Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DJC1

Protein Details
Accession A5DJC1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-106GSSTRKNPGAKRYKINPKLRDISSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 20.5, mito_nucl 14, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pgu:PGUG_03372  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLPVRQLARTSLGSSFSRQWRFGLTRGARLSSSSLSAQEAQLNEIVTKSESSVTESAKNASENYTNEQRNGKNGQKNVNGDSGSSTRKNPGAKRYKINPKLRDISSQVRSSIESANGSDTAEAVEILEEGLSYLREVQVAEGINEESLFSVFQPVLDVYSQKITDASTLNKVLDLAIEHKVAHGFLFSKVMALQALESYQAALQTWVRFLEYSSAVNNGLVFKRFGFMKDSAFRKRDLTNLAFYSYVQSCLASNAKYDFRDAMKLLQTDEVPEIFHVRRTVMGLGAVRSEKEFQEFQTQLNAMELESLDPNGSVVIRKINRAIATNDFNLLNRTYDLVQDAALKYKRPISENTLTRFMNGYFECSQIDRVFDIFRSMLQNGISKPSIVSWDIVLRCMGHPSYLRTLNETKRKEISVNLRRTIDTVLSLYPEMSPKTLSIIVAGFANMNDFEAVDEFLTKYSVQGKGKVPVIHATKNNILIGLVLNKKVDEAEKKLKELMEDGSGYVPSTSCMNTFLNHYARADNYKAVDGILKFMKQHNIAEEIGTYTIVIDLYFKMHRAKGLAPNVTELLESFANNKQAGLTLNDYTYSILISGLVKDGLNLEAARTLFEHSKSYGNSPHVLTAMLEGELDHGSVGNAEILFEKYTKSKNEPRVWNQMIKALLYKHESLALQYYHNFKNQEKISSRCKPNHYTYYFLIQHFIKKGNKEKIEWMLKEMAENGTELGTELPKIIRRLSKEYTVPKPLLDKIAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.37
3 0.41
4 0.44
5 0.43
6 0.41
7 0.45
8 0.47
9 0.47
10 0.5
11 0.45
12 0.48
13 0.51
14 0.52
15 0.43
16 0.42
17 0.41
18 0.32
19 0.32
20 0.24
21 0.22
22 0.23
23 0.24
24 0.24
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.21
29 0.2
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.14
37 0.14
38 0.19
39 0.23
40 0.25
41 0.28
42 0.29
43 0.3
44 0.29
45 0.3
46 0.26
47 0.26
48 0.27
49 0.26
50 0.31
51 0.38
52 0.38
53 0.4
54 0.46
55 0.44
56 0.46
57 0.51
58 0.52
59 0.51
60 0.55
61 0.61
62 0.61
63 0.64
64 0.61
65 0.59
66 0.51
67 0.43
68 0.42
69 0.37
70 0.35
71 0.33
72 0.31
73 0.3
74 0.35
75 0.42
76 0.43
77 0.5
78 0.55
79 0.6
80 0.67
81 0.73
82 0.79
83 0.82
84 0.86
85 0.83
86 0.81
87 0.82
88 0.75
89 0.72
90 0.67
91 0.66
92 0.62
93 0.58
94 0.5
95 0.43
96 0.42
97 0.37
98 0.34
99 0.28
100 0.22
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.16
106 0.13
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.09
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.15
147 0.15
148 0.13
149 0.14
150 0.12
151 0.15
152 0.17
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.17
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.14
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.16
214 0.16
215 0.22
216 0.28
217 0.33
218 0.39
219 0.4
220 0.4
221 0.39
222 0.39
223 0.37
224 0.38
225 0.35
226 0.33
227 0.32
228 0.32
229 0.29
230 0.27
231 0.27
232 0.2
233 0.19
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.14
238 0.16
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.17
243 0.18
244 0.19
245 0.18
246 0.18
247 0.21
248 0.2
249 0.21
250 0.22
251 0.22
252 0.22
253 0.21
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.14
258 0.1
259 0.1
260 0.13
261 0.11
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.14
267 0.14
268 0.11
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.1
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.21
282 0.21
283 0.2
284 0.23
285 0.23
286 0.2
287 0.2
288 0.19
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.12
303 0.12
304 0.14
305 0.16
306 0.18
307 0.19
308 0.21
309 0.23
310 0.21
311 0.24
312 0.23
313 0.23
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.17
318 0.13
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.1
327 0.1
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.15
332 0.19
333 0.21
334 0.21
335 0.24
336 0.26
337 0.34
338 0.39
339 0.41
340 0.42
341 0.39
342 0.38
343 0.36
344 0.28
345 0.24
346 0.19
347 0.2
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.18
353 0.13
354 0.14
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.13
367 0.12
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.12
374 0.1
375 0.1
376 0.08
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.11
385 0.09
386 0.1
387 0.13
388 0.17
389 0.21
390 0.21
391 0.23
392 0.29
393 0.34
394 0.42
395 0.41
396 0.4
397 0.38
398 0.39
399 0.36
400 0.36
401 0.4
402 0.4
403 0.45
404 0.45
405 0.44
406 0.43
407 0.43
408 0.38
409 0.28
410 0.19
411 0.14
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.09
421 0.08
422 0.1
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.09
430 0.06
431 0.05
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.1
448 0.16
449 0.17
450 0.22
451 0.25
452 0.28
453 0.33
454 0.33
455 0.31
456 0.32
457 0.35
458 0.35
459 0.34
460 0.34
461 0.32
462 0.33
463 0.31
464 0.24
465 0.2
466 0.15
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.14
475 0.16
476 0.15
477 0.21
478 0.3
479 0.32
480 0.34
481 0.36
482 0.36
483 0.33
484 0.3
485 0.25
486 0.18
487 0.16
488 0.15
489 0.14
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.09
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.1
499 0.1
500 0.11
501 0.14
502 0.19
503 0.21
504 0.22
505 0.22
506 0.21
507 0.22
508 0.25
509 0.23
510 0.2
511 0.19
512 0.19
513 0.18
514 0.16
515 0.18
516 0.14
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.19
522 0.24
523 0.23
524 0.24
525 0.23
526 0.25
527 0.24
528 0.23
529 0.21
530 0.17
531 0.15
532 0.13
533 0.1
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.08
541 0.09
542 0.11
543 0.13
544 0.14
545 0.16
546 0.18
547 0.23
548 0.29
549 0.36
550 0.38
551 0.36
552 0.37
553 0.36
554 0.34
555 0.28
556 0.2
557 0.15
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.14
562 0.17
563 0.17
564 0.17
565 0.14
566 0.15
567 0.17
568 0.17
569 0.17
570 0.15
571 0.16
572 0.16
573 0.16
574 0.15
575 0.14
576 0.1
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.08
588 0.09
589 0.09
590 0.08
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.11
595 0.14
596 0.15
597 0.17
598 0.19
599 0.18
600 0.23
601 0.24
602 0.27
603 0.3
604 0.3
605 0.32
606 0.31
607 0.31
608 0.26
609 0.25
610 0.21
611 0.17
612 0.15
613 0.11
614 0.1
615 0.08
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.08
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.12
632 0.14
633 0.2
634 0.25
635 0.32
636 0.4
637 0.49
638 0.58
639 0.67
640 0.7
641 0.76
642 0.76
643 0.74
644 0.67
645 0.61
646 0.53
647 0.44
648 0.41
649 0.32
650 0.31
651 0.29
652 0.29
653 0.24
654 0.27
655 0.26
656 0.24
657 0.27
658 0.24
659 0.22
660 0.24
661 0.3
662 0.29
663 0.34
664 0.35
665 0.31
666 0.39
667 0.41
668 0.47
669 0.47
670 0.5
671 0.55
672 0.62
673 0.69
674 0.68
675 0.72
676 0.71
677 0.74
678 0.78
679 0.72
680 0.68
681 0.63
682 0.64
683 0.61
684 0.53
685 0.49
686 0.4
687 0.42
688 0.4
689 0.44
690 0.4
691 0.43
692 0.53
693 0.59
694 0.62
695 0.6
696 0.63
697 0.66
698 0.7
699 0.63
700 0.59
701 0.55
702 0.49
703 0.47
704 0.42
705 0.33
706 0.24
707 0.23
708 0.19
709 0.12
710 0.12
711 0.11
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.1
716 0.13
717 0.18
718 0.21
719 0.27
720 0.31
721 0.37
722 0.44
723 0.49
724 0.53
725 0.57
726 0.64
727 0.66
728 0.67
729 0.62
730 0.58
731 0.57
732 0.53