Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V3SJX1

Protein Details
Accession A0A4V3SJX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MTTEPRKRRRRNLVPPAPTYPDHydrophilic
143-162AELKVPKKKRPYKHLPDFPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-10KRRR
149-152KKKR
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF10406  TAF8_C  
CDD cd08049  TAF8  
Amino Acid Sequences MTTEPRKRRRRNLVPPAPTYPDAAVIVSEDIAASILQRSIAQLLLAAGFAGADPLALEEMRRLAEQRFITLLQTLSLFTGSHRRTRATIFDFEDTLNLLHIPVSDLYHEARTHFTRAQPTLPPPPPPLPAELPPPNLDNLLGAELKVPKKKRPYKHLPDFPSSHTWKATPVFAERPSEPREIREKATQEARLAEVALRKLLVAGSMGRHGIEEDKKGNDTPEKEVAVSGRKREREKLWDLAVEELEKERRAGFAEIMDGSAGGSDMFSDVVVNAESKYWRKGNGKRVLRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.88
3 0.83
4 0.78
5 0.68
6 0.59
7 0.48
8 0.4
9 0.33
10 0.26
11 0.2
12 0.15
13 0.14
14 0.11
15 0.1
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.05
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.05
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.03
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.17
52 0.18
53 0.19
54 0.2
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.19
59 0.13
60 0.13
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.17
67 0.18
68 0.23
69 0.25
70 0.26
71 0.28
72 0.31
73 0.38
74 0.33
75 0.37
76 0.34
77 0.34
78 0.33
79 0.31
80 0.28
81 0.21
82 0.17
83 0.11
84 0.08
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.15
98 0.16
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.26
103 0.27
104 0.29
105 0.29
106 0.31
107 0.36
108 0.37
109 0.37
110 0.35
111 0.36
112 0.35
113 0.33
114 0.32
115 0.26
116 0.26
117 0.3
118 0.29
119 0.28
120 0.27
121 0.26
122 0.23
123 0.2
124 0.18
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.11
132 0.13
133 0.18
134 0.2
135 0.23
136 0.34
137 0.43
138 0.5
139 0.57
140 0.65
141 0.71
142 0.8
143 0.84
144 0.78
145 0.75
146 0.7
147 0.63
148 0.6
149 0.51
150 0.42
151 0.34
152 0.29
153 0.26
154 0.25
155 0.23
156 0.17
157 0.18
158 0.2
159 0.21
160 0.24
161 0.22
162 0.25
163 0.28
164 0.31
165 0.28
166 0.28
167 0.33
168 0.33
169 0.36
170 0.37
171 0.36
172 0.35
173 0.41
174 0.39
175 0.33
176 0.32
177 0.29
178 0.23
179 0.21
180 0.19
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.13
198 0.15
199 0.18
200 0.19
201 0.21
202 0.23
203 0.24
204 0.26
205 0.27
206 0.27
207 0.29
208 0.31
209 0.3
210 0.29
211 0.29
212 0.28
213 0.31
214 0.32
215 0.34
216 0.36
217 0.41
218 0.46
219 0.52
220 0.56
221 0.56
222 0.59
223 0.59
224 0.55
225 0.52
226 0.49
227 0.45
228 0.39
229 0.31
230 0.26
231 0.22
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.15
237 0.17
238 0.18
239 0.17
240 0.15
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.16
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.1
262 0.14
263 0.17
264 0.23
265 0.25
266 0.33
267 0.42
268 0.5
269 0.58
270 0.65