FuNGI

A0A4V3SHJ2

Protein Details

Accession

A0A4V3SHJ2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
112-135	NQEFERREERKRQHIKVVKRADKI	Basic
1193-1212	DQIQKESRRSKSSRMKENRD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 9, pero 6, mito_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MEIFIQPIPHGLGQPGLHKQLKYSFNDVGIFAFNVRIQGGRHGSRRHAFVTIPSAELGLKLLTKHGDLPPGFQRNGVRHKPLFINGMALTIRPGRREPKNDHFLQGLIQRQNQEFERREERKRQHIKVVKRADKIFAISQVECGIWNPDPDGGVTEFIPRWSSGERAGTLQFRPNNVAIVLDAQYDGLNLDSSKKHTLLIHGYTINRIVTDKQEEVFLSLYEAPRIYRHTPTKLDIYLRSQNDLRQRVPGVDDEHQAYSGFSLVYRVILTYPEDNSRLLSLGGKAGISPIEPHNVQTVAARISFVQAFQTLVGELQNSHIYPFPVAYQLHALFANGTLPPDSISRLLPTIRRHIQKAGAELASLALKQFSREIGPHDPLNEASDINSQESLIGFLDKKLSELQATATPEWRARRAQQKEKEALVYRTTITPAGVYSFGPSFESLNRVLRKYRDFQDHFMRVTFGEEDAESFQQERGVDASVIIELFKQRILSPLVIAGRQFRFLGFSSSSLKSTTCWFMADFVFDGRWMTPQSLIQELGEFEHIRIPGRFAARVGQAFSDTTSSIQVGFDEEKDINDIERVDCKGVNRNFSDGIGKVSLQMVQRIWAQSAEMSRDKPTVFQIRYAGAKGVIALDPYLQGDQLCLRNSMVKFRGSSDRNIEICNWARKGALCLNRPMIKVLEDRNVSDRTFITLQKIAVDKLMISSRSPAHAANFFKRQNVSAPVLKLPWVIDVLQNINIYFWNDPFLKQGLQLALAAALRSIKYKGRIPVEKGVTLMGVLDETCTLREGQIYASYVTEEGEWVSVKGRVLITRSPQYHPGDVQMVEAVDVPLNSPLKMLKNCVAFSQMGDRPLPSMLSGGDLDGDLYNIVWDPRFDIGNNLPSAEYESKQAIPLDHPVTLKDVGEFFVDFMQNNILGLIANRHLVISDQSRHGIHDERCIKLAGMASTAVDFPKTGIKVELLELPRPDIPAAKPDFLAPGPRAIVSKNDVRFALNALDVDPEEDNDDIGTPQVWYESQKVLGKLYRAINEERFLSQIKDNLSITERSSREEILTEIWDYMVDHTRGYADWHDYIDEALQQRLEYCFNMEAIMIDRSETPWKSSLTEIEVFMGTILGKTAFARRNFEMTQLLRSDYNWLVSHTIGWMRGKDREETVSKAMAALFISLPDAGHDMKNEMQSWAWVAVCLLVAEVDQIQKESRRSKSSRMKENRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.29
3	0.34
4	0.37
5	0.36
6	0.39
7	0.43
8	0.49
9	0.48
10	0.49
11	0.45
12	0.44
13	0.46
14	0.42
15	0.35
16	0.3
17	0.25
18	0.19
19	0.17
20	0.14
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.13
25	0.21
26	0.28
27	0.33
28	0.4
29	0.44
30	0.52
31	0.55
32	0.59
33	0.53
34	0.49
35	0.43
36	0.41
37	0.43
38	0.37
39	0.32
40	0.28
41	0.26
42	0.23
43	0.22
44	0.18
45	0.12
46	0.11
47	0.1
48	0.13
49	0.14
50	0.16
51	0.21
52	0.22
53	0.29
54	0.28
55	0.33
56	0.4
57	0.45
58	0.44
59	0.42
60	0.46
61	0.46
62	0.55
63	0.58
64	0.57
65	0.52
66	0.57
67	0.59
68	0.57
69	0.53
70	0.44
71	0.41
72	0.32
73	0.34
74	0.28
75	0.23
76	0.21
77	0.23
78	0.25
79	0.23
80	0.28
81	0.33
82	0.42
83	0.51
84	0.57
85	0.61
86	0.69
87	0.69
88	0.67
89	0.61
90	0.52
91	0.48
92	0.45
93	0.42
94	0.37
95	0.38
96	0.39
97	0.39
98	0.43
99	0.42
100	0.45
101	0.41
102	0.43
103	0.51
104	0.53
105	0.6
106	0.65
107	0.69
108	0.72
109	0.78
110	0.77
111	0.78
112	0.8
113	0.82
114	0.82
115	0.85
116	0.83
117	0.79
118	0.76
119	0.69
120	0.63
121	0.58
122	0.5
123	0.45
124	0.41
125	0.34
126	0.33
127	0.29
128	0.26
129	0.22
130	0.19
131	0.17
132	0.14
133	0.14
134	0.14
135	0.14
136	0.14
137	0.14
138	0.16
139	0.14
140	0.13
141	0.13
142	0.16
143	0.15
144	0.16
145	0.17
146	0.14
147	0.16
148	0.17
149	0.18
150	0.19
151	0.23
152	0.24
153	0.25
154	0.28
155	0.29
156	0.29
157	0.35
158	0.34
159	0.31
160	0.35
161	0.32
162	0.31
163	0.27
164	0.25
165	0.18
166	0.18
167	0.16
168	0.12
169	0.12
170	0.1
171	0.1
172	0.09
173	0.09
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.1
178	0.12
179	0.16
180	0.2
181	0.2
182	0.22
183	0.23
184	0.29
185	0.32
186	0.34
187	0.35
188	0.35
189	0.35
190	0.34
191	0.34
192	0.29
193	0.22
194	0.19
195	0.17
196	0.18
197	0.23
198	0.23
199	0.22
200	0.24
201	0.23
202	0.24
203	0.23
204	0.17
205	0.14
206	0.15
207	0.16
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.16
212	0.21
213	0.22
214	0.28
215	0.34
216	0.4
217	0.44
218	0.47
219	0.5
220	0.49
221	0.5
222	0.45
223	0.45
224	0.47
225	0.44
226	0.44
227	0.4
228	0.4
229	0.45
230	0.47
231	0.41
232	0.38
233	0.38
234	0.36
235	0.36
236	0.36
237	0.31
238	0.29
239	0.31
240	0.28
241	0.27
242	0.26
243	0.24
244	0.19
245	0.14
246	0.12
247	0.09
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.09
256	0.11
257	0.12
258	0.14
259	0.17
260	0.18
261	0.18
262	0.18
263	0.18
264	0.16
265	0.14
266	0.14
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.08
275	0.1
276	0.1
277	0.14
278	0.14
279	0.16
280	0.18
281	0.18
282	0.18
283	0.16
284	0.17
285	0.14
286	0.14
287	0.14
288	0.11
289	0.13
290	0.13
291	0.12
292	0.1
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.1
297	0.07
298	0.07
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.08
303	0.1
304	0.09
305	0.1
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.12
310	0.11
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.17
315	0.17
316	0.18
317	0.17
318	0.16
319	0.12
320	0.12
321	0.13
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.12
332	0.13
333	0.15
334	0.19
335	0.22
336	0.29
337	0.36
338	0.39
339	0.4
340	0.42
341	0.47
342	0.45
343	0.45
344	0.41
345	0.33
346	0.29
347	0.26
348	0.23
349	0.16
350	0.13
351	0.1
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.1
358	0.11
359	0.17
360	0.21
361	0.24
362	0.24
363	0.24
364	0.24
365	0.22
366	0.23
367	0.19
368	0.13
369	0.11
370	0.14
371	0.14
372	0.14
373	0.13
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.11
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.13
387	0.12
388	0.12
389	0.13
390	0.15
391	0.18
392	0.17
393	0.18
394	0.19
395	0.22
396	0.24
397	0.25
398	0.24
399	0.27
400	0.37
401	0.44
402	0.53
403	0.58
404	0.64
405	0.66
406	0.65
407	0.64
408	0.58
409	0.51
410	0.43
411	0.36
412	0.28
413	0.24
414	0.23
415	0.17
416	0.14
417	0.11
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.12
430	0.12
431	0.19
432	0.21
433	0.22
434	0.25
435	0.28
436	0.32
437	0.35
438	0.4
439	0.43
440	0.44
441	0.47
442	0.54
443	0.53
444	0.49
445	0.44
446	0.39
447	0.28
448	0.27
449	0.22
450	0.13
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.09
477	0.12
478	0.12
479	0.11
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.15
484	0.16
485	0.15
486	0.16
487	0.15
488	0.12
489	0.13
490	0.13
491	0.17
492	0.13
493	0.15
494	0.18
495	0.19
496	0.2
497	0.18
498	0.18
499	0.15
500	0.17
501	0.17
502	0.13
503	0.13
504	0.12
505	0.13
506	0.14
507	0.14
508	0.11
509	0.09
510	0.09
511	0.08
512	0.08
513	0.06
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.1
519	0.12
520	0.12
521	0.13
522	0.11
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.09
528	0.08
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.11
533	0.12
534	0.13
535	0.15
536	0.15
537	0.12
538	0.15
539	0.16
540	0.17
541	0.16
542	0.13
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.1
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.09
561	0.09
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.09
567	0.1
568	0.1
569	0.11
570	0.12
571	0.19
572	0.21
573	0.25
574	0.24
575	0.25
576	0.25
577	0.24
578	0.25
579	0.17
580	0.17
581	0.12
582	0.11
583	0.1
584	0.1
585	0.12
586	0.11
587	0.12
588	0.1
589	0.11
590	0.13
591	0.13
592	0.13
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.1
597	0.12
598	0.12
599	0.13
600	0.14
601	0.15
602	0.15
603	0.15
604	0.19
605	0.23
606	0.22
607	0.23
608	0.23
609	0.23
610	0.25
611	0.24
612	0.2
613	0.12
614	0.11
615	0.09
616	0.09
617	0.07
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.06
623	0.06
624	0.05
625	0.04
626	0.05
627	0.07
628	0.1
629	0.1
630	0.11
631	0.11
632	0.16
633	0.16
634	0.21
635	0.21
636	0.21
637	0.2
638	0.23
639	0.31
640	0.28
641	0.31
642	0.3
643	0.34
644	0.33
645	0.33
646	0.31
647	0.28
648	0.3
649	0.31
650	0.27
651	0.21
652	0.21
653	0.2
654	0.24
655	0.25
656	0.28
657	0.26
658	0.28
659	0.33
660	0.36
661	0.36
662	0.33
663	0.28
664	0.23
665	0.24
666	0.24
667	0.25
668	0.22
669	0.23
670	0.25
671	0.26
672	0.24
673	0.22
674	0.19
675	0.17
676	0.18
677	0.18
678	0.18
679	0.18
680	0.18
681	0.19
682	0.2
683	0.16
684	0.14
685	0.14
686	0.11
687	0.1
688	0.13
689	0.1
690	0.1
691	0.12
692	0.13
693	0.14
694	0.15
695	0.14
696	0.13
697	0.19
698	0.22
699	0.23
700	0.3
701	0.3
702	0.31
703	0.31
704	0.3
705	0.28
706	0.29
707	0.29
708	0.25
709	0.26
710	0.25
711	0.24
712	0.24
713	0.21
714	0.16
715	0.13
716	0.11
717	0.1
718	0.09
719	0.11
720	0.12
721	0.14
722	0.14
723	0.13
724	0.12
725	0.12
726	0.12
727	0.11
728	0.09
729	0.1
730	0.1
731	0.11
732	0.13
733	0.14
734	0.13
735	0.13
736	0.16
737	0.12
738	0.13
739	0.12
740	0.1
741	0.09
742	0.09
743	0.08
744	0.06
745	0.06
746	0.06
747	0.07
748	0.09
749	0.1
750	0.14
751	0.19
752	0.25
753	0.32
754	0.37
755	0.41
756	0.48
757	0.48
758	0.45
759	0.41
760	0.35
761	0.27
762	0.22
763	0.17
764	0.08
765	0.05
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.04
770	0.05
771	0.05
772	0.06
773	0.06
774	0.07
775	0.07
776	0.08
777	0.1
778	0.11
779	0.11
780	0.11
781	0.11
782	0.1
783	0.1
784	0.09
785	0.06
786	0.05
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.07
791	0.08
792	0.08
793	0.1
794	0.11
795	0.12
796	0.15
797	0.18
798	0.23
799	0.28
800	0.31
801	0.31
802	0.38
803	0.39
804	0.39
805	0.36
806	0.33
807	0.29
808	0.26
809	0.24
810	0.17
811	0.14
812	0.12
813	0.12
814	0.09
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.09
822	0.11
823	0.17
824	0.18
825	0.22
826	0.23
827	0.26
828	0.27
829	0.27
830	0.28
831	0.23
832	0.22
833	0.26
834	0.24
835	0.22
836	0.21
837	0.21
838	0.19
839	0.19
840	0.18
841	0.11
842	0.09
843	0.07
844	0.09
845	0.09
846	0.08
847	0.08
848	0.07
849	0.08
850	0.07
851	0.07
852	0.04
853	0.04
854	0.04
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.07
860	0.08
861	0.09
862	0.09
863	0.14
864	0.17
865	0.22
866	0.23
867	0.21
868	0.2
869	0.19
870	0.24
871	0.22
872	0.19
873	0.16
874	0.18
875	0.18
876	0.2
877	0.21
878	0.16
879	0.16
880	0.21
881	0.21
882	0.22
883	0.21
884	0.2
885	0.22
886	0.22
887	0.2
888	0.15
889	0.14
890	0.12
891	0.13
892	0.12
893	0.09
894	0.11
895	0.11
896	0.1
897	0.1
898	0.11
899	0.1
900	0.09
901	0.09
902	0.06
903	0.06
904	0.06
905	0.08
906	0.07
907	0.08
908	0.08
909	0.08
910	0.08
911	0.09
912	0.12
913	0.15
914	0.18
915	0.2
916	0.22
917	0.23
918	0.24
919	0.26
920	0.29
921	0.26
922	0.32
923	0.34
924	0.34
925	0.35
926	0.34
927	0.32
928	0.27
929	0.28
930	0.19
931	0.16
932	0.14
933	0.13
934	0.13
935	0.14
936	0.11
937	0.08
938	0.07
939	0.07
940	0.13
941	0.13
942	0.13
943	0.14
944	0.15
945	0.16
946	0.17
947	0.23
948	0.2
949	0.23
950	0.22
951	0.24
952	0.24
953	0.24
954	0.23
955	0.19
956	0.18
957	0.23
958	0.27
959	0.26
960	0.25
961	0.24
962	0.27
963	0.24
964	0.28
965	0.21
966	0.2
967	0.2
968	0.2
969	0.21
970	0.18
971	0.22
972	0.21
973	0.27
974	0.26
975	0.28
976	0.28
977	0.28
978	0.28
979	0.26
980	0.24
981	0.18
982	0.16
983	0.14
984	0.14
985	0.13
986	0.14
987	0.12
988	0.1
989	0.1
990	0.1
991	0.09
992	0.08
993	0.09
994	0.07
995	0.07
996	0.07
997	0.06
998	0.06
999	0.07
1000	0.07
1001	0.1
1002	0.13
1003	0.15
1004	0.2
1005	0.24
1006	0.25
1007	0.29
1008	0.31
1009	0.3
1010	0.33
1011	0.36
1012	0.35
1013	0.35
1014	0.39
1015	0.39
1016	0.38
1017	0.38
1018	0.33
1019	0.3
1020	0.27
1021	0.26
1022	0.24
1023	0.24
1024	0.24
1025	0.26
1026	0.25
1027	0.25
1028	0.27
1029	0.26
1030	0.26
1031	0.31
1032	0.29
1033	0.28
1034	0.3
1035	0.28
1036	0.27
1037	0.26
1038	0.24
1039	0.19
1040	0.2
1041	0.18
1042	0.15
1043	0.14
1044	0.13
1045	0.12
1046	0.14
1047	0.18
1048	0.16
1049	0.15
1050	0.16
1051	0.17
1052	0.17
1053	0.2
1054	0.2
1055	0.18
1056	0.19
1057	0.2
1058	0.2
1059	0.19
1060	0.2
1061	0.17
1062	0.18
1063	0.15
1064	0.15
1065	0.14
1066	0.14
1067	0.15
1068	0.17
1069	0.18
1070	0.14
1071	0.16
1072	0.16
1073	0.15
1074	0.16
1075	0.14
1076	0.13
1077	0.14
1078	0.15
1079	0.11
1080	0.11
1081	0.11
1082	0.14
1083	0.2
1084	0.2
1085	0.21
1086	0.24
1087	0.26
1088	0.27
1089	0.29
1090	0.3
1091	0.29
1092	0.31
1093	0.28
1094	0.26
1095	0.25
1096	0.22
1097	0.19
1098	0.16
1099	0.1
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.06
1103	0.07
1104	0.08
1105	0.16
1106	0.22
1107	0.25
1108	0.31
1109	0.33
1110	0.4
1111	0.4
1112	0.42
1113	0.43
1114	0.38
1115	0.41
1116	0.37
1117	0.36
1118	0.3
1119	0.3
1120	0.32
1121	0.25
1122	0.29
1123	0.23
1124	0.24
1125	0.23
1126	0.23
1127	0.23
1128	0.2
1129	0.22
1130	0.21
1131	0.23
1132	0.25
1133	0.26
1134	0.32
1135	0.34
1136	0.35
1137	0.36
1138	0.39
1139	0.4
1140	0.42
1141	0.42
1142	0.39
1143	0.37
1144	0.34
1145	0.3
1146	0.24
1147	0.2
1148	0.17
1149	0.13
1150	0.1
1151	0.11
1152	0.1
1153	0.1
1154	0.09
1155	0.11
1156	0.11
1157	0.12
1158	0.13
1159	0.16
1160	0.2
1161	0.24
1162	0.24
1163	0.23
1164	0.22
1165	0.22
1166	0.23
1167	0.22
1168	0.18
1169	0.14
1170	0.13
1171	0.13
1172	0.13
1173	0.11
1174	0.09
1175	0.06
1176	0.06
1177	0.07
1178	0.09
1179	0.1
1180	0.1
1181	0.11
1182	0.14
1183	0.19
1184	0.27
1185	0.34
1186	0.4
1187	0.48
1188	0.53
1189	0.62
1190	0.7
1191	0.75
1192	0.79

A0A4V3SHJ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer