Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DJ53

Protein Details
Accession A5DJ53    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-249FLPMFKKRNVARKKKAAPDKKKVYTPFHydrophilic
266-290EYFLGKREKKQNDLQKKRDKQEEVSHydrophilic
306-335EQLHENKLLKKSKKSKKRSHDEDEGSNKKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-244KKRNVARKKKAAPDKKK
312-324KLLKKSKKSKKRS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pgu:PGUG_03304  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTHNRDKPWDTPDIDKWHVDEFKPEDNASGLPFAEESSFMTLFPKYREQYLRTIWSEVTKALDKHNIACQLDLVEGSMTVKTTRKTYDPAIIIKARDLIKLLARSVPFPQAVKVLQDDVACDVIKIGNFVTNKDRFVKRRQRLVGPNGNTLKALELLTNCYILVQGNTVSAMGPYKGLKEVRRVVEDCMKNVHPIYHIKELMIKQELSKKPELANEDWSRFLPMFKKRNVARKKKAAPDKKKVYTPFPPAQTPRKVDLQIESGEYFLGKREKKQNDLQKKRDKQEEVSEQKNKEKLRGYEAPEEQLHENKLLKKSKKSKKRSHDEDEGSNKKPRVDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.59
3 0.56
4 0.51
5 0.47
6 0.46
7 0.47
8 0.4
9 0.4
10 0.37
11 0.4
12 0.42
13 0.4
14 0.34
15 0.31
16 0.31
17 0.25
18 0.22
19 0.15
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.17
32 0.21
33 0.27
34 0.24
35 0.32
36 0.38
37 0.4
38 0.46
39 0.51
40 0.55
41 0.49
42 0.5
43 0.43
44 0.4
45 0.38
46 0.31
47 0.29
48 0.25
49 0.24
50 0.25
51 0.31
52 0.29
53 0.3
54 0.35
55 0.38
56 0.34
57 0.33
58 0.29
59 0.24
60 0.23
61 0.2
62 0.14
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.11
70 0.12
71 0.15
72 0.18
73 0.2
74 0.24
75 0.27
76 0.33
77 0.34
78 0.35
79 0.38
80 0.38
81 0.35
82 0.32
83 0.34
84 0.27
85 0.23
86 0.22
87 0.18
88 0.2
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.22
94 0.22
95 0.25
96 0.21
97 0.2
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.19
120 0.2
121 0.22
122 0.27
123 0.32
124 0.32
125 0.42
126 0.51
127 0.51
128 0.59
129 0.62
130 0.65
131 0.67
132 0.72
133 0.7
134 0.63
135 0.63
136 0.55
137 0.51
138 0.43
139 0.35
140 0.26
141 0.19
142 0.16
143 0.09
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.09
166 0.12
167 0.14
168 0.2
169 0.26
170 0.28
171 0.32
172 0.32
173 0.32
174 0.38
175 0.37
176 0.32
177 0.3
178 0.28
179 0.25
180 0.24
181 0.22
182 0.16
183 0.2
184 0.23
185 0.25
186 0.25
187 0.24
188 0.29
189 0.28
190 0.3
191 0.28
192 0.23
193 0.19
194 0.28
195 0.32
196 0.31
197 0.33
198 0.31
199 0.3
200 0.34
201 0.37
202 0.3
203 0.35
204 0.35
205 0.34
206 0.33
207 0.32
208 0.3
209 0.25
210 0.24
211 0.22
212 0.27
213 0.32
214 0.34
215 0.43
216 0.46
217 0.56
218 0.65
219 0.69
220 0.7
221 0.73
222 0.79
223 0.8
224 0.86
225 0.87
226 0.86
227 0.86
228 0.87
229 0.82
230 0.81
231 0.76
232 0.73
233 0.7
234 0.68
235 0.64
236 0.58
237 0.59
238 0.57
239 0.61
240 0.62
241 0.58
242 0.53
243 0.52
244 0.5
245 0.45
246 0.42
247 0.38
248 0.32
249 0.3
250 0.26
251 0.2
252 0.18
253 0.17
254 0.13
255 0.13
256 0.19
257 0.18
258 0.25
259 0.35
260 0.41
261 0.48
262 0.58
263 0.65
264 0.69
265 0.78
266 0.81
267 0.82
268 0.86
269 0.87
270 0.87
271 0.81
272 0.76
273 0.76
274 0.76
275 0.72
276 0.72
277 0.72
278 0.66
279 0.67
280 0.67
281 0.58
282 0.54
283 0.55
284 0.5
285 0.51
286 0.55
287 0.55
288 0.59
289 0.59
290 0.58
291 0.5
292 0.5
293 0.44
294 0.4
295 0.36
296 0.3
297 0.33
298 0.34
299 0.41
300 0.47
301 0.52
302 0.58
303 0.67
304 0.74
305 0.8
306 0.85
307 0.87
308 0.89
309 0.93
310 0.92
311 0.91
312 0.91
313 0.87
314 0.86
315 0.85
316 0.8
317 0.74
318 0.71
319 0.64
320 0.58