Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DEF5

Protein Details
Accession A5DEF5    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-90LPRTLRRRAASHNVKRIPKRLRNRALREMHQSSHydrophilic
100-120KPGVRGRKLYRLKMSRKLLKLBasic
540-559SKSVHDKLPQSKRKDYRQFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-123RRRAASHNVKRIPKRLRNRALREMHQSSAGASGPSATKPGVRGRKLYRLKMSRKLLKLAAK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 6, cyto 5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG pgu:PGUG_01656  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MPPKSARVIRSENADPSLKDGVLSVPEFVASREFEIKSMEQAQLNSKYASSTRVFQSLPRTLRRRAASHNVKRIPKRLRNRALREMHQSSAGASGPSATKPGVRGRKLYRLKMSRKLLKLAAKLRMLRQLPSEGSGTVRERIKSLSKQIEDIRKESSSDSKPILNNDMGSCDIVGENKLASPPPGRRYAKRQLRFVWTPTHIWHAKRFHMIKQWGFQIPQRPTQKCYRATNRAARTGAIAHETSYYGTMVAKSSNVQALVAKLTNRIGEPSQKTYHGWIYAPHKVTKGLVWCFESSVMIRVHPAVFTEVFEFVQSNSDTIYDCRYALGSLELAGPRALSCLSRVVHVENGPSSTKWLQISRYNCDSVPVGTTFVLGMKDPRFWKHSRRPPVSEPQPSLPDLIISMSSSDATSTTDAPHAAALLSSELRNNSYKNQHTTKQLSDQFQRTSPLANSIAKFVIDSSPSIPIFVTKTATTWCVICPWFWILPLWIKLVSVPEVHVGGAKQLHQINYERGHPTFPTDYPFLAQGWSENLVRSTVSKSVHDKLPQSKRKDYRQFENTVDPFGCDWFFLQKIIFGTKLHPSVSDGVAYGLFDAFTAREIHSMNDLFLAIEDSRLSQDHNKVLIELFDKNNSFHQQFAAGTYKVEPIFPPLPVHQIKLELINKGTISDHARIYRVPRSLLNAYRNGTCADKPDLKELIGFVTSGAYNLKLGNCTGIGCISADHKDKYVLVRNSGETLTRLAIWSKTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.41
3 0.38
4 0.39
5 0.31
6 0.26
7 0.23
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.18
12 0.14
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.13
18 0.16
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.25
23 0.25
24 0.27
25 0.3
26 0.29
27 0.27
28 0.28
29 0.35
30 0.36
31 0.38
32 0.33
33 0.3
34 0.29
35 0.28
36 0.31
37 0.27
38 0.26
39 0.27
40 0.31
41 0.31
42 0.32
43 0.41
44 0.44
45 0.48
46 0.52
47 0.55
48 0.55
49 0.63
50 0.65
51 0.62
52 0.62
53 0.66
54 0.68
55 0.72
56 0.78
57 0.78
58 0.8
59 0.82
60 0.82
61 0.82
62 0.81
63 0.82
64 0.83
65 0.85
66 0.87
67 0.89
68 0.89
69 0.87
70 0.83
71 0.82
72 0.75
73 0.66
74 0.58
75 0.49
76 0.39
77 0.33
78 0.28
79 0.18
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.14
85 0.11
86 0.12
87 0.16
88 0.26
89 0.34
90 0.36
91 0.44
92 0.49
93 0.59
94 0.66
95 0.71
96 0.72
97 0.72
98 0.77
99 0.79
100 0.82
101 0.8
102 0.76
103 0.74
104 0.7
105 0.68
106 0.68
107 0.65
108 0.63
109 0.6
110 0.59
111 0.57
112 0.59
113 0.53
114 0.47
115 0.43
116 0.41
117 0.36
118 0.34
119 0.32
120 0.24
121 0.24
122 0.26
123 0.25
124 0.24
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.28
129 0.34
130 0.35
131 0.42
132 0.46
133 0.44
134 0.49
135 0.55
136 0.6
137 0.56
138 0.52
139 0.48
140 0.39
141 0.39
142 0.36
143 0.37
144 0.32
145 0.32
146 0.33
147 0.33
148 0.34
149 0.36
150 0.39
151 0.32
152 0.3
153 0.26
154 0.26
155 0.21
156 0.2
157 0.16
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.15
169 0.21
170 0.25
171 0.35
172 0.39
173 0.43
174 0.52
175 0.6
176 0.66
177 0.67
178 0.7
179 0.66
180 0.7
181 0.69
182 0.64
183 0.61
184 0.53
185 0.49
186 0.43
187 0.45
188 0.4
189 0.38
190 0.43
191 0.4
192 0.41
193 0.47
194 0.48
195 0.45
196 0.51
197 0.55
198 0.51
199 0.5
200 0.51
201 0.45
202 0.44
203 0.42
204 0.42
205 0.39
206 0.44
207 0.48
208 0.45
209 0.47
210 0.54
211 0.6
212 0.58
213 0.64
214 0.64
215 0.65
216 0.71
217 0.76
218 0.72
219 0.7
220 0.64
221 0.54
222 0.46
223 0.39
224 0.32
225 0.25
226 0.2
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.14
254 0.14
255 0.2
256 0.23
257 0.27
258 0.29
259 0.29
260 0.3
261 0.31
262 0.32
263 0.26
264 0.23
265 0.22
266 0.25
267 0.31
268 0.32
269 0.31
270 0.29
271 0.28
272 0.28
273 0.26
274 0.27
275 0.23
276 0.22
277 0.23
278 0.22
279 0.22
280 0.22
281 0.2
282 0.13
283 0.15
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.12
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.06
316 0.06
317 0.08
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.12
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.12
341 0.14
342 0.15
343 0.17
344 0.18
345 0.23
346 0.27
347 0.29
348 0.32
349 0.3
350 0.28
351 0.28
352 0.25
353 0.2
354 0.18
355 0.13
356 0.11
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.12
366 0.13
367 0.16
368 0.2
369 0.22
370 0.32
371 0.4
372 0.48
373 0.55
374 0.6
375 0.64
376 0.65
377 0.73
378 0.71
379 0.67
380 0.6
381 0.53
382 0.49
383 0.43
384 0.39
385 0.28
386 0.2
387 0.14
388 0.11
389 0.08
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.16
418 0.23
419 0.27
420 0.33
421 0.37
422 0.39
423 0.45
424 0.48
425 0.46
426 0.47
427 0.48
428 0.46
429 0.47
430 0.48
431 0.42
432 0.39
433 0.38
434 0.3
435 0.27
436 0.23
437 0.22
438 0.21
439 0.22
440 0.21
441 0.2
442 0.2
443 0.17
444 0.17
445 0.13
446 0.12
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.13
451 0.13
452 0.13
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.14
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.11
465 0.13
466 0.13
467 0.12
468 0.13
469 0.15
470 0.15
471 0.14
472 0.15
473 0.13
474 0.17
475 0.18
476 0.18
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.15
481 0.15
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.09
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.14
493 0.16
494 0.17
495 0.18
496 0.21
497 0.24
498 0.25
499 0.29
500 0.27
501 0.25
502 0.26
503 0.24
504 0.26
505 0.24
506 0.22
507 0.22
508 0.21
509 0.21
510 0.2
511 0.21
512 0.16
513 0.14
514 0.13
515 0.09
516 0.1
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.13
524 0.13
525 0.15
526 0.16
527 0.2
528 0.24
529 0.28
530 0.33
531 0.36
532 0.39
533 0.45
534 0.54
535 0.58
536 0.61
537 0.66
538 0.68
539 0.75
540 0.8
541 0.77
542 0.76
543 0.76
544 0.74
545 0.67
546 0.69
547 0.59
548 0.52
549 0.46
550 0.37
551 0.29
552 0.25
553 0.22
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.13
561 0.14
562 0.16
563 0.17
564 0.14
565 0.17
566 0.21
567 0.24
568 0.22
569 0.21
570 0.21
571 0.23
572 0.23
573 0.21
574 0.16
575 0.14
576 0.13
577 0.13
578 0.11
579 0.07
580 0.06
581 0.05
582 0.06
583 0.05
584 0.06
585 0.08
586 0.08
587 0.11
588 0.11
589 0.13
590 0.17
591 0.17
592 0.16
593 0.15
594 0.15
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.08
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.13
605 0.16
606 0.22
607 0.27
608 0.29
609 0.28
610 0.28
611 0.28
612 0.28
613 0.25
614 0.24
615 0.21
616 0.24
617 0.25
618 0.25
619 0.3
620 0.33
621 0.31
622 0.28
623 0.27
624 0.24
625 0.23
626 0.26
627 0.26
628 0.21
629 0.21
630 0.21
631 0.24
632 0.22
633 0.22
634 0.18
635 0.2
636 0.22
637 0.23
638 0.25
639 0.22
640 0.3
641 0.31
642 0.33
643 0.28
644 0.29
645 0.29
646 0.34
647 0.35
648 0.3
649 0.29
650 0.3
651 0.28
652 0.26
653 0.26
654 0.21
655 0.23
656 0.23
657 0.27
658 0.27
659 0.28
660 0.3
661 0.34
662 0.37
663 0.36
664 0.36
665 0.33
666 0.38
667 0.44
668 0.49
669 0.51
670 0.5
671 0.49
672 0.48
673 0.47
674 0.42
675 0.37
676 0.31
677 0.29
678 0.3
679 0.35
680 0.35
681 0.4
682 0.41
683 0.38
684 0.38
685 0.34
686 0.29
687 0.22
688 0.2
689 0.13
690 0.13
691 0.13
692 0.12
693 0.13
694 0.1
695 0.1
696 0.13
697 0.14
698 0.13
699 0.14
700 0.16
701 0.15
702 0.15
703 0.15
704 0.14
705 0.13
706 0.11
707 0.12
708 0.13
709 0.19
710 0.22
711 0.23
712 0.24
713 0.26
714 0.28
715 0.35
716 0.42
717 0.4
718 0.42
719 0.45
720 0.45
721 0.46
722 0.45
723 0.39
724 0.31
725 0.28
726 0.24
727 0.2
728 0.2
729 0.19