266 0.24
267 0.26
268 0.24
269 0.26
270 0.26
271 0.23
272 0.25
273 0.25
274 0.23
275 0.21
276 0.18
277 0.16
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.12
288 0.1
289 0.09
290 0.15
291 0.19
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.24
296 0.24
297 0.25
298 0.2
299 0.18
300 0.19
301 0.24
302 0.25
303 0.26
304 0.27
305 0.31
306 0.31
307 0.32
308 0.33
309 0.28
310 0.32
311 0.28
312 0.28
313 0.24
314 0.24
315 0.23
316 0.23
317 0.26
318 0.23
319 0.29
320 0.34
321 0.42
322 0.46
323 0.54
324 0.61
325 0.65
326 0.72
327 0.77
328 0.81
329 0.78
330 0.81
331 0.77
332 0.71
333 0.64
334 0.56
335 0.5
336 0.4
337 0.33
338 0.23
339 0.19
340 0.14
341 0.14
342 0.11
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.05
348 0.04
349 0.06
350 0.06
351 0.09
352 0.11
353 0.14
354 0.19
355 0.27
356 0.38
357 0.47
358 0.54
359 0.58
360 0.61
361 0.6
362 0.65
363 0.63
364 0.58
365 0.59
366 0.62
367 0.6
368 0.57
369 0.63
370 0.61
371 0.58
372 0.62
373 0.59