FuNGI

A0A4S2N356

Protein Details

Accession

A0A4S2N356

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
115-142	QIQDRETEYQKRRFKRKLSPTRKDGFAN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
126-131	RRFKRK
207-210	KRKK

Subcellular Location(s)

plas 18, nucl 5.5, cyto_nucl 4, cyto 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MADSEFEEIRRLQQERNAAKAGSKTFDPSTQRENTTKASLTDALDTTLYDRSGVDRFAGYNTSIPADGDDDDDMTDGDGTRRLVGQYTATKEMMNEFAGGDDDTDALTSRAEAAQIQDRETEYQKRRFKRKLSPTRKDGFANGEGEEEGRSYKEIMQERELEREEERVRRKIEEKLKNGEHANGSEHEATLKRDTTPEAEASEGTRKRKKRWDVATADDTSTQENATKKRSSRWDVAAAPDATPVMKRSRWDQAPSLTAATPIGNQGLVTPMHPSSAAIPAMPLTFGLGDRNAPLSDEELDAMLPSEGYKILDPPPGYAPIRTPARKLMSTPAPMASSSGIGGFMMQEPENARVLGKQMPTEIPGVGDLQFFKAEDMNYFGKLVDGADENTMTVDELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYTHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLKGLVECIGPNLEDEQAKVRTVTSLAIAALAEAAHPYGIESFDTILNPLWTGAKKQRGKGLAGFLKAVGYVIPLMDEEYANYYTSQVMDIVLREFQSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTEGVTSQYLKENVLPDFFKSFWIRRMALDKRNYRQVVETTVDLAQKVGCGEIVERIVDHLKDESEPYRKMTLETIEKVISALGAADVSEKLEEQLVDGVLFAFQEQSVEDIVMLNGFGTVVNALGTRTKPYLPQIVSTILWRLNNKSSAVRQQSADLISRIAVVMKQCGEDSLMGKLGIVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINSMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPEFVSAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKAMSFLFEYIGEMAKDYVYAITPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMLHLLNLIFPNIFETSPHVIDRIIEAIDAIRMAIGPGLVMNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNNAYVQSADSLVPYYPNLDEEKLKREELYIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.46
3	0.52
4	0.5
5	0.44
6	0.45
7	0.47
8	0.46
9	0.39
10	0.35
11	0.33
12	0.33
13	0.4
14	0.42
15	0.4
16	0.44
17	0.47
18	0.51
19	0.5
20	0.52
21	0.49
22	0.5
23	0.48
24	0.41
25	0.39
26	0.37
27	0.35
28	0.35
29	0.3
30	0.26
31	0.23
32	0.22
33	0.19
34	0.18
35	0.16
36	0.13
37	0.12
38	0.14
39	0.16
40	0.17
41	0.16
42	0.15
43	0.16
44	0.18
45	0.2
46	0.18
47	0.18
48	0.19
49	0.19
50	0.18
51	0.17
52	0.16
53	0.15
54	0.15
55	0.14
56	0.13
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.11
61	0.09
62	0.09
63	0.08
64	0.08
65	0.11
66	0.11
67	0.12
68	0.14
69	0.14
70	0.15
71	0.16
72	0.22
73	0.26
74	0.31
75	0.34
76	0.33
77	0.32
78	0.31
79	0.32
80	0.29
81	0.23
82	0.18
83	0.13
84	0.13
85	0.14
86	0.13
87	0.11
88	0.09
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.09
100	0.12
101	0.21
102	0.22
103	0.23
104	0.24
105	0.25
106	0.28
107	0.32
108	0.38
109	0.38
110	0.47
111	0.54
112	0.62
113	0.7
114	0.76
115	0.81
116	0.82
117	0.85
118	0.87
119	0.89
120	0.9
121	0.89
122	0.87
123	0.82
124	0.74
125	0.67
126	0.62
127	0.56
128	0.47
129	0.38
130	0.33
131	0.28
132	0.25
133	0.21
134	0.15
135	0.11
136	0.09
137	0.1
138	0.1
139	0.13
140	0.2
141	0.26
142	0.29
143	0.33
144	0.4
145	0.41
146	0.46
147	0.45
148	0.4
149	0.34
150	0.38
151	0.38
152	0.39
153	0.44
154	0.44
155	0.45
156	0.49
157	0.52
158	0.54
159	0.6
160	0.61
161	0.62
162	0.64
163	0.66
164	0.66
165	0.64
166	0.59
167	0.52
168	0.43
169	0.4
170	0.32
171	0.32
172	0.27
173	0.25
174	0.22
175	0.21
176	0.22
177	0.23
178	0.23
179	0.2
180	0.21
181	0.23
182	0.24
183	0.26
184	0.24
185	0.21
186	0.21
187	0.2
188	0.21
189	0.28
190	0.29
191	0.33
192	0.39
193	0.44
194	0.51
195	0.61
196	0.68
197	0.7
198	0.75
199	0.78
200	0.77
201	0.79
202	0.77
203	0.7
204	0.61
205	0.53
206	0.44
207	0.35
208	0.28
209	0.2
210	0.17
211	0.19
212	0.22
213	0.26
214	0.32
215	0.33
216	0.41
217	0.5
218	0.53
219	0.56
220	0.58
221	0.6
222	0.56
223	0.58
224	0.57
225	0.48
226	0.41
227	0.34
228	0.28
229	0.21
230	0.19
231	0.17
232	0.15
233	0.17
234	0.18
235	0.22
236	0.32
237	0.37
238	0.42
239	0.44
240	0.44
241	0.45
242	0.46
243	0.43
244	0.34
245	0.28
246	0.24
247	0.19
248	0.14
249	0.12
250	0.11
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.1
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.15
264	0.14
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.1
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.12
285	0.11
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.06
291	0.05
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.09
298	0.11
299	0.16
300	0.16
301	0.18
302	0.2
303	0.24
304	0.24
305	0.23
306	0.23
307	0.26
308	0.34
309	0.33
310	0.33
311	0.35
312	0.4
313	0.4
314	0.4
315	0.4
316	0.39
317	0.41
318	0.4
319	0.35
320	0.3
321	0.29
322	0.28
323	0.21
324	0.14
325	0.11
326	0.09
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.1
336	0.12
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.1
341	0.13
342	0.16
343	0.16
344	0.15
345	0.16
346	0.17
347	0.18
348	0.19
349	0.17
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.14
367	0.13
368	0.12
369	0.11
370	0.11
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.08
383	0.1
384	0.11
385	0.16
386	0.16
387	0.18
388	0.22
389	0.26
390	0.27
391	0.35
392	0.42
393	0.44
394	0.49
395	0.49
396	0.47
397	0.49
398	0.49
399	0.45
400	0.45
401	0.43
402	0.42
403	0.45
404	0.44
405	0.42
406	0.48
407	0.5
408	0.45
409	0.43
410	0.42
411	0.45
412	0.52
413	0.51
414	0.42
415	0.33
416	0.31
417	0.3
418	0.29
419	0.23
420	0.15
421	0.12
422	0.13
423	0.14
424	0.14
425	0.13
426	0.1
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.1
435	0.12
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.16
440	0.18
441	0.18
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.18
446	0.2
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.13
454	0.13
455	0.14
456	0.14
457	0.16
458	0.18
459	0.17
460	0.19
461	0.21
462	0.21
463	0.19
464	0.18
465	0.17
466	0.16
467	0.16
468	0.16
469	0.14
470	0.11
471	0.1
472	0.1
473	0.09
474	0.07
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.12
488	0.14
489	0.14
490	0.15
491	0.14
492	0.12
493	0.1
494	0.08
495	0.08
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.08
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.13
513	0.14
514	0.15
515	0.16
516	0.14
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.1
522	0.1
523	0.09
524	0.08
525	0.09
526	0.08
527	0.07
528	0.06
529	0.05
530	0.04
531	0.04
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.02
537	0.03
538	0.03
539	0.04
540	0.06
541	0.08
542	0.11
543	0.16
544	0.2
545	0.23
546	0.28
547	0.37
548	0.45
549	0.53
550	0.56
551	0.58
552	0.61
553	0.65
554	0.62
555	0.57
556	0.5
557	0.45
558	0.44
559	0.38
560	0.33
561	0.26
562	0.24
563	0.19
564	0.17
565	0.13
566	0.08
567	0.06
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.05
572	0.05
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.08
585	0.07
586	0.07
587	0.06
588	0.07
589	0.1
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.1
594	0.09
595	0.1
596	0.1
597	0.07
598	0.06
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.05
603	0.05
604	0.04
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.02
609	0.02
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.04
614	0.04
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.1
626	0.15
627	0.24
628	0.27
629	0.3
630	0.35
631	0.36
632	0.38
633	0.38
634	0.41
635	0.35
636	0.32
637	0.3
638	0.25
639	0.22
640	0.2
641	0.17
642	0.08
643	0.05
644	0.04
645	0.03
646	0.04
647	0.03
648	0.04
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.07
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.09
671	0.09
672	0.11
673	0.13
674	0.13
675	0.13
676	0.14
677	0.16
678	0.14
679	0.16
680	0.14
681	0.13
682	0.16
683	0.19
684	0.19
685	0.17
686	0.17
687	0.16
688	0.15
689	0.14
690	0.11
691	0.08
692	0.07
693	0.08
694	0.08
695	0.08
696	0.1
697	0.11
698	0.11
699	0.13
700	0.14
701	0.13
702	0.16
703	0.16
704	0.14
705	0.16
706	0.15
707	0.17
708	0.18
709	0.19
710	0.21
711	0.26
712	0.25
713	0.25
714	0.33
715	0.36
716	0.41
717	0.48
718	0.5
719	0.5
720	0.58
721	0.57
722	0.49
723	0.46
724	0.4
725	0.36
726	0.31
727	0.27
728	0.2
729	0.21
730	0.2
731	0.16
732	0.15
733	0.1
734	0.09
735	0.09
736	0.07
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.07
741	0.08
742	0.07
743	0.07
744	0.08
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.09
749	0.09
750	0.09
751	0.12
752	0.15
753	0.18
754	0.2
755	0.22
756	0.24
757	0.24
758	0.24
759	0.24
760	0.25
761	0.26
762	0.27
763	0.26
764	0.23
765	0.23
766	0.22
767	0.19
768	0.14
769	0.08
770	0.06
771	0.03
772	0.03
773	0.03
774	0.04
775	0.04
776	0.04
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.07
784	0.07
785	0.07
786	0.07
787	0.06
788	0.05
789	0.05
790	0.05
791	0.04
792	0.03
793	0.04
794	0.04
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.04
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.07
814	0.08
815	0.1
816	0.12
817	0.13
818	0.15
819	0.18
820	0.26
821	0.24
822	0.26
823	0.25
824	0.27
825	0.26
826	0.25
827	0.24
828	0.19
829	0.21
830	0.2
831	0.22
832	0.24
833	0.26
834	0.27
835	0.29
836	0.31
837	0.37
838	0.42
839	0.4
840	0.36
841	0.35
842	0.37
843	0.34
844	0.32
845	0.23
846	0.17
847	0.15
848	0.14
849	0.13
850	0.1
851	0.09
852	0.08
853	0.1
854	0.11
855	0.11
856	0.11
857	0.11
858	0.12
859	0.12
860	0.12
861	0.12
862	0.12
863	0.11
864	0.11
865	0.11
866	0.1
867	0.08
868	0.07
869	0.06
870	0.04
871	0.05
872	0.06
873	0.06
874	0.06
875	0.06
876	0.06
877	0.06
878	0.06
879	0.05
880	0.05
881	0.04
882	0.04
883	0.04
884	0.04
885	0.05
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.05
896	0.07
897	0.07
898	0.07
899	0.08
900	0.1
901	0.1
902	0.1
903	0.12
904	0.12
905	0.15
906	0.17
907	0.19
908	0.23
909	0.25
910	0.26
911	0.27
912	0.3
913	0.32
914	0.37
915	0.45
916	0.45
917	0.5
918	0.53
919	0.59
920	0.62
921	0.64
922	0.61
923	0.61
924	0.57
925	0.53
926	0.5
927	0.42
928	0.35
929	0.28
930	0.23
931	0.14
932	0.11
933	0.08
934	0.08
935	0.09
936	0.09
937	0.11
938	0.11
939	0.14
940	0.15
941	0.15
942	0.17
943	0.17
944	0.18
945	0.22
946	0.21
947	0.19
948	0.22
949	0.22
950	0.21
951	0.19
952	0.17
953	0.18
954	0.18
955	0.19
956	0.16
957	0.18
958	0.22
959	0.22
960	0.24
961	0.22
962	0.27
963	0.33
964	0.43
965	0.49
966	0.5
967	0.59
968	0.65
969	0.72
970	0.67
971	0.6
972	0.51
973	0.41
974	0.36
975	0.28
976	0.2
977	0.11
978	0.13
979	0.13
980	0.12
981	0.11
982	0.11
983	0.11
984	0.1
985	0.1
986	0.07
987	0.07
988	0.08
989	0.1
990	0.12
991	0.12
992	0.13
993	0.14
994	0.16
995	0.19
996	0.26
997	0.31
998	0.35
999	0.38
1000	0.41
1001	0.42
1002	0.41
1003	0.38
1004	0.29
1005	0.25
1006	0.19
1007	0.15
1008	0.11
1009	0.09
1010	0.08
1011	0.07
1012	0.06
1013	0.04
1014	0.04
1015	0.04
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.09
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.11
1023	0.16
1024	0.16
1025	0.18
1026	0.18
1027	0.17
1028	0.18
1029	0.18
1030	0.19
1031	0.2
1032	0.23
1033	0.25
1034	0.26
1035	0.25
1036	0.26
1037	0.25
1038	0.24
1039	0.18
1040	0.14
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.08
1047	0.08
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.11
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.08
1058	0.07
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.07
1066	0.06
1067	0.07
1068	0.1
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.11
1072	0.14
1073	0.19
1074	0.21
1075	0.23
1076	0.2
1077	0.2
1078	0.22
1079	0.27
1080	0.3
1081	0.27
1082	0.27
1083	0.26
1084	0.26
1085	0.25
1086	0.23
1087	0.18
1088	0.11
1089	0.1
1090	0.08
1091	0.06
1092	0.05
1093	0.05
1094	0.05
1095	0.04
1096	0.04
1097	0.04
1098	0.03
1099	0.04
1100	0.05
1101	0.05
1102	0.07
1103	0.07
1104	0.08
1105	0.09
1106	0.1
1107	0.08
1108	0.08
1109	0.11
1110	0.11
1111	0.11
1112	0.11
1113	0.16
1114	0.21
1115	0.23
1116	0.24
1117	0.21
1118	0.2
1119	0.21
1120	0.22
1121	0.19
1122	0.14
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.1
1128	0.08
1129	0.06
1130	0.05
1131	0.06
1132	0.06
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.06
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.12
1146	0.16
1147	0.17
1148	0.25
1149	0.31
1150	0.36
1151	0.43
1152	0.49
1153	0.52
1154	0.59
1155	0.65
1156	0.66
1157	0.7
1158	0.73
1159	0.7
1160	0.7
1161	0.71
1162	0.66
1163	0.64
1164	0.56
1165	0.47
1166	0.41
1167	0.38
1168	0.32
1169	0.23
1170	0.18
1171	0.14
1172	0.13
1173	0.13
1174	0.13
1175	0.14
1176	0.13
1177	0.15
1178	0.18
1179	0.19
1180	0.27
1181	0.29
1182	0.36
1183	0.38
1184	0.38
1185	0.37
1186	0.35

A0A4S2N356

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer