Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S2N6T1

Protein Details
Accession A0A4S2N6T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
418-445EWEKHVANNRHKKRVQGKKKMEEVREFLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-448RHKKRVQGKKKMEEVREFLRKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.333, cyto 8, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MSPPPLISVIGATGTGKSQLAVELALAFNGEIINADAMQMYRGLPIITNKITEEEMKGVPHHLLGFLDTKDAWKVNQFVVEAEQKIKEIRSRNKLPIIVGGTTYYVQSLLFPHSLSSVPESDSQPIINDKELSTRYPILDSDPETLYATLQQVDPLMASRWHPNDHRKIRRSLTIYYTTGRRASDIYADQAASAASSTALTASPYNNLIFWVHTATEPLRQRLDARVDKMLVNGMRSEIVEMKSVYDAAVNNGEKLDVEHGIWQSIGFKEFLKWDCYSTTDEGSPNTETEIGTQQNENEQQALREMKTATRQYAKTQIRWIRTKFWRLLKQPEDGSEKRLFVVDSADAKRYEENVVRPAVDITKRFLASKDLPDPETLSPLAKEALTFSTDVDISKRRDLWGVRKCDVCDVVTTNQVEWEKHVANNRHKKRVQGKKKMEEVREFLRKRELELERKRSEAETAIDVVVPPEVVENERRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.1
4 0.09
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.06
18 0.05
19 0.06
20 0.07
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.14
33 0.2
34 0.21
35 0.22
36 0.22
37 0.24
38 0.25
39 0.25
40 0.24
41 0.21
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.21
46 0.2
47 0.19
48 0.17
49 0.14
50 0.12
51 0.13
52 0.16
53 0.14
54 0.16
55 0.14
56 0.15
57 0.17
58 0.18
59 0.16
60 0.18
61 0.2
62 0.2
63 0.24
64 0.23
65 0.21
66 0.25
67 0.29
68 0.26
69 0.25
70 0.24
71 0.21
72 0.22
73 0.24
74 0.25
75 0.3
76 0.38
77 0.45
78 0.52
79 0.59
80 0.64
81 0.64
82 0.59
83 0.57
84 0.51
85 0.42
86 0.35
87 0.28
88 0.23
89 0.2
90 0.19
91 0.12
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.16
104 0.13
105 0.14
106 0.18
107 0.19
108 0.2
109 0.2
110 0.19
111 0.17
112 0.19
113 0.19
114 0.17
115 0.17
116 0.15
117 0.2
118 0.21
119 0.21
120 0.22
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.22
125 0.2
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.16
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.15
147 0.17
148 0.21
149 0.26
150 0.34
151 0.44
152 0.53
153 0.62
154 0.62
155 0.67
156 0.67
157 0.69
158 0.65
159 0.58
160 0.54
161 0.5
162 0.46
163 0.41
164 0.39
165 0.34
166 0.32
167 0.28
168 0.22
169 0.17
170 0.16
171 0.18
172 0.17
173 0.17
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.12
179 0.08
180 0.06
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.16
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.18
208 0.2
209 0.23
210 0.31
211 0.27
212 0.28
213 0.28
214 0.28
215 0.28
216 0.27
217 0.26
218 0.18
219 0.15
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.12
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.06
245 0.06
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.13
258 0.14
259 0.16
260 0.16
261 0.17
262 0.17
263 0.19
264 0.21
265 0.19
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.18
271 0.16
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.14
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.16
283 0.18
284 0.16
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.16
289 0.18
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.23
295 0.26
296 0.26
297 0.31
298 0.32
299 0.32
300 0.42
301 0.44
302 0.4
303 0.47
304 0.49
305 0.5
306 0.57
307 0.56
308 0.56
309 0.59
310 0.63
311 0.61
312 0.64
313 0.66
314 0.64
315 0.71
316 0.65
317 0.63
318 0.57
319 0.56
320 0.54
321 0.46
322 0.46
323 0.39
324 0.36
325 0.31
326 0.3
327 0.24
328 0.16
329 0.18
330 0.16
331 0.18
332 0.2
333 0.22
334 0.22
335 0.22
336 0.23
337 0.22
338 0.24
339 0.22
340 0.23
341 0.25
342 0.26
343 0.25
344 0.25
345 0.24
346 0.25
347 0.25
348 0.23
349 0.23
350 0.27
351 0.27
352 0.27
353 0.27
354 0.29
355 0.3
356 0.36
357 0.39
358 0.37
359 0.37
360 0.37
361 0.4
362 0.33
363 0.32
364 0.25
365 0.19
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.13
379 0.15
380 0.19
381 0.22
382 0.26
383 0.28
384 0.27
385 0.32
386 0.38
387 0.44
388 0.47
389 0.51
390 0.5
391 0.53
392 0.53
393 0.52
394 0.49
395 0.4
396 0.34
397 0.31
398 0.3
399 0.31
400 0.31
401 0.26
402 0.29
403 0.29
404 0.26
405 0.25
406 0.29
407 0.26
408 0.28
409 0.37
410 0.41
411 0.5
412 0.6
413 0.66
414 0.7
415 0.7
416 0.77
417 0.79
418 0.81
419 0.82
420 0.82
421 0.84
422 0.83
423 0.91
424 0.9
425 0.87
426 0.84
427 0.79
428 0.77
429 0.76
430 0.68
431 0.61
432 0.62
433 0.54
434 0.5
435 0.54
436 0.53
437 0.54
438 0.63
439 0.7
440 0.64
441 0.65
442 0.63
443 0.55
444 0.5
445 0.44
446 0.36
447 0.3
448 0.28
449 0.27
450 0.25
451 0.23
452 0.2
453 0.16
454 0.12
455 0.09
456 0.08
457 0.09
458 0.11